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Locus Information
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| Standard Name |
Uncharacterized |
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| Systematic Name |
PAS_c034_0002 |
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| Alias |
PP7435_Chr4-1020 |
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| Strain |
GS115 |
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| Description |
contains GLEYA adhesin domain |
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| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
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Gene Sequence
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Hide Seq |
>PAS_c034_0002 size 3105
ATGCAGAACACGAATGATAAACTGATCATTCGGACATTCTATTCCATTTCAACAATACAT
GGCCTGTTGTCCATCAATATTTTCTCAGATACAAGAGTATATAAATTTGCCATCTATTCC
ACCGATGCTGTTTCCCTAGAGCCAAGAACAAAGAACAACATGAGTTTAGTGACAGTGCTA
GCCTGCTTTATCATATTTGCAGCGCACGCATTCGGACAAGATACGTTTTATATGCTTAAG
GTTCGCACTCTCACTCCAAATGGCTATCCTCTAGCTGATAGTTTGTCAAACCCCATGCAA
TATTGGGACTTGTATTATGTTCCTGGTGGTCCTCGTCGGTTAGAATCCAGCTTCGTTAAT
TGGCAACCAACCACGGCAGCTCCCATTAACCAATTCTATTGTAGGCTCGGTACCGATGGA
CACATGACAGGTTATAACCGTGTTACTGGTTCAGTAATAGGAAAACTGTCATTCGGCACT
AATGCAGCAACTGCATTAGCATTTGGAAGCTATGATGGGGATCCGTCTTACCCCCCACAG
GCTTTCAGCATAAGCAGCTCGGTATCCGGCACAATGACATACCTAAATGTTCACTACGTA
AATGCACGAAGCATAACCTGGTATTCAACAACCACAGCAACAGGTGAAACAAATGTTTAT
ATCAATGTAGCGAGTACAGGATACACCGGCGATAGAACGACATATCAAGCAGAGCTTTGG
GTGGAACCGTTTGTTCCCAACATACCGGTTGATACCACTACATCTATTTGGACTGGTAGT
CAAACTTCTTATACTACTGAGGTTGGTGAAAATGGAGGCAGCACAGTCATCGAGTTAATT
CCTACTCCGCCGGCTGATGCCACGTCGACATGGACTGGTACTTACACTACAAGGACCACA
GACGCGGACGGATCAGTTATTGAACAGATTCCTACTCCCTCAGCTGACACCACTTCTGTA
TGGACTGGTACTTACACCACTTGGACCACTGATGCTGACGGATCAGTTATTGAACAGATT
CCTACTCCCTCAGCTGACACCACTTCTGTATGGACTGGTACTTACACCACTTGGACCACT
GATGCTGACGGATCGGTTATTGAACAGATTCCTACTCCATCTGCAGACACTACTGCAACA
TGGACGGGTACTGAGACTTCGTACACTACCGATGTTGGTGAAGACGGAAGCAGCACTGTT
ATTGAACTTGTGCCTACTCCATCAGCTGACACTACTGCCACCTGGACTGGTACTGAGACT
TCGTACACTACTGATGTTGGTGAAGACGGAAGCAGCACTGTTGTTGAGCTTGTTCCTACT
CCATCCGCTGACACTACTGCCACCTGGACTGGTACTGAAACTTCGTACACTACTGATGTT
GGTGAAGACGGAAGCAGCACTGTTGTTGAGCTTGTTCCTACTCCAACTCCATCTGCCGAC
ACTACTGCCACATGGACCGGTACTGAAACATCGTACACCACCGATGTTGGTGAAGATGGA
AGCAGTACTGTTATTGAACTTGTTCCTTCTGATACTGAAACTGCTACTAACATTGTTGAA
ACACCAGTTCCTAGTTCGGGAGTCAGTGACGGAGTTTCTGTGTTTGACGGCTTTAATGTT
GAAGTGTTCCACTATCCCGCTGACAACTACGAGCTTGCCAATGAGATCGGTTTCCTGAGT
TATGGCTATGAGAACCTGGGATTGGTGACAAATGCTACTGGCGTCAGCGACATTAACTTT
GACACGGATTCAAACTGGCCTTATTATATTGACAGAGATGCTTTGGGTAATACCGGATCA
TACGTTAACGCAACCATAGAGTATGAAGGATTCTTTAGAGCTCCAGTGGATGGTGAGTAT
