|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
Uncharacterized |
|---|
| Systematic Name |
PAS_chr4_0188 |
|---|
| Alias |
PP7435_Chr4-0823 |
|---|
| Strain |
GS115 |
|---|
| Description |
Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter |
|---|
| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>PAS_chr4_0188 size 3957
ATGGGGCAAAAACTCGAGAAAGATGGCGATCTGGTTTTGAAAAAACGTTGGCTGACCCCT
TTATTGCTGAACAAGAAAGTCCCTCCAGTTCCTGATCCATCCGAGAGAAAGTCTTACCCA
CTACATAAAACAAATCTGCTCTACAGAGCCGGGTTTTGGTGGCTAATACCTCTGTTGAAC
ATTGGATATAGGAGACCACTTCAACCGGATGATCTGTACACACTTGAGGATAATGAGGCG
CATTTTTTAAAGGTTGAAGATATGCATGACCGATTCCAGTACTATTTCAATCGAAGATTG
GAGAAAGCCTACCGAAGTTGGGAAAGCAATGGAAAAAAGCAAACGCCGTTCAAGTACCCT
GATAACATACTCTTTTGGACCTTGTTGGAAACTTTCAAGTATGAGTATGTGAAGGCAAAC
ACTTGGAAGTTTTTGGGTGATGTTGCCACAGCTTTAACTCCTTTACTGAGTAGGGAGTTG
ATCAAATTTGTGCAAATGCAGCCAGTACTGAATTCCCCCGTAGGAAAGGGAATTGGGTAC
TCGTTTGGTATCGCAGCTTTAGTACTGGTTAGGTCCTTCCTCCAGTTGCATTTCTTCCAT
GATACTGGATTGACAGGAGCAAAAGTTAGAGCTTTACTAACCAAATTATTGTTGGATAAA
TCCTTCCGGTTGAGTGACAAATCTAGAAATTTATATCCCCAAGGGAAGATCACCTCAATT
CTTGGTGCAGATATCTCCCGAATTGATCTTGCAGTGACTTATTTCTCATTCATTTGGCAA
TTTCCCGTTGGTTTAGCCATACCCATTGCCCTATTAATTGTCAACATTGGAGTGTCAGCT
TTGGCCGGTGTTGCTGTACTAATACTAACGCTTTTCACTGTTATTGCTTCTGTCAAACCA
TTGCTCAAATTCCGAAAGAAAGCAAGCGTTCACACTGATGCAAGAGTCAAATCTCTGAAG
GAAATACTTTACAATATGAAAATCATCAAGTTTTACTCTTGGGAAATTCCTTATTTTAAT
CAAGTTTCCGAGCAAAGACAAAAAGAGATGGTCCAGATTTTGAAACTTCTGTTTTCAAGA
AATGTTGTAACTGCCATATCTATCAATTCCACAACTGTGTCGTCTGCTGTAGCTTTTCTG
ACAATGTTCGGAGAGAGAGGAATGCAGAGTGCCGCTGATGTGTTTAGTTCTTTGCAGTTT
TTCAACGTCCTTTCTTTGCAGCTGGTGCTGTTACCAATGGCGTTCAGTACTGCTACCGAT
GGCTATCTTGGATTGAAAAGGCTTACTGAATTTCTAGGTGCAGAGGAATTTTATGAGGAT
GATTTGGATGATTCATCTTACAACAGAAGCAGCTCCGAGAAAGATATGTTACTGGAAGAT
GTGGCTTTGAAAGTTGAAAAGGGAAATTTTTCATGGCCAAGCTTCGAACTCGATCAAGAA
GACTCAGTTGGATTGAAAGACATCAACCTGGAAGTGAAGAAAGGAGAGTTTTTGGTGATA
ACTGGTCTAATTGGGACCGGTAAATCTTCATTACTAGCAGCATTGAGTGGCCAGATGAAA
AGAAAATCTGGCTCAGTTAGCCACCAGGGGTCACTATTGCTTTGTGGCGAACCATGGATC
CAAAATACTACTATAAGAGAGAATATTGTTTTTGGACAGCCATTCGACGAGACCAAGTAC
TGGGAAGTCATTAAATGCTGTGCGTTGTCTCAAGATCTGGATATGCTAGATCATGGAGAT
ATGACTGAAATTGGAGAGAGAGGGATCACTCTCAGCGGGGGTCAAAAGGCCAGAATTAAT
CTTGCAAGAGCTGTCTACAATGACAGGGATATTCTGTTATTGGATGATGTTTTGAGTGCA
GTAGATGCTCGAGTTGGTAAGCATATAATGGACAATTGTGTTATGGGATTACTGCACGAT
AAAACTAGAATATTAGCAACTCATCAACTGTCTCTGGTCAGCACTGCAGACCGGATATGT
TTCCTCAATGGAGACGGAACGATCGACGTAGGAACGTTTGAAGAGCTCTCCGCTAGAAAC
CAAAATTTCACCAATTTAATGGTTTTTAATACCAATGAAACCCCAGAAACAGAGGATAAG
CAAGAGATTGAGCGTGAAAAGGAGTCCCAGCCTAACCGCAATTTTACGGAAAAGGAAGGT
AAGACGATGGTCCAAGAATCTAGATCAGATTCGCTTTCGAAGTGGGAAGTTATACCGATT
TTTTTCAAGGCGGGTGCACAAAGATTCACCTTGCTTCTTTTGTTGGCGATTATCCTTACT
GTGGTTATAAGCGCCTTTTTAGTTGTGTTCTGTAATGTTTGGTTGTCTTATTGGGTATCT
TATCATTTCGAACACTTGACAAATGGTCAGTATATTGGAATATACATCTTACTAACCTTC
CTGGGTGTCCTAATGGTGATTTTGGAGTTCTTTTTCATTTCCTATGTTGTGAATAAAGCC
TCCCAGAATCTGAGTCTTCAAGGACTAAACACTTTACTTCACACTCCAATGAGCTACTTG
GATGTTACCCCAATGGGTCAAATTTTGAATAGGTTCACCAAAGACACGGACACCGTAGAC
AACGAAATGGCTGATCAGTTACGACTGGTGGTATTTGGTTTCTCGTCGATTGTAGCTGTG
TTGATTTTATGTGTGGTCTACCTACCTTGGTTTGCGATTGCAATTCCAATATTAGTGCTT
TTCTATTGTGTCATGTCCAATTTCTATGGTGCTTCAGGGAAAGAAATGAAAAGAATAGAG
AACATTGAGCGATCCTTCGTTTATAACAACTTTAATGAGTGTCTGACTGGAATGAACACG
ATAAGGGCATACGGTATGGTCGATAAGTTTCTAACAAAGAATACAAGATTGCTGAACAGA
ATGAATGAAGCTTATTATTTAACAGTTGCTGGTCAACGATTTTTGGCAGCAAATTTGCAT
TTCATAGCGACAGTTATGACACTTCTAGTCGCCCTGTTAGCTGTGACTCAAAGTTTCAGT
ATTAGTGCCAGTTCGACTGGTCTTCTTTTATCATATACGTTACAAATTACGGGACTACTG
ATGATGTTGACAAAGTCATTGACCATGGTTCAACTTCAGATGACTGCGATTGAACGATTA
GTGGAATGTGCGATTGGCCTCCCCCAGGAAGCGGCTTACATTAAACCAGGAGAATCAGAA
GACGATGATACTGATGAAGATAATTGGTTGAAACGAGGCGAAATTGAATTCGATAATGTG
TCCATCAGATATAGGCCCGAACTTCCATTGGTATTGAAAAATATCAGTTTAAAGATTGCA
AGCGGTCAGAGAATCGGAATTTGTGGAAGAACGGGTGCTGGAAAGTCTTCCATAATGACG
GCCCTTTATCGTATTAACGAACTGGCCTCCGGTCGAATCACCATTGACAATGTAGACATC
TCAACACTGGGTCTGCATAATTTGAGGAAAAGACTATCAATTATTCCTCAGGACCCCATT
CTCTTTAAAGGAACAATCAGGAAAAACCTTGATCCCTTTGGACAAAAAACTGATGAGGAA
CTGAAAGTGGCGATGATCAATAGCGGCGTGCCCAGCGATCCTAAGTTCGACTTGGATAGT
CAAGTCACTGACGGTGGAGGAAATTTCTCCAATGGTGAACGGCAGCTACTCGCCTTGGCA
AGGGCTACAGTTAGACAGTCAAAGATCTTGATTTTGGACGAGGCAACGTCCTCAGTTGAT
TACGAGACTGACTCAAAAATCCAAACGACAATTGCTACACAGTTCAATGATTGCACAATC
CTTTGCATTGCGCATAGACTAAAAACTATTCTAGACTATGACAACATCGTTGTGGTCGAG
AAGGGTGAGGTTGCAGAATATGACACTCCGCTGAATCTGTTCAACAAGAACGGAATTTTC
AGGAGCATGTGTGATCAGTCCAACATTTCAAGGGGAGACTTCCCTACTAAAAATTGA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>PAS_chr4_0188 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTGGAATTACGAGTATACCTAACAGGTTTCTAGAGTTCATCCTTCCTAGCTGAAGGGTAA
TTTTACAAAATACTGCAGAAAAGACTTTAAGCAAAACATTGTAAGGGACTAGCCTTTTTT
CTTTAATTCAGTCAACATGTAATGACCTTCCGATCGATAGGCTTGCACTAGTTAGGTATT
CCACTTGTTACATTCACCAGTCGATGTTTTACACCTTTGAAGAGATGAATCATCGTCCCC
AGTAGGCCTCCTGAAAGTGGTTTCTGGCCGTTTGATAGCCGAATATATGCATGAATAATG
TATGCTAGGGGGATACACTAAGGTGGGGAGTAAAACACAACAGTAATAGGTGTGGGCAAA
TGTCAGTTATATGATAGTCCAAATTAGTCAAGAAACTATTGAGACCAACATTTTCAACCT
GCCTTCCCCTAGACTGCTTAGCTCTCTTGTCGTTATACGTGAATCTTTTTTGCACATGTA
ACTCAATGTACCTCCTTTGAATCCAAAGGGTGACTCTTCCCTATTTTGCCATAATCCTGA
GTAATATAGTCTTTCCCAACGGTCCAAGGCGTTGAGCCAAATGCCCTTGATGTGACGTCC
AATATTCTCTTGAAGATTGTAGCACATCTGCAACATTTCCTCTGTGAAATCACAAAACTT
GTCACTAACGCGCTTCACTACCTTTTCATTCGTTAATACTATTTCTCTTTCAAACTAAGC
TCCGCATGAACCATTTTTCAATGTGAAGAAATGCAGATACAGTCCAGCCTACAAATATGT
CAAAACTGCAGGCAAAACATTTCACAGCTGTGGGCGTCAGATCTAAGTTATCTCCGTTGA
GATCTCTTGGCAAAAATATTGTTTCGTGTCACATGATTTGATGTACTCCACCCACCCAGA
GCGAAATTATTAATCTATGCTCGCTTTGTCAGATACCAAGACTGCCAGAAATCTTTCCCT
TTCTGTTTAGCCTAGTCCTACCATACACAGTCCCTGAAAG
|
|---|
| Chr coordinates |
Chr chromosome 4 from 384342..388298 |
|---|
|
|
|
|
