|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
Uncharacterized |
|---|
| Systematic Name |
PAS_chr1-1_0168 |
|---|
| Alias |
PP7435_Chr1-0478 |
|---|
| Strain |
GS115 |
|---|
| Description |
Vacuolar membrane protein that transits through the biosynthetic vacuolar protein sorting pathway |
|---|
| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>PAS_chr1-1_0168 size 3855
ATGATCATCCTGCTCCCCCTACTTTTCCTGTTTGTGGCCGGTCTGGTACAGGCTACAAAG
GTTCACGAAGCTGGAATTTGTGCTTTGAGAGGAAATTGTGGCAAAAAGAACTTCTTCGGT
TCAGAATTGCCCTGTCCTGATAATACGTTCTCTACGCCATCCTCCCCAGATGATTTTGAC
CTACTTGAACAAATATGTGGTAAAGAGTTTGCTGATATAAATACTTACACGTGTTGTGAC
ACTTCTCAACTGTTGAATTTGCAAAAGCAACTGAAAAAGGTTGATCCTATCATTGCTTCA
TGTCCAGCATGCCGCAGTAACTTTTATACCTTGTTCTGCTCATTCACATGTTCTCCAGAT
CAATCTCAGTTTGTCAATGTTACGGACACGGTAAAGTCCACCACTGGAGAGGATGCGGTG
AGTGAATTGGACTACTACATCCAAAGCAGTTGGGCAGAGGAGTTTTTCAATTCTTGTAAG
GATATCAAGTTCGGAGCATCGAACGGGTATGCCATGGACTTGATTGGAGGTGGCGCTAAG
AATTACTCGGATTTTTTGAAATTCTTAGGTGATGAAAAGCCTTTATTGGGGGGTTCTCCC
TTTCAAATCAATTTTCAATATCCGTCCAATTCAACCCCTCAATGGGTTGAATACCCCGAT
AACCCTGTGAGAGCCTGTAACGATAGCAATCCAGATTATAAATGTGCATGTTCCGATTGT
CCAGGATCTTGTCCAGTTCTTCCTAGTCGACACGCTCCAAAACAGTGTCGTGTGGGTATT
CTTCCTTGCTTTTCATTTGCCGTTGTTGTGCTTTATGCAATTGTCCTTTTGGGATATATT
GCTTACAAAACCTCACGATATACCAAATCCAGGACCAGCTTACTTTTACATGATGATCTG
GCTTTGGATGAATCTAGGTATGATTACAGCTCCGAAGACGAACAGTTTTTTAACAATGAG
TTTGAATATAACTCTTCTTATTATCCAATAAACAGCAAGTTGGAAGAATGGTTCTGCAAG
TTGGGGTTCTTTTGTTCAACCTCTCCCAAAACTGTGATTTTTGTCTCTTTGGTGGTGTCG
TTGACACTTACGTCTTTCATGCGATTCATTGAACTCGAAGAAGACCCTGTTAAATTGTGG
GTGTCTCCGCAAGCCGAAGCATTCCAACAAAAGCAAGTTTTTGATGAAAAGTTTGGACCG
TTTTATCGGACGCAACAGATATTTGTTATCAATGAAACGGGACCAGTGCTCTCTTATGAT
ACCCTAAAATGGTGGTTTGACAAAGAGTCAACCATCCTTTCTTTACAAGCTAATGCATCA
GATTACCAGAGGGAGACGATCACGCTACAAGATCTATGTTTGAAACCTATCAACGATGCC
TGCGTTGTTGAATCATTCACACAGTATTTCGGAGGTGATTCTTCCAGTTTAACTGAAGAT
AATTGGGAGAAGAAACTATCCTCATGTGCCAACAGCCCAGTGAATTGTCTCCCTTCGTTT
CAACAGCCTTTGAAAAAGAGTCTTCTTTTTGGAACTGAACAATTGGAAGATTTTGACATT
CTAAAATCTAATGCGTTAGTTATCACTCTCGTGATGAACAACTCTAATGATGTTAATAGC
ACACAGTTTCAAAATTCTCTAGCGTGGGAAAAAGTATTGGAATCTCACTTGTTGGATCTT
AAAGAGGAATCTGCACAAAGGGGTCTGAAGTTGAGTTTCAGCACTGAAAGCTCCTTGCAA
AAAGAACTTAACAAGTCAACTAACACTGATATCAACATCATTGTAATTTCCTACCTACTT
ATGTTCTTGTATGCTGCAGTAGCTTTAGGGAGCAACGCAATTACCAGAGAATGGAACCTT
ACCTCTCTGGTTCACACCAGATTCACTTTAGGCTTGTCAGGAATTATCATTGTTCTTCTT
TCTGTATCAAGTTCAGCCGGATTTTGGTCTATTTTCGGACTTAAATCGACCCTAATTATA
GCAGAAGTTATTCCATTCTTGGTCCTTGCAATTGGTGTCGATAACATCTTTCTGATTTCC
CATGAGCTCAACACAGTTAACATGAATTATAGCACTGAGAGTATTCCCCTAAGAGTCTCT
AAAGCTATGGGAAAGATTGGGCCTAGTATATTGCTTAGCTCATCTTCTCAAGTGTTCTGT
TTTGCTCTGGCTACGGTTGTTTCCATGCCAGCAGTGAGAAACTTTGCCGCTTATTGTACA
ATGGCTGTGTTATTCAATTGTATTTTACAAACCACGGCATTCGTATCATTGTTAACGCTA
GATCAAATCCGCCTAGAGGATAACAGGTTGGATGTTTTCCCATTTGTAAAAGTTGACAGA