GTCTTTTCGTTCAGCAACACTGACTACAATTCAATTTTGTTTGTGGGCAGTCCTGCTGCT
GCCGGCCAGGCTTTGCAAAAGCGTCGGGTGCAATTCTTAAAACCTGAAACAAGTCCAGAC
CATGTTTTGTTATTCAACAACACTAGAGATTTGGGGCAGACTATAAGCACTACACAGTAC
CTCTTAGCTGACCAGTACTACCCTCTACGAGTTGTGATTGCCGCGATATCACAGCACGCT
TTGCTAGACTTCCAAATCAAACTACCAAATGGCGCCTTGTTGACTCAGTACCAAGGGTAC
GTTTACAACTTTGCTCTCGAGGGATCCGAGTCGACCACGGTTATTGGTGACAAAACTTCC
ACTTGGACTGGTAGCTACACTACATGGACCACCGACTCTGATGGAAGCACTGTTGTAGTT
GTGCCATCAGCTACGATTACTGCCGATAAGACCTCCACTTGGACTGGATCATACACCACA
TGGACTACAGATTCTGATGGTAGCACCATTGTGATTTGTCCTTCAATCACCAGTGATCAC
AACGACAAGCCCAGTGAGAGCACCTTGACAGACGGTAGTATTTCAACTACTGTTGTGACG
GTGACCAGTTGTGACATTGAAAAGTGCACCAAGACTACTGCTCTGACTGGTGTCACAGAG
ACAACTCTCACGACCGGAGGTACGACTACGGTTGTAACTACCTACTGTCCTTTGCCAACC
GACATTGTCACTGTGAAGACAACAAGCATTAGTGGAAGTGAGGTTCTGCAAACAATCTAT
ACGGCAAAACCTAGCCACGTTGTGCCAAATGTCCATACTTTGACTGTTACAATCACAAGA
GAAGTATGCGATGCTTTCACCTGCACTCAAGCTACTATTGTGACTGGAGAGATTCTGAAG
ACCACCACTCTTGCAGATACGCATTCTACAACCGTGGTACCGGTGTATGTTCCTCTGGAA
AGCTATCAATCGGCAGTTGAGCTGAGCACTCTCGAAACGGTATTAAAGTCATCCGACTTT
GCCAGTGGATCGGCCGTAACGGCTGGATCAGCCCAGCCATCGTACCAATCTGGTGGGGTA
GCAGAAAGCAGCCTGACAGGTTCCGAGCTTGAGGCTCACAGTACATCTGACACAGTCTCT
CAACCTTCAACTATTTCCCCGCAAACTGGAGAAGCAAATGCCCTGAGATGGTCATCGTTC
TTTGGAGCAGCTTTGGTTCCGCTGGTTAACGTGTTCTTCGTTTAG |
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Promoter Sequence
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>PAS_c034_0002 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATCTTGAGTGGGGCTGTAAAAAAAAGAGTTTCAATAATGCCAGCTCTGTATGTTTTGAAT
CTGTGGTATTGAACAGAGAACATTACTAATTTAAGTTTATGCAACCATCTAAATTGGTTG
CTGTTGATTCTTAGTTGCCTATTTCGTTTGTGCAAGCAAAAGAAATGATAGTTCTGAAAT
TCTCAAATTCTTGCGCTTAAAATGGCGCGCATATAGAAATGGGCTAGTTTGATTATAGTT
TAAGTGCAGCAGCAAATATCATCAATCAATGACTTTGAAACTTTTTTATCGTAATGAAAT
AACAGATATCTTCGTAACGGATATATCAACTACCTATCTTGTAAAAAGTAAAAAAAGTAA
AATGAATATGTTCTCAGATTTGGCTCTACTAGATATGGCAGCATTTAGAGTATTTACTAA
GGTGTTAATATTTATTACAACGTTTTTGTCATCAAGGGCATGATTCATGCAGCTAGCCAC
AATTGTCATCCCTTTCATTTGGGTCTGACCTATTTCAGCTAGGTTGCATAATGTGCAACA
TGTACCCAACTAATACTGCAGATTCAAATAAACACGGGCTATGCCAAGCATAACACACGA
GTGCAGCTAATAGTAAGAAGTAACCTAAGCCTGTGACGCGGTTCACGATTAACGTAAAAT
ATCTTGAAATTCCAAATGTTGATATTAGACCCGACTTTTAGAAAACAAAGTGATTTTAAT
AATGTTGGCGACCTAATAGCAATTGATCAAAATTTCAGGCTATTCAATTTGTTTCATTAA
TCCGGCTAAGTATGTGTGGAATTACACTTGGCTACCTACTGGAATTTTGCAATAGGGACA
CATCCTACACGTCATTTATTATTTTGGGAATATATAGCAAAATTTAGGTCTTGTTTGCGA
TCATTTTCGGTCCCATTTTCATATCTGGGCCTAGTTTGGTAAATTAATGCTGCACTCTTA
TGCAAGGTGATTCTGGCTTTTTATCACGCTATACGATTTC
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| Chr coordinates |
Chr contig34 from complement(2335..5439) |
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