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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name APA2
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -535 -88
>APA2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ACTTGATTTAAATTACAATTTAATTTATTCAATAATGGGAAATTTTCTGGTGAATATATC
ATATAATCTAAATCAGGATTAATCACTCTAAAGTATGCTAATAATTCCTCTAAATAAATA
TCTAACGGGAATTTATTATATAAATTGACCACTGTTTGTATATGATTTGATTTAAGGATA
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AAGGATTTCACAAGTAATGTTAAAACAATACTACCTGATTTACAAAATGTGTTCTCTAAA
AATTGAAAATTATCAATCATCCATTGAAGTAGTTTTAATTGTAATGAGATAGATAATTGT
TTTGATTTGAATTTCCGATTACCTTTAAAATAAACTCGACTAACACCAATTATACTTATT
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TTTATTATTTCTTCATTAGATGACATATTTGAATTGATAATGAATTGGGAGGGGGAGGGG
GGGGGAAGGTTTGTTTATATTTGGTAGTGTTGTTTATATTTTGTTTGTGTGTTTTGTTGC
ACACACGCACACACACACGCACACACACTAAATAAAAAATTTGACATCACCAAATTCAAC
GAGAAAAACTTTCCAATGGTATTCTCTTTTTTTTGCAATTTTCATTTTCTTGTATATCCA
CCCATTCATTTAACAATTACATTAAACACATTTGGAAATT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -232 -722
>APA2	Upstream Sequence Complementary Strand
TGAACTAAATTTAATGTTAAATTAAATAAGTTATTACCCTTTAAAAGACCACTTATATAG
TATATTAGATTTAGTCCTAATTAGTGAGATTTCATACGATTATTAAGGAGATTTATTTAT
AGATTGCCCTTAAATAATATATTTAACTGGTGACAAACATATACTAAACTAAATTCCTAT
AACTATCATACTATTTAAAGGACTAATATTTTGCACTAATAGACTAATGAAAAGTCATGG
TCACTTAAATTATGATTTTAATAATTAACTCTATAACCTGGAGAACTTTTAAGTATTAGA
TTCCTAAAGTGTTCATTACAATTTTGTTATGATGGACTAAATGTTTTACACAAGAGATTT
TTAACTTTTAATAGTTAGTAGGTAACTTCATCAAAATTAACATTACTCTATCTATTAACA
AAACTAAACTTAAAGGCTAATGGAAATTTTATTTGAGCTGATTGTGGTTAATATGAATAA
TAAAACTTTTTATGTAGTTAACTATTTAGTACTAATCCATAATTTGTAAGTAGTTCATTA
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TTACCAAGCCTATAAGGTAAAAACCAATTTAAACGTTCAACTAAGTTACAACAAAGTAAT
AGTCGTGATAGTAGTAGACAAAACAAAAACAAAAACAAAACCAAGTTAGATGGATTATTT
AAATAATAAAGAAGTAATCTACTGTATAAACTTAACTATTACTTAACCCTCCCCCTCCCC
CCCCCTTCCAAACAAATATAAACCATCACAACAAATATAAAACAAACACACAAAACAACG
TGTGTGCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGATTTATTTTTTAAACTGTAGTGGTTTAAGTTG
CTCTTTTTGAAAGGTTACCATAAGAGAAAAAAAACGTTAAAAGTAAAAGAACATATAGGT
GGGTAAGTAAATTGTTAATGTAATTTGTGTAAACCTTTAA
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