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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name MSH3
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -869
>MSH3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTGGTTTTAGATGAAAAAACTTGAATTTTAGTTGCTGAGGCAATAGCAAAATCATTAGGT
GTTGTAGGATTGAATTCAATACTGGTTATCGGATGATTTTCTTTAATTAATTGAGGAGTT
ATATAACTTCTCCAATATCTTTGTTCAGGTGTTGTTTTGGATGGTAAAGTTGGAGCCCTA
GCTTGTGGAAGATCCTGTTTAGTAGATGACATGGCTGATAGAACTCTTTGACTAATTTAT
AGTATTGATTAGATGTAAATGAGTGAATGAGTGAATGGAATGAAAAAAAAAAAATTTGGA
TTGGACTGTACTAAACTCATCGCACACACACGCCATTAAGTCAAAAAGAACAACCAAAAA
TGATTGTAATAAATTGTCAACACTCACACGACTGACCGACCAACTGACCAACCAACTACA
TTGATTGATTGAATAATGTTACAAGTGTGTGGTGGAGTTTATAATCTTTAATAAATGGAA
GGTTATACAATATGTAGATTAAAGAATTGATAAGATTGATTGGAATTTATAATGTAAAAA
GTGTAGTAGTTTTGTAATTACCTGACTCTTGAAAACATATCTGTAAAATTTTTCATTGAA
TTTTTTTGCAATTATTTAGTGAAAAATATCAAACATAGTTTTATACCATAATTTATAGTA
TTACTATGTACCTATACAATAATAAATAAATGTTCAATACTTAATAGAAAAGTATTTCAA
ACAAACAAATAACAATTGAGTTAACTATCAGTCTTACTATATGATAAAATTGTATTGCAA
AACACGTTTTGGAAATTAGATTAACGTTGCGGCCCAAACTCAACTTAACTTAACTCAACT
CAACTCAACTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTAAATCAACAATTTAAAACAATCCTTTTAT
TCTTGTAGTTTTATATTTATTATTTCATAATTCATCCTTTCTTCATTACCCTCCGTTTAT
TCCCTCCTCCCATCTCCCTTCTATAGATTGGAAAGAATTC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -9 -477 -696
>MSH3	Upstream Sequence Complementary Strand
GACCAAAATCTACTTTTTTGAACTTAAAATCAACGACTCCGTTATCGTTTTAGTAATCCA
CAACATCCTAACTTAAGTTATGACCAATAGCCTACTAAAAGAAATTAATTAACTCCTCAA
TATATTGAAGAGGTTATAGAAACAAGTCCACAACAAAACCTACCATTTCAACCTCGGGAT
CGAACACCTTCTAGGACAAATCATCTACTGTACCGACTATCTTGAGAAACTGATTAAATA
TCATAACTAATCTACATTTACTCACTTACTCACTTACCTTACTTTTTTTTTTTTAAACCT
AACC
TGACATGATTTGAGTAGCGTGTGTGTGCGGTAATTCAGTTTTTCTTGTTGGTTTTT
ACTAACATTATTTAACAGTTGTGAGTGTGCTGACTGGCTGGTTGACTGGTTGGTTGATGT
AACTAACTAACTTATTACAATGTTCACACACCACCTCAAATATTAGAAATTATTTACCTT
CCAATATGTTATACATCTAATTTCTTAACTATTCTAACTAACCTTAAATATTACATTTTT
CACATCATCAAAACATTAATGGACTGAGAACTTTTGTATAGACATTTTAAAAAGTAACTT
AAAAAAACGTTAATAAATCACTTTTTATAGTTTGTATCAAAATATGGTATTAAATATCAT
AATGATACATGGATATGTTATTATTTATTTACAAGTTATGAATTATCTTTTCATAAAGTT
TGTTTGTTTATTGTTAACTCAATTGATAGTCAGAATGATATACTATTTTAACATAACGTT
TTGTGCAAAACCTTTAATCTAATTGCAACGCCGGGTTTGAGTTGAATTGAATTGAGTTGA
GTTGAGTTGAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAATTTAGTTGTTAAATTTTGTTAGGAAAATA
AGAACATCAAAATATAAATAATAAAGTATTAAGTAGGAAAGAAGTAATGGGAGGCAAATA
AGGGAGGAGGGTAGAGGGAAGATATCTAACCTTTCTTAAG
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