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Locus Information
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| Standard Name |
Uncharacterized |
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| Systematic Name |
PAS_chr4_0873 |
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| Alias |
PP7435_Chr4-0077 |
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| Strain |
GS115 |
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| Description |
Specific translational activator for the COX1 mRNA |
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| External sources |
Open in GenBank 
Open in KEGG
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Gene Sequence
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Hide Seq |
>PAS_chr4_0873 size 3063
ATGATTTCCCGACAGATAAGGAGACATACTCTACGGCTTCGATTGGAGTTTTGCATAAGA
ACCACTAATAAAACTGGACTTGAGTGTGATGCCCCTGCTGTCTCCATGGTGCGTTCTTTT
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CGCAATTCAGTCATACCCCAAAACTCTCTGTCTGCTCAAGAGAAAGCTCAACTAACACAG
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CAAATATTGGACGAGCTATTCCATTTGATGTTGACAAGCTCTCAATACTCAAAAAAATAT
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TACGCAGGCACCCTTTTAATGCTTGGAAAAGAACTGGAGTTTGAGTCTTTTATTTGTGGA
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TGCTATCGCATTTATGGACACCTTGAATTACTTGACAACCAAGTTTACAGGCAAAACTTA
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ATTATAAACTTTCATTTGACCTCTAAAAACTATCAGAAGGCAATCCGCCATTTTAACGAG
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ATCCTAATACTAGCAAAGCGATTCAAACAAGTATGCAAACTATTTGTCACTATGCAAAAG
TGGGTAGTCCCATCCGAATATCACTATGCTACCGCTATGAGGACCGCTTTGAAACTTGGT
AACGGGAAACTGGCTTTGAAGTACTACAATCAGATGCTTTTTAAGAAAGTTTCTCCTGGT
CTTTCGTCGTATGTTTATCTTATCCGTGCGCTTATAAGTAACGTTCCGGTTAACAAGGAT
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GAAGAAGCCAATTGGCAAATTTTTGAGCTAATTTTCGATCTGTATGTCAAAAGTTTGGCG
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GCTTATCTTGTGGCAAATAGGTTGTCTACTGTGTGGGCCGTTAAGCTGAGGCATATGATA
CAGGTTAAGAACTACAAATCTATCATTCCTCTCTTACGTCATTTAGAATCAATCGGCTTC
AAGCTTTCGAACTATGCCATGAATGAAACAGCTAGATCGCTTTTGATACATCACACCACT
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CTGCGTGCGATAGAGAAATTTATATCTCAGCGCGTTGAAGGTAAGGAGCGTGCTCAAGTT
CTCATGAGGTTTAAACATTTATATCCCATGACTATGGCCCGATATGATGATAATATATCG
CAACTTGACGAATGGGAACGGATAACGCAGGAGAACAGGTCGCTTGATTTCAAAATCAAA
AAGAAAAACCCTGCAGTTAGACCAGAACGATTGGTACCACATGTGTTGCAGACAAAGAAG
AATACTGCAAACGATGATGGGGAGCCTGTATCACCTGTACATATAGAAGCTAGACACAAT
TAA |
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Promoter Sequence
Download FASTA
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>PAS_chr4_0873 upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAACAGAATTCAGACCAATTTCTCGCTGGTGGAGTAAATGGCGAGTTTTACATTTATGAG
AGAGTGAAGAAGACTCATTTTAATTATCTGAGGAGGCACCTGGATAATTGTAAACGGCTA
GTACTAGAAAAGTATTCGACAGGTCTGATAGATTGCCCTTTTGAGTTTTCTTTGCCAGCA
CTACTTGATCGCAAAGAAAAAAATGTTATTAATGGTGATTTTTTAAATCGCCAAGATCCA
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TTTTTAATCTTTTCCAGTAAATTGCCTATCCTGGGTCCCATCATGGGTTGGCCTGTTCGA
GTTCTTTTAGAGAAAATCTCTTTTCTTGACTCCCTGCTCAATTTTTTTTGTTTGATTTGG
TCAAGTTGAATTCTAGTTCGTTCAATTTTCTCTATTCTTCTATGCTCCTTTCGTTCCTTG
GCCATCTTAAGCCTTTCCTGATATGATAGTCGGTCAGGATGCTTGAGGTTATCATTATGT
AAAGCTTCTCTATGCTCCTGCCTTTCTTCTTGTACCTTATCAGCATGTGGGTCGTTCACG
ATCACTCCAGTATTAGCAGAGCTTGTTGTTTCAGCCTGTTCGTCATCCTGTTGCAAGATT
TTGAAATATTTTTTTCGCAAACGTGCTCTATGAACCAGTGATCTCTTAATATCCTCAGAT
TTCTTTTTCCTCAGATCTCTCCAATCTGAGCTTTTAACCCTGCCACTCATATTCACTAGT
GTAACTGGTTGAATAATTGATTAAATATCAATAATCTTTTTCGTTTGCCTTTCCATTGAA
ATTCGCGCAGTTATTGGTCTTGAATCTTTTTTTTCATCATCCTATTATTATTCCTAGAGT
GCTAGTTTTGTAATCGACCAACTGCCAAATATTGTACTCCAATCCTGTGGTTTCCCGGGA
TAAAACTTTTTTATCACAGGTGCCTCGTGCCCATATTGCA
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| Chr coordinates |
Chr chromosome 4 from join(1639563..1641796,1641871..1642699) |
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