N.C. Yeastract
K.phaffii
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name PAS_chr1-3_0102
Promoter Sequence

Consensus
CYCCNY: -926 -223 -200 -100 -99 -98 -50
>PAS_chr1-3_0102    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTAGTTTAAGCCTTTTGAGTCGAATGTCGGGGTGCACTAGAAAAGTATTTACCTTCGGG
ATTGGGAGTTTCTACTCCGTAAGCAATTTCCATCACCTTGTGATTGGTGCGAGTGTTCCT
TATGCGAATTTCGGAGCAGCTGTAATGTGTGACGTTCAACGACCTAGGCCTCCGAGCTTC
GCAAATGGTAGGGACTAACAACATGGGAATTGTTGTGATCGTACATTGGTGTAAGGGCAA
CAATCGATTTGGTAGGGCATCAGGATAGCTAAAGGGGAAACAGTAAAGCCTTGAAGCCAG
ATAAGAGTGAATGGGCAACTGATGAAAGGAAATTCTGAGACTAAGGTAAACAAAATAAGG
TATTCTTGTAAGAGAATGTGTGGTTGGTTCAATAAATTTATTATATAATTAACGTAATAC
TTTTGGATTGAATTTCAATATTGCAGCTCAAAAATGGGTGAAATTTATGTGAGAATCAGA
AGTAAATTATATATCTAATTTGCCAAAAGACATTAAATAATAGACAATTGATAATCAATA
ATAATTATTTGTCTTTCTTTGACACAGTGATGAAACAGTAGTTAGTATTCAATTGCTCTG
ATTATGTAAGTTAATATAACATATATTAAATAATCCCACCCAAATCAATTCACTAGTTGA
CCTTCGTTTTGATCATCCTTAATTTCCCTCATCCAATTGTTTCCCGTGGCATCCCAATTT
GTCCTCAAAGTGAAATCCGCTCAATTCCAAACCATCGACAACGTCATCACCTGATAGCCC
CAT
TCATCTAATCACTGGTACCCCGCGAAAATTAACTCAACTGCCACATTTCACTGGAAC
GTTCCAGTTGATCTAAGAAAATCCCTCACTATCCGGGATTATCTAGAACCTTCTAGAAGT
CCCCCCspan>Tspan>TTAAAAACCAGGTGATGCCTTTTAGGCTTTGGTATTTAAGTACCCCCATTACC
CACAACTACTTCCACACTATCCAAACGATCAATTAAAATC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CYCCNY: -723
>PAS_chr1-3_0102	Upstream Sequence Complementary Strand
AAATCAAATTCGGAAAACTCAGCTTACAGCCCCACGTGATCTTTTCATAAATGGAAGCCC
TAACCCTCAAAGATGAGGCATTCGTTAAAGGTAGTGGAACACTAACCACGCTCACAAGGA
ATACGCTTAAAGCCTCGTCGACATTACACACTGCAAGTTGCTGGATCCGGAGGCTCGAAG
CGTTTACCATCCCTGATTGTTGTACCCTTAACAACACTAGCATGTAACCACATTCCCGTT
GTTAGCTAAACCATCCCGTAGTCCTATCGATTTCCCCTTTGTCATTTCGGAACTTCGGTC
TATTCTCACTTACCCGTTGACTACTTTCCTTTAAGACTCTGATTCCATTTGTTTTATTCC
ATAAGAACATTCTCTTACACACCAACCAