N.C. Yeastract
K.phaffii
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name Uncharacterized
Systematic Name PAS_chr1-1_0428
Alias BQ9382_C1-3885, ENA2, PP7435_Chr1-0747
Strain GS115
Description P-type ATPase sodium pump, involved in Na+ and Li+ efflux to allow salt tolerance
External sources Open in GenBank external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>PAS_chr1-1_0428	size 3270
ATGTCTATGGAGAATCAAAGATTGGATAATTCTAGTGATGAAAAGGAGAAGTCACACTCC
GAATATGTGAACTCGGTACATTCGGCTTCAATCTCAGATTCTGACTTTGAGCCTTACAAA
ATGACTGCGGATCAAGTAGTACAGTATTTTCAAACTGATATTAATCATGGACTTAGCTCT
GCTGTTGCCAAAGAGCATCTGGCCAAGTATGGCCCTAATACACTAGGTGAAGGGACTAAG
ATTTCGATTACCAAGATTGTTGCTCATCAGACTTGTAATGCTATGATTCTCGTCCTAATT
ATCTCAATGATTATTGCTCTAGCTATTCAGGATTGGATTTCTGGGGGTGTTATAGGTTTC
GTTGTTCTGTTAAACGTAGTTGTTGGTTCCATCCAAGAGTTTAAAGCGGAACAGACCATG
GGATCATTGCGATCTTTAAGCTCTCCAACGGCTAGAGTGATAAGAGATGGGAATGACCAA
ACAATACCTTCCGAAGAGGTTGTTCCCGGAGATATTGTTATTGTAAAAGTTGGTGACACC
ATTCCAGCAGACATGCGATTGTTCAACGCCATGAATTTTGAAACTGATGAAGCTCTTCTT
ACTGGGGAGGCTATGCCCGTAGTCAAAAGTCCTCATGATGTTTACAAGCAAGTGGTACCA
GTAGGTGACCGTCTAAACTTAGCGTATAGTAGCTCAAACGTCACCAAAGGTAGAGCCCAG
GGTATTGTTGTATTCACGGCTCTTGAAACTGAAATAGGGAAGATTGCAAAGTCGTTGAGC
AATAAGACTTCTAAGGTGCGAACGGTTAGCAAGGACGATCAGGGAAATGCCAACGCTTTT
GCTTATCTCAGAGCCGGATTCGGTACTATAAAGGACAATGTGCTTTCATTCTTGGGTCTA
ACTGTGGGAACTCCCTTACAAAAGAGATTGTCAAAGCTAGCAATTTTCCTATTCTGTATT
GCGGTCGTATTTGCTATCGTTGTTATGGCTTCCCAGTCTTTTGAAGTAAACAAACAAGTT
GCTATCTATGCCATCTGTGTGGCTTTATCCATGATACCTTCCTCGTTGGTCGTTGTCCTA
ACTATTACTATGGCTGTGGGAGCAAAGATTATGATTAGTAGAAATGTGATCGTAAGAAAA
CTAGATTCACTGGAAGCTTTGGGTGCTGTTAATGATATTTGCTCTGACAAAACTGGAACT
TTGACTCAAGGACGAATGATTGCCAAGAATGTTTGGGTGCCGGCTGTGGGTACTTTTGCT
GTTGTCGACTCCACTGATCCTTTCAATCCGACCTTGGGAAAAGTTGAGTTTATTCCCAAA
TCCCCGGTACAAATTTTAGAAGATGATGAGAATTTATTTCAAGTGTACGATAAATTTGAA
GACGGCTCGGTTCAGAAAGAGTTATTTCACAAATGGTTATTCACTGCAACACTGGCTAAC
ATTGCTAAAGTTTTTGAGGAAAAAAATGACAATGGTGAAGTAGTCTGGAAATCTCATGGT
GATCCTACCGAGATCGCTATACAAGTTTTTACCACGAGGTTAGGATATAGCAGGGATGAC
TTGTCGTATGATTCTCCGGATTCTCCGTACGAGCATCTTGCAGAATTTCCATTCGATTCG
TCGATCAAGCGAATGACTGCAATCTATTCTGAAAGGAAATCAGGCAAGCACACCATTTAT
ACAAAAGGTGCGGTGGAGAGAGTTCTCGGGTGCTGTAATAAGATTTACCAAACAGACGGA
ACGACTCGACCGCTCACTGATGAAGACCATAAGAATATTGAGGAGCAGATGAATGCGTTT
TCCAGTCAAGGATTGCGAGTTCTTTCTTTTGCCCAGAGACATCCTGAGCCAGAAGATCAT
TGGAATAATGTTGATAGAGCTGTGGTCGAATCAGACCTCACTTTTTTGGGGCTTATTGGT
ATTTATGACCCACCAAGACAGGAAACCGCTCCTTCTGTGAAGATGTGCCACAAGGCTGGT
ATCAACGTTAGAATGGCTACTGGTGACCATCCCTCCACTGCCCGTGCTATTGCTCAAGAA
