|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
Uncharacterized |
|---|
| Systematic Name |
PAS_chr2-1_0066 |
|---|
| Alias |
PP7435_Chr2-1244 |
|---|
| Strain |
GS115 |
|---|
| Description |
Peripheral membrane protein with a role in endocytosis and vacuole integrity, interacts with Arl1p a |
|---|
| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>PAS_chr2-1_0066 size 4647
ATGACCCTGGCCTATTTGGTTCAAGAGCTAGGAACTCTCAGTCATGATTCGAAAAGGAAA
TATCCCGAGCTGAAAGAAGCAGCAGATGCATCTATAGATATGATAAGATCTTTCAAACAA
AGGGTCCCCATCCAAGAGCTTGTGAAGTTTGAGTCCTTCGTTGACCCTTTTCTATTATCT
ATACAAACAAGGTCCCTCAAATTGGTAAATACTGGACTTGCTTGTTTACAAAAGCTAATA
ATAGAGAGCGCAATTGCTGATACAAAACTTGAGTCACTGGTAAATTCACTACTGGTTTGT
TCCCAGTTCAAAAGTGACGATGTTCATTTAAAAATCCTTCAATTGCTGTCATTATTATTA
CAGAGCTACCCAATCCGTTTGAAGAATGAATTGCTATCAAAGTTCTTGTTTGTCTGCTCC
AATTTGTATACACAAAGCAAAAGTCCAGCTATCATCAATACTGCCAGTGCCACATATCTA
CAACTGTTGACTGGCGTATTCGATAAAATTAAAATAGAGGACAGCAAAATATCCCCAGAT
GATCCAGTTTACACAGTTTCCTTGGATGACAATAAAACTATCGAAGTTCGCCAATGTGCC
TATGATTCCCAAAGAATACTTCTTGATTTGATCAATTTGATACAACATCAAAAGCCTATA
TTTTTGAAAACAAACTCGATCAGTGAAGAGTTTGGCCTTGAACTTTTAGAAACCATATTA
AAAGACAATAGTGAGCTGTTCAATGAGCATTTAGAGCTGGAGTATCTTCTGCGAATAAAG
ATTTCTCCACTCATATTGGATTACCTAACCTCATCTGATGAGTTTCCAATAATGGTAAGA
GTAGCTCGCATCATTCAACTAATGCTTTTGCAGCATTTCACAACACTGAAGAATGAATCG
AAGCCAATATTATCCACCCTTACTTTTCAACTCACAAAAGATTCAAACTCACCGTTCTGG
AAAAAGGTTTTGAGTTTGGAGATATATCTTTCTATTGTTAAAGATTTTACTCTTGTGCAA
CAAATTCACAAGACATACGATTCTCAGCTAGATAGTAATGAGAAAACCGTTTTCAAGAGC
TTTTTCGATGTTTGTTTTGAGATCGTTGTTCTCAATAAGTCGTTATTAAATACCGGTGAT
ACCATTCTGCCCAAATTTATATCTAGAGAATATCAAAAACCGGCTGATTTTGCAGGTCTG
ACGGTGGCCAAGTCTTCTTCAAAAGTTCTATTCATTGACTACCTAGATAAGTTGGAACCT
CCACAAACTTCGTCCACATATATGCTGTACCTCATACTTCAAACGTTGACTTCGATGTGT
GATAGCCTTTCCAAGGCTGTCATTGGACTAGATAAAAACTCTAGTTCATACATCGAAATT
AAAGATTTGGTGTCAAATAACTGGGTGCTTTGGAAAGATATGGCAACCGTGTTTCTGTAT
TCTTCCTTGTGTGAAACTCTTTTTAATGGATTGACAAAATCGCTGCAAAAATTGACGCTG
ACTGTGAGCTTTTTGGACCTCAAGGATGCTAGAAAAAAACTCTTGTTTCTTATTTGCAAA
TCAATCACAAATCTGACCGGAAGCTCAGGTTTTAGATCAAAATCATTAGGCGAGAGTATA
GTTGGGACTATCTCAACAACGATTCAAACTTTGTCGCAGCAACCAGTATCCAATGTATCA
ACCAGTATCCAGCCTTATAGTCGTTCATTCAACTCACGTATGGCTGTGTTGTTTCGAATG
CTCATAAACTTGGTGATTAGTCTTGGCAATCTACTTGATGGCTCAGAGTGGATTTTGATT
TTTAAAACTATTCAATGGTTGGATTACTTTCTGAATGGGGCATCCTCTGATAAGCTTTTG
CCGCAAGATAAACCTTCTGCTGATTTGATTTCTTCCCAAGAGATCTTATCTATTCAAGAT
TCGATTGTTAAATTGGAAGACTCCGTTTCCGGATACAATTCTACTACATTGAGTTTAATA
ATAGAATCATTTGTGACTTTGACTACAGAGTTACTTCTGGAAGAGGGTGGCTCCAAAGTA
CCATTTGAAGAAAACGATGATTTAACTTTGAGGACATCAAGCTATAATAAGCTATTTTTT
GTTGGAAAGCTTACAAATATCCTTCAAAACAATACCATACAACTACTTGCAACTGCCAAT
GGCGTTTGGGATTACACTTTGGAATTTTACAAGAGTATTATTCAACAAAGAACATTGGAT
GATCAGACTCGCTTTTTGATCACTGATTCTTTTGATTCTGTCGTGAAGAAAATAGCTGCT
GACGGGTTCACAAATGATGAGATCAGGAATACCGAACACGTTGTGCTGAATTCACTCAAT
AAAATAGACACTAGCTTATCAAACCTTCCAACTTCTAAAGAACTTTTGATAGTTAATTGT
GAAACAGATATTAGACTACGAGTATTGAAAACTTTGAGCACCGTGCTGAACAGATACGGA
AGCAACTTCGCTGAATCTTGGAGTTTAGTATACACACTCCTTGATGCCCCGTTCCAATTA
ATCGAAAAAACAGTATTAGAAGATCCAATCTTATTAAAAGATCCTCAATTGAGAATCAAT
GTTGGCCAACTCCTAGAATCTAATTTTGAAACTGTCAAATTGCTTCTAGACGAATTCCTC
ACATCACTGCCGAAGAAACAGTTGAAACCATTAATTGATATTTTATGCAAATTTTTTTAC
CAGACACTTGATTTAAATATATCACTAAACTCCTTAAGTTACTTTTGGCTGATTAGTGAC
TCTTTGAAAAACTCATTCAATGCCACAAAAGATTCCAGTTATGTTGGTGAAAATTTGGAT
TTGGTACTGAATGACAAAGAGGACCTAACTACGCTCATCAATTCACCTTCGACCGACCCA
GCACTTATAGATCACTTGATATGGATTTGCCTTATAATATCCCTAAACAAGGCTGCTTCA
GATCCAAGGGCTCAGGTTCGCAATGGTGCAATATCTACATGTTTCTCAATTATTGATTCT
CATGGTTCCTTACTTGGATGCTGGAAGTTGATCTATAGGCTAGTGATTGAGAAGGAATTT
TATACCATTGACTACTCCGATAGTTTAGATTCCGATCACTTGGAAAGTATAACCCTAATA
TTGCGAGGTTTATGCTCCTTGTACAGCAGTCAATTCTTAAGCTTTGACTCTTCCGATTCG
AAGAACACTAAGAGTTTACTATTATTTTGGGAGGGACTCTTTGGGTATTTCGAAAAACTT
TTAAAGCTTAACTGGCTAGATCTGGAGTATCAAATCTTCAAGCAATTTCAAGAGCTATCA
AAGCAAGGTTTGGAGCACGAGATCCCAACGGAACTTAAAGAGTTATTTTACTCGTTTTGG
TCTACTTACCAGATTCTGTATCAAGTGAACCCTTTAGCTCAAGATACGCTTGTAGTGTAT
TTTGAGTCGTTTGATAGTATCTATAAGATGGTGAGCCCGATCCAAGATGTCCAAAAAATG
GAAAGAATACTTGCCATTTTGAACACTGCTATCCGTTACCCCATATTACCATCTACTAGA
TCATCCGATTCTATTAAGAGCACTAAACTTCAAGAGACAGTTCTCAATATTCTTGGCTAT
ATGGAGTTTGATGATTACCATTACAAGTCTATGCTTATTCAGCAGTTAGCAAATATTTCC
ATGCTTCCATTAGCACCTAAGTCGGCTATTGAACAGAAGTTCATCAAGAAAGTTCAAGAT
TCTGGCTTTCAAGTTCCTACTTACATTCATTTCAGTCATAAGGCAATAATCGTGCTTGAA
AATAAGCTGGCCGACTTAAGTCCCGCTAAGGTGCTAGATCTTGGAAGCTTCACCGAAAGG
CTGTTTGAACAACTGTTAACTATTGTACAGGAACGATCAGTAGGATTAGAAGAAACGGAA
CAGGAATTGTGGATGATTGCCTCCAGAATCTTGGTTGATCTATCTCAAAAACTGCTGCAG
TCATACGACAGTTCCCTTGAATATCTTTCGATGCTGTTTATTAGATTAACTGATACCATT
CTGTCTTACTATGGAAAAAACTCGCTCTATGAACGCTTTGACATCGTTCAATATGACAAG
TTGTATGCATGCTTAATACCACCACTCACTGAGATGCCCAAAAGTGTGCAAGTTGAATTT
GCTCACTCCATCTGGAAAAATTCGTTTCTTTATGAGTTCGATGATACTGAAACGGCATTA
ATTGGCCTTGATGAACTGAAAGATATTCCAGCTCAACAGAGTTTATGCTCCAGGTTACTC
AGTTTCCCGTTTGATACAATTGCCAATACCACAAGCCCTATACAGACACATCCAAGAAAG
AATCTTAGTTTGAGATGTTTGAATGATTTGATCGATCTTTGCAGTGATCCACAATTTCAA
AAAGTTGTGACACCATTTTTTATCTCCAGAACAGCTATCGCTTTACACAGAGTTATTGTT
TGCAAGTCTTTATTAGACAGAAGACCTCTTCCCAGATTACAGCACTTAGAAATTGAAACA
ATCATAAATGGCATCTCTTCGTTAGTTCAGAAAAATGGTGATAGAAACATTCAAGATCAG
ATCCACGAGTTGAAGCCATTATTTCTACGATACGTACCATTCACAGACGAAAGAGATTTA
CAGAAAGTGTTGAGTTTGAGTGAATAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>PAS_chr2-1_0066 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTCAGACAACTTAGACTCTAGAGGGGTACCGTCTTCATCGATTATTGATTCTTTTAATTT
GTAATCATGGTCAGTAGACAACAAATCACTTTCTTCAACTTCTAAGGAATAAACTTGTAC
CGTTCGGGGTTTTATTTCCATCGGTAATGGCTTGCCCTCTCTAGCATACTCGTATAGAGG
TTTTCCATTCATTTTCAAAGCAGAAAACAGAGGTGGAGTTTGTATAAGCTCCCCAACAAA
CTTTTTAGCAGTTTGCAAGCACATATCCTTAGTAATGTGGTTGACTTCCGTTTTGCAAAT
AACGTCTCCCTCTGAATCCCCTGTGGTTGTAGCAGCTCCTAGCAATGCTTCAGTTTCATA
CAGTTTGGTAGAGCCACCTAAATATTCTTGTAGCCGTTTCGTTCCTTGTCCCACTCCAAT
TACAAGAACGCCAGAAGCCAGAGGGTCTAAAGTTCCACCATGGCCCATCTTAACTTTGGC
TTTGCTGGCTTTCTTTAGTCCTCTGGCACTGTTCTTTCCGTAGCCAGCTAGCTTCCTTTT
TCTCAGCTCAGCCAAGTCAGCGCCAAATATCGAAGAGTTTGTAAAAATATTATTTATCTG
TTGCAGAAACTTGTTAGAGCTGACCCCATAAGGTTTTTCCACAGCAAATATTCCGTTCAT
TGGGGTAGTATTGTCCTCAGTAAAAATTTAGTAGGTTAACCATACGCACCAGATATCGAG
ATCCGAGATGATTATATAAGATGAAAAGTTTTGGATGGGTGAACTGACAATTGACACTCC
AAGGTTTATATTAAACGATCCTAGCTCTACAACAGACCAGACACACTTGAGATATCTATC
AGTCCCACTATAACAAGATAAATATATTTCAAACTCCCCAAATCATCCTCTTTCACATGA
AATAGATGTAAATCCCTACACCACATCATTATCTGGTTCCCAAAGATAATAGCGATGTCA
GTATTCCCCATCCCCTTGATAAAGTTTAGTCCAGTCAATT
|
|---|
| Chr coordinates |
Chr chromosome 2 from complement(118734..123380) |
|---|
|
|
|
|
