C.glabrata - PathoYeastract

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Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

SHM2

Promoter Sequence

Consensus
WTWHNGCTGW: -349

>SHM2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCCTAGAGTCCATCTCCCAGTTACAATGGTACATGGATCATTATTTGAAGAGCGAAGAAG
AGACCAAAGAATTCGTGGAGTCACAAAATGAGAAAAGACCTTCTGAGGAGCCTATAGATC
AACCACAGAAGAAACAATGTCAATAAAATGCTACTGCTACATATATTTTATAGTTCTAAT
AGTGTAATTGCTTGCCCTTTTTCATATTATAGAGAAGTCAATAACCCTTTTCGACAATAT
AAGCACTAAAACCAAGAGCAAATTATAATTAAATAAAGCTAAAATATGACCAACATTAGT
TTCAAGATGAACCCATCGATGGTATCGCCCACCATTGTGTATTTGGGTATGACATTATGG
TGCATAATATAATGGTGGGGTGTGTTAAAAGGACAACACACCTTCCACGTGAAATGTGTA
CAAGCGAAGTCTCGAAGGGAATAAATTGCAAAGAGTCAAACTCATTCTTCATTCACATTA
TTTGCAAGTGAAAAAAAAATTGTGAACTGATTGTGATTGTCTTCGAGAGATGATCCAATG
GAAGTGATAAATTGTCTCTGTCTCAAGGACTTCGAGAGAATCAGTCACTTGTTATCATCA
TAAGTGAGTTCACGAAAAGAATTAAAAGAAAAATGGCTGTGTGATGGAGTCATTTTGCTG
TAGTTTAACTGTGGGCCATATAGGTCTCCCTTTTATTATTTGCCCTGCTTTGCAGAAAAA
TTTAAGTGATACTGTGTATGTGTAAAGTGTAATAACTTGACTGTGTTTCTCTCATTAATT
GTGTAATTAGCTTTGGATTGGCAGAATTAGTATTAATTTCGATTAATAAATTAGTTTTAT
TGAATTAAAAAAAAAAAAATTATATATAAAGGTTAGTGTTTTAAATTTGTGAAACAAGTC
TGAAACTACTCTAGCCTTAATTGTAGAAAGAATCGACCATAGATTTATTATCGTTCCCGG
AACAATCTAACAACCCCACAAGCTCTTAATATAACCAATC

Promoter Sequence
Complementary Strand

No match found!

>SHM2	Upstream Sequence Complementary Strand
AGGATCTCAGGTAGAGGGTCAATGTTACCATGTACCTAGTAATAAACTTCTCGCTTCTTC
TCTGGTTTCTTAAGCACCTCAGTGTTTTACTCTTTTCTGGAAGACTCCTCGGATATCTAG
TTGGTGTCTTCTTTGTTACAGTTATTTTACGATGACGATGTATATAAAATATCAAGATTA
TCACATTAACGAACGGGAAAAAGTATAATATCTCTTCAGTTATTGGGAAAAGCTGTTATA
TTCGTGATTTTGGTTCTCGTTTAATATTAATTTATTTCGATTTTATACTGGTTGTAATCA
AAGTTCTACTTGGGTAGCTACCATAGCGGGTGGTAACACATAAACCCATACTGTAATACC
ACGTATTATATTACCACCCCACACAATTTTCCTGTTGTGTGGAAGGTGCACTTTACACAT
GTTCGCTTCAGAGCTTCCCTTATTTAACGTTTCTCAGTTTGAGTAAGAAGTAAGTGTAAT
AAACGTTCACTTTTTTTTTAACACTTGACTAACACTAACAGAAGCTCTCTACTAGGTTAC
CTTCACTATTTAACAGAGACAGAGTTCCTGAAGCTCTCTTAGTCAGTGAACAATAGTAGT
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AAATTCACTATGACACATACACATTTCACATTATTGAACTGACACAAAGAGAGTAATTAA
CACATTAATCGAAACCTAACCGTCTTAATCATAATTAAAGCTAATTATTTAATCAAAATA
ACTTAATTTTTTTTTTTTTAATATATATTTCCAATCACAAAATTTAAACACTTTGTTCAG
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TTGTTAGATTGTTGGGGTGTTCGAGAATTATATTGGTTAG