|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
Uncharacterized |
|---|
| Systematic Name |
PAS_chr1-1_0220 |
|---|
| Alias |
PP7435_Chr1-0535 |
|---|
| Strain |
GS115 |
|---|
| Description |
Transporter of the ATP-binding cassette (ABC) family involved in bile acid transport |
|---|
| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>PAS_chr1-1_0220 size 4917
ATGAATTCGTACAATGAGTCAGCCCCGACGGGTTGCAGTTTCTGGGATAATGATGATATT
TCTCCCTGTATCAGAAAGTCACTGCTGGATTCGTATTTGCCTGCTGCAATTGTAGTAGGA
TCGTTACTCTATTTACTGCTCATAGGAGCACAACAGATCAAGACTCACAGAAAGCTCTAC
GCCAAGGATGAAACACAACCGTTATTAGAACCTGCCAATGGCTCACCTACGGATTATTCT
AATACTTATGGCACCATAGATTACGAAGAGGAACAATCCACAGCGGAGTTGACAACCTCA
CAGAAACATTTTGACATTTCCAGACTGGAACCCCTGAAAGATGATGGCACACCGTTAGGA
CTGGTGAAATATGTTCAAAGAGATGGCTGGGAGAAAGTTAAGCTAATTCTAGAGTTTGTG
ATATTGATATTCCAATTAGTTATAGCTGTCGTCGCTCTTTTCGTACCTTCTCTTAACCAA
GAGTGGGAAGGTTACAAGCTTACTCCAATAGTACGAGTATTCGTGTGGATCTTCTTGTTT
GCACTTGGATCCATCAGGGCGTTGAACAAGTCGGGTCCATTTCCTTTGGCCAATATTTCA
TTGTTGTACTACATCGTTAATATTGTTCCCTCAGCACTCTCTTTCAGAAGTGTACTTATT
CATCCGCAAAATTCACAATTGGTAAACTATTACTACTCTTTTCAGTTTATTAACAATACG
CTACTGTTTCTCCTTCTTGGTTCAGCAAGAGTGTTTGACCATCCTTCTGTCCTTTTTGAC
ACTGATGATGGAGTTAAACCTTCCCCGGAAAATAATTCCAACTTTTTTGAGATTGTCACC
TATTCTTGGATTGACCCATTAATTTTCAAAGCTTACAAGACTCCACTTCAATTTAACGAC
ATTTGGGGATTAAGAATAGATGATTATGCATATTTCCTACTAAGAAGATTTAAAGACCTG
GGATTCACTAGAACTTTCACCTACAAGATATTTTATTTTTCGAAAGGCGATTTAGCTGCC
CAGGCTTTGTGGGCAAGTATTGACTCCATGCTGATATTTGGGCCATCTTTGCTGTTGAAA
CGAATTTTGGAGTATGTTGACAACCCAGGGATGACATCACGCAATATGGCATGGTTGTAT
GTTCTTACTATGTTTTTTATCCAAATATCAGATTCTTTGGTTAGTGGCAGATCCCTATAT
CTAGGAAGGAGAGTCTGCATTAGAATGAAAGCTTTGATCATTGGTGAAGTTTATGCTAAA
GCACTTAGAAGACGTATGACCAGCCCTGAGGAGTTGATAGAAGAGGTTGATCCTAAAGAT
GGCAAGGCCCCAATCGCCGATCAAACCTCAAAGGAAGAGTCCAAGTCTACGGAGCTAGGT
GGAATCATCAATTTGATGGCAGTAGACGCATCCAAGGTTTCAGAGTTGTGCAGTTATTTG
CATTTCTTTGTCAATTCCTTTTTTATGATTATTGTTGCCGTCACCTTACTGTACAGACTT
CTAGGATGGTCAGCTCTCGCTGGCTCGTCCTCTATCTTAATTCTGTTACCATTAAACTAC
AAACTAGCAAGTAAAATTGGTGAGTTCCAAAAAGAAATGTTAGGCATTACAGATAACAGA
ATTCAGAAGTTGAATGAAGCTTTCCAGAGTATACGTATTATCAAGTTTTTTGCTTGGGAG
GAGAATTTTGCTAAAGAGATTATGAAGGTAAGAAATGAAGAAATCAGGTATTTGAGGTAT
AGAGTCATTGTCTGGACTTGCTCTGCATTTGTTTGGTTCATCACTCCAACGTTGGTGACT