GTAGGTATTTTACCCCATAATTTGTATCACTACGCACCTGAAGTTGTTAAAGTCATGGTT
ATGACTGCGACGGAGTTTGATGCCTTAACAGACGATGAAGTTGACGCTTTACCAGTCTTA
CCACTGGTCATAGCTCGTTGTGCTCCACAGACGAAAGTTCGTCTTATTGATGCACTTCAT
AGAAGAAAGAAGTTTTGTGCTATGACTGGAGATGGTGTCAACGATTCACCTTCGTTGAAG
AAGTCTGACGTTGGTATTGCTATGGGTATGAATGGTTCAGATGTCGCAAAAGATGCATCT
GATATTGTGCTTTCAGATGATAACTTTGCTTCCATCCTAAATGCAGTTGAAGAAGGCCGT
AGAATGGGGGATAATATTCAAAAATTTGTACTGCAATTACTGGCTGTTAATGTTGCTCAA
GCCCTATATTTGATGGTGGGTCTTGTTTTCATGGATGAAGCTGGATTCTCCGTTTTTCCG
TTAACTCCTGTTGAAGTTTTGTGGGTTATTGTGGTCACATCATGTTTCCCTGCTATGGGT
TTAGGTATGGAGAAGGCTTCTGTTGATATTATGGAGAAGCCACCTAAAGACCCCAAGGAT
AATGTTTTTACCTGGGAAATTCTTTGTGATATGTTGGTGTATGGGATAATTATGGCTATT
TGTTGTATGGGTCCGTTCCTTATCGTTGTTTACGGAGATGGTAATGCTAGCGGTGAACCT
CGTTTAGGTGTGGACTGTAATGATGCATATAGTTCCTCCTGTGATGCAGTATTCAGGGCC
AGGTCTTCCTGTTTTGCTGTGATGACATGGTGTGCCCTTATTCTGGCTTGGGAAGTGATT
GATCTACGCCGATCACTGTTTCGTATGCATCCTGACTCGGAGACTCCATATACCCAGTTT
TTCAAAGATGTATGGGACAATCAGTTGTTATTCTGGTCAGTTTGTCTTGGATTTATCACA
CTCATTCCAACGATCTATATTCCCGTCATTAATACAAAGGTATTCTTGCACAAAGGTATT
TCTTGGGAATGGGGTGTTTCTATTGGATTTGCGCTCGTATTTTGGATAGGTGCTGAAGGT
TGGAAGTGGGTGAAACGTATTTATTACCGCCGAAAGGACGAGAAGGCCAGAAATCCGGAA
TATGATTTGGAAAGGAATGATCCGTTCGCACAATATGCATCATTTTCTAGAACAAACACC
ATGGACAACCAAAAGAAGTTATTCGGTTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>PAS_chr1-1_0428	upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GTTCAATGAATCAAGTACCAAGTGAAGAATCAATTCATGCAGTAATTTTTTTCTTACTAC
CTTGTCGCGCCTGAACCAAAACTTTTTCGATTAATGAATAAATAACATTTGGCTACGCTG
TGGTGGTCTGGTCTACGATCAGTTTAAAGAAAAGACTATACACAACTTGTGATCGTGTAG
GCCAGTTGATTAACTTTTATTTTTTCTAAGAAACATCAAAAAAAGAACTTTATATTCTAG
TCAAGAAATCAGGCGCAATCGGAGGTGGAACATAAAAGCATTTGCCCTCGTACAAAATTT
AAATTTGCCTGATAGCTCGCTGAAATTCAGTTTGGAATCGTCGCCGGTCTTGAGTCATTC
ATTATTCTTAGGCTTACCATCAATCGTGGTACTGTTCTCAGACTCCTACCTAGCACGTGC
CCAAGCCAGTTTATAGAATCGCAACTTAATGCAGGTTATCGCATCAGTAATACTTCTACG
GCATGATTAGTTGGACATTGACTGAGACCGTAACCCACAAATCCATTCCAAGCCATTAGT
ATTTAGCATTGTTAGCTGCTGCCTCCAATCAATCTTTTGAAGCAATCTATTTCATACAAT
GTTTCTTCGAGGCCGCTATCTTTTCTTTTTATTCTGATTTGGTTCTTGCTAAAAAATCTC
ATGCAGTGTTCAGCGACCCACTCTTGGCATCCTAACCAGTCGAACTCCTATGTGGACCTG
GTGTCTCAACAGTTCACAGCTAGTAATAATTTGGAGCAAGCTTCTAATACGAAGAGGGTA
AAGAAATCATTTGCTGGTACTCTAGACGCGTAGACTAATAGACATTGTCAGCTTTCATAA
GCTGACAGAACAGCCGCACTACCAGCTTATCTGCTGAACTTTGCGCTCCAAAGAGCTGCT
TCTTTTGGCCGCAGGTAATGCCGAGACAAGACCCTTCGCGCTAAGGTTGATTATTATAAA
TACCCTTCAACCTCCATCATAGAAGAACCAAAGCCACACT
Chr coordinates Chr chromosome 1 from complement(1347055..1350324)