GGAGTTCAATTTGGGAACAACAATAGCCAGGAAGGATTAATAATTGATGAGCTATTGGAC
ACTAGTAATGACAACGTCTTCTCAGAGTTGATTAAAAAGTATTATGCTCCCTTTATATTC
AACAAAAACATAAAGCCTTGCATTTTGGCAATCTTCGGAACGTTCACCATATTTTGTCTT
AGCTTATTGCCAGATGTTCAGTTTGGTTTAGATCAGCGTATTGCATTACCCAGGGACTCA
TTTTTGATTGACTATTTCGATAGTATCTACAATTACTTGGGAGTCGGGCCTCCTACTTAC
TTTGTAGTAGATGGCATGAATGTTACGGAAAGAAGCAACCAACAAAAACTGTGTGGAAGA
TTCTCAACCTGTGATGAATTTTCTTTGGTAAACGTCTTGGAACAGGAAAGAAAACGCTCT
GAAATCTCTACCATTTATGAACCTACTAGCAGTTGGATAGATGACTTTTTCCTATGGTTG
AATCCAGACCTCACGGATTGTTGCAGGTTTCGAAAAGGTACTAACCAGACTGAGATGTGT
CCAATATACGCCCCTTCAAGACAGTGCGAGGTTTGCTACGAAAACCACGAGCCTGGGTGG
AATATTACTATGGAAGGACTCCCTCAAGGCGAAGAATTCATGAAGTATTTTGATATTTGG
ATTGAATCACCTAGTGATCCTTGCCCGTTGGGTGGTAAAGCTCCATATTCAAGTAGTGTC
TTCACTGATGTTAATGGAACAAACGTCGAAAGCTTTGTTTTCCGTACCAGTCATGTTCCT
CTTAGATCACAAAATGATTTCATAAAGGCCTATAAAGAGTCCCTTCGGATCACGAACGAG
GTCAAGGAGTACACTGGAATTGAGAATTTGTTTGCATACTCACCATTTTACATTTTCTTT
GTCCAGTATGCGTCTATTGTCAAATTGACCTTTTCCTTGATTGCTGCTGCCCTTTTGGTG
ATTTTCTTATTTGCAGTAACCCTTTTGGGGTCTTTCGCTTCTGCTCTAATCTTGATCCTC
ACTGTTGTTATGATTTTGATTGATATGGGAGGCATAATGGCTCTTTGGGGAATCAATCTG
AACGCCGTCAGTTTGGTGAACATCCTAATCTGTGTTGGTCTAAGTGTAGAATTTTGCACT
CACATCGTGAGAGGTTTTACTATTGGTGATCCAGCAATCAACTTCAACACTAGCTTAGAT
ACCACATATGCATTCTCCAGCAAGCAATCGAGAGCTTTCAAGTCCCTCACGACCATTGGA
GGTTCCGTGTTTGGTGGAATCACTCTAACTAAGATCGTTGGGGTTACAGTGTTAGCGTTC
ACAAGATCACAAATTTTTGAGGTGTATTATTTCCGAATGTGGTTCTCTCTAGTGGTGTTA
GCCTCATTGCATAGTCTGATGTTCCTTCCAGTCATATTATCATATGTTGGGGGGAGAGGC
TATATATCTTCAAGTTATGCAAGTTTAGTTTCTGACGAACTTATCGACCGATTACAAGAG
CAGACTTTAGATTAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>PAS_chr1-1_0168 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTCCAGGAACGCTGCAAGTTAGACCCTTCCATTATAAACGCTTTAACGCTCTACGACGGG
CTAGTGTGAGATGAGTTCACCTACGCAAAGAAGAAAAAACCAAGATAGACTTTTCATTAA
ACTCTCTCTGCAGTCCATATAGCACCCCGACAGGTCAGTTTGATTGCTTCTGTAAGCAAC
CAGTAGGGCCTAGCACCGTGAGCATCATGTTCAACGGCTGTATCTAAGTGCTCCAGTTCC
TCATCTCTGAACTGACTGACCAACTTCTGCATATCTTTGATCTCCTCGGGGACGGTCGGA
GTATTTACTCCAGTTTCCTCATTCACGACATCCACATGGAACTGGTTAGTTAGTACTCTT
AATTGCTGGTTGTAATGCCCTCCAATTACAGTTTCAACAGCCTCTGTGCAAGCCATAGCA
GCCTCTTTCCCCATCAGTCCTGTGGCAATACCTAATCCCATGGCTCCAACCTTCCAGAGA
GGGGTTAGCAACGACGGTCTCACTCTTCTTTCAACCTGTAGATTGTTGAAAGTATTGTGA
TGGTGGATCTCCTGTTCCCACATATGCTTTAGTATAGGTTTTAAATCCGGTCTCTTATGT
GACAGGGCCAAATACTGCCCATTGTATATGAAATTTGCACCCAACTCCCCTGCTTGGTCT
ACTCTGATAACCCTATCCATGTAGGCATTCTGTGCGTCTGATAAGTAACCCAGCCTCAAA
TTTTCCGTGGCAGAGTTTTCCTTGCCCTTAGTGGACGCATATCTCACTGATTGCAGTTTT
ATCAAATTCCTGCTATGTCTGATCATGGTCCTCAGGATGACGGGGAAATTTCAATAGTGA
ACGAGAGTGATAGAGCTGTGGGATCGTACGGTTTGCCCATATGTATACTGAAACCCTTAC
ATCATCATCAAGGGGGGTAGAGTCGCGGCGGGAAACGAGAATATCAGCCCTCTATCTCAT
CTCCTCTACGCTCACTTGCTAACGGGAAGCGGACCACATC
|
|---|
| Chr coordinates |
Chr chromosome 1 from complement(869930..873784) |
|---|
|
|
|
|