TTGATTTCATTCTATTTTTACGTTGTATTCCAAGGCAAAATTTTGACCACTCCTGTAGCA
TTTACTGCACTCTCCTTATTCAACTTGTTAAGGTCTCCACTTGACCAGTTATCCGATATG
CTATCATTTATGGTTCAGTCAAAAGTTTCTCTGGACCGTGTCCAAAAATTCTTAGAAGAA
CAAGAGAGTGATAAGTATGAACAGCTAACGCACACCAGAGGTGCAAACTCCCCCGAGGTT
GGTTTTGAGAATGCAACACTATCCTGGAACAAAGGCTCAAAGAACGATTTTCAGCTTAAA
GATATTGATATTGCCTTTAAAGTTGGTAAGCTTAATGTGATTATTGGTCCAACAGGTTCC
GGAAAAACTTCTTTATTGCTGGGTCTTTTAGGAGAAATGCAGCTGACTAATGGTAAGATA
TTCCTTCCTGGAAGTACTCCTCGTGATGAATTGATTCCAAATCCAGAAACAGGTATGACT
GAAGCTGTGGCCTACTGCTCACAGATTGCTTGGTTGCTAAATGACACCGTGAAGAACAAC
ATCGTCTTTGCTGCTCCTTTCAACCAACAGCGTTATGACGCTGTTATCGATGCCTGTGGT
TTAACCAGAGACTTAAAAGTCTTAGATGCTGGTGATGCCACTGAGATTGGCGAAAAAGGT
ATCACTTTGTCTGGTGGTCAGAAACAACGTGTCTCCTTAGCAAGAGCCCTGTACTCAAAT
GCTAGGCATGTGTTATTGGATGATTGTTTAAGTGCTGTTGACTCTCACACCGCTGCTTGG
ATTTACGAAAACTGTATTACTGGACCTCTGATGAAGGATCGTACTTGTATTCTCGTTTCT
CATAACGTTGCTTTGACAGTCAGGGATGCTGCATGGATCGTTGCAATGGATAATGGAAGA
GTTCTCGAGCAAGGAACATGTGAAGACTTGCTTTCATCGGGGAGTTTGGGCCATGACGAT
TTGGTATCAACCGTTATTAGCTCGCGTAGTCAATCTTCGGTCAACTTAAAACAATTGAAT
GTATCTGATACAAGTGAAATTCATCAAAAGTTGAAAAAAATAGCTGAAAGCGACAAGGCT
GATCAACTTGATGAGGAGCGACTCTCACCTCGAGGGAAGTTGATCGAAGATGAAACGAAG
TCTAGCGGAGCAGTTAGTTGGGAAGTTTACAAGTTTTATGGTAGAGCTTTTGGTGGCGTT
TTTATCTGGTTCGTATTTGTTGCAGCATTTGCCGCTTCTCAAGGGTCAAACATCATGCAG
TCTGTTTGGTTGAAGATTTGGGCGGCTGCTAACGATAAGCTGGTGTCTCCTGCGTTTACT
ATGTCTATTGATAGGTCATTGAATGCCCTCAAGGAAGGATTCAGAGCATCTGTGGCATCT
GTTGAGTGGTCCCGTCCTCTAGGCGGTGAAATGTTCCGGGTTTATGGCGAAGAGAGCAGC
CATTCTTCTGGTTACTACATTACAATCTATGCTCTGATTGGTTTGTCATATGCGCTAATT
TCAGCATTCCGTGTCTACGTTGTTTTTATGGGAGGAATTGTTGCCTCTAACAAGATTTTT
GAAGATATGTTGACAAAAATTTTCAATGCCAAATTACGATTCTTTGATTCCACACCTATC
GGCCGTATTATGAACCGTTTCTCCAAAGATACTGAATCCATTGACCAAGAATTGGCTCCT
TATGCTGAAGGATTTATTGTGTCCGTTCTTCAGTGTGGTGCGACTATTCTTTTGATTTGT
ATTATTACTCCGGGATTTATCGTATTTGCTGCATTTATTGTGATCATCTACTATTATATT
GGGGCATTGTATTTAGCTTCATCTCGAGAGTTAAAAAGGTACGATTCGATCACTGTATCT
CCGATTCATCAGCATTTCTCCGAAACACTGGTGGGCGTTACCACCATTCGTGCTTATGGT
GACGAAAGAAGATTTATGAGACAAAACCTGGAAAAGATTGATAATAACAACAGATCTTTC
TTCTACTTGTGGGTTGCGAATAGATGGTTGGCACTTCGTGTTGATTTTGTTGGGGCTTTG
GTCAGTCTATTATCAGCAGCTTTTGTGATGCTGAGTATTGGTCATATCGATGCTGGTATG
GCCGGTCTTTCCCTATCCTACGCCATTGCGTTTACCCAGAGTGCTCTTTGGGTTGTTAGG
