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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name HLJ1
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -897 -846 -436
>HLJ1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCATTGCTAATTAACTGCTTGGCCTTTTTTTGTGCTAAAGCGTACTGACCTTCGTAATTC
CAGTCGGTGTCAACAAACTTAAAATAAGCTTCAGACACTAATGCCAATAACGGAATCTCA
TAAAGTATAGTGTCATTCCACTTACCGACAATTTCCAATTCGAAGTCCCCTTCATCATTA
TCCAAATATTTGATCTGGGACGATGGGACTAATTTGAAGTCCGCCAAATATTCTAAATAG
TCTGATGGCAATTGCGGCAATACTCTATGCAAATACAAAATCTCTTCTGCAGAAAATCTT
AAATCACCCAAATACTCGATTTGCTTTTTCAACCACGATATGGCTTGGCTATTTAACTTC
AATTGAGGAGTTCTATTGGTATACCTGTATTTCACTGGGACATCAGGAAACTGTTTGTTG
ACCGCTGCATGCATAAACAATTTGTATAAATCGGTATCCAAGAAGGATTTGATGACTGGT
TTATCTTCAGTTCCATTCATGGTCAATAACTATAGCTTGCCTCGGCAAATGGTATTCGAT
GAAGTAACTGAAAAGTATAAATTGCCAATAAAAAAAAAACGTTGAACTTTTGATAAACCT
AGTTCGGCACGAGCAGGCAGAAAAAAACGAATCCAGCCAGAATGCTAAAAAGAGGTGAGC
TCTGGACCCAAATAGGAAGGAAAAACAAAGTCCAAGTTTGAACATGTTCTCCTACCCAAC
AAATAATTGGTACTTGGGTGTTGTGCGTTATGTGACATTGACGATATAAACTATGCCAGT
TGTTTGTCGGATTTTCGGTAGAGAAGCTCAAGTTTACCTATTTTTGTAAAGTTTTGGGTT
TTTTCAATGATAACACCTAATGATTTTTTTCCCCTCGTAATGTAATACTTGCGAATATTG
AAAATTAAGACTAAAGGGAAATTTTTTTTTTTTGTTTGGTTTTTCTCTAGATTCTTCCAC
TTGACATAACAAGTGTTCAATATATTTCAAACATTCCGTC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -270 -621
>HLJ1	Upstream Sequence Complementary Strand
AGTAACGATTAATTGACGAACCGGAAAAAAACACGATTTCGCATGACTGGAAGCATTAAG
GTCAGCCACAGTTGTTTGAATTTTATTCGAAGTCTGTGATTACGGTTATTGCCTTAGAGT
ATTTCATATCACAGTAAGGTGAATGGCTGTTAAAGGTTAAGCTTCAGGGGAAGTAGTAAT
AGGTTTATAAACTAGACCCTGCTACCCTGATTAAACTTCAGGCGGTTTATAAGATTTATC
AGACTACCGTTAACGCCGTTATGAGATACGTTTATGTTTTAGAGAAGACGTCTTTTAGAA
TTTAGTGGGTTTATGAGCTAAACGAAAAAGTTGGTGCTATACCGAACCGATAAATTGAAG
TTAACTCCTCAAGATAACCATATGGACATAAAGTGACCCTGTAGTCCTTTGACAAACAAC
TGGCGACGTACGTATTTGTTAAACATATTTAGCCATAGGTTCTTCCTAAACTACTGACCA
AATAGAAGTCAAGGTAAGTACCAGTTATTGATATCGAACGGAGCCGTTTACCATAAGCTA
CTTCATTGACTTTTCATATTTAACGGTTATTTTTTTTTTGCAACTTGAAAACTATTTGGA
TCAAGCCGTGCTCGTCCGTCTTTTTTTGCTTAGGTCGGTCTTACGATTTTTCTCCACTCG
AGACCTGGGTTTATCCTTCCTTTTTGTTTCAGGTTCAAACTTGTACAAGAGGATGGGTTG
TTTATTAACCATGAACCCACAACACGCAATACACTGTAACTGCTATATTTGATACGGTCA
ACAAACAGCCTAAAAGCCATCTCTTCGAGTTCAAATGGATAAAAACATTTCAAAACCCAA
AAAAGTTACTATTGTGGATTACTAAAAAAAGGGGAGCATTACATTATGAACGCTTATAAC
TTTTAATTCTGATTTCCCTTTAAAAAAAAAAAACAAACCAAAAAGAGATCTAAGAAGGTG
AACTGTATTGTTCACAAGTTATATAAAGTTTGTAAGGCAG
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