CTCTACTCTGTGGTGGAGATGAATATGAACTCTGTGGAAAGATTGGAAGAGTATTTAAAC
ATTGACCAAGAACCTGACAGAGAGATTCCAGATAATAAACCACCATCCTCGTGGCCTGAA
ACTGGAGAAATAGAAGTTGATGATGTTTCACTACGCTACGCTCCTTCTCTGCCCAAAGTC
ATTAAAAATGTATCTTTCAAGGTCGAGCCAAGATCGAAGATTGGAATTGTGGGTAGAACT
GGTGCTGGAAAATCAACCATTATCACAGCATTTTTCAGATTTGTCGATCCTGAATCTGGG
TCAATCAAGATCGACGGTATTGATATTACCTCTATCGGATTGAAGGATTTGCGAAATGCT
GTCACTATAATTCCTCAGGATCCAACATTATTCACCGGTACTATCAGATCCAATTTGGAT
CCGTTCAACCAATACTCAGATGCCGAAATCTTTGAGTCTCTGAAGAGAGTCAATCTGGTC
TCTACAGATGAGCCAACGTCTGGCAGTTCCAGCGATAACATCGAGGATTCAAATGAGAAT
GTGAACAAGTTCTTGAACTTGAATAACACTGTGTCCGAAGGTGGCTCAAACCTGTCGCAG
GGTCAAAGGCAACTGACTTGTCTTGCTCGTTCGTTGCTGAAGTCTCCTAAAATCATTCTA
CTTGACGAGGCAACAGCCTCTATTGACTACAACACAGATTCCAAGATTCAAACTACAATC
AGAGAAGAGTTCAGCGATAGCACCATTTTAACTATAGCTCATAGGCTACGCTCTATTATT
GACTATGACAAAATTTTAGTCATGGATGCTGGGCGTGTCGTGGAGTATGACGACCCTTAC
AAGTTGATCAGTGATCAGAACTCATTGTTCTACAGTATGTGTAGTAACAGTGGGGAACTT
GATACGCTCGTTAAGCTTGCTAAAGAGGCTTTCATTGCTAAGCGCAATAAGAAATAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>PAS_chr1-1_0220 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTTCCGTGACCCAACCAAGAAGGGTTTGCGTGAGGAGACTTTCATTGCCAATGAGGGTTT
GTACACTGGTCAATTCATCTATGCTGGTAAGGATGCTTCTTTGAATGTTGGTAACATCCT
GCCTTTGGGAGCCCTTCCAGAAGGTACTATTATCTCCAATGTTGAGGCCAAGCCAGGTGA
CAAGGGTACCATCGGTAGAACTTCCGGAAACTACGTTATCGTCATTGGACACAACGTTGA
GGAGAACAAGACCAGAGTTAAGTTGCCTTCCGGTGCTAAGAAGATCATTTCTTCCAACTC
CAGAGGTGTCATTGGTGTTGTTGCCGGTGGAGGAAGAATCGACAAGCCATTGTTGAAGGC
TGGTAGAGCTTTCCACAAGTACAGAGTTAAGAGAAACTCTTGGCCAAGAACCAGAGGTGT
TGCCATGAACCCAGTTGACCACCCTCACGGTGGTGGTAACCATCAACATATTGGTAAGGC
CTCCACCATCTCCAGAAATGCTGTTGCTGGTCAAAAGGTTGGTTTGATTGCCGCCAGAAG
AACCGGTTTGTTGCGTGGTACACAGAAGACTCAGGACTAGGTACTTTTATAGTTATCAAG
GTTAAATTTTGGGTAATACTCTTGTAGCTTTTCGTAGAGCTCACTGTCACCTCCTAGTTT
TCAGCCTAACCTTTCTCAGCCCTGACGGGTGTTACTCCCTTCGGGCTTGCGCTCCCTTCT
AACCCCGTAGAGCTTGCTTGCCTTTTTAAGCCGTTTTAGTCTTCACACCTACTTATGACA
TATCTTTGCTGAAAAGCTTCCCTTTAGTTGAGGTTATCCAAGCTAGAGCTTTTAACTCCC
TCCAGTTTTCTTGCCCGCCAACAGGACCGTCATTCCTTGCCACAGCGTTCCTTGAAGCTT
TTTCCCTGTGAAGACTCAATTACCAGGTGGACTCAATTTTTTCAACAGTTCGAAGATTAG
AAGATATTTTCTTTCCGTTAAGAAGTCGTCTTTCCTTCGT
|
|---|
| Chr coordinates |
Chr chromosome 1 from 987880..992796 |
|---|
|
|
|
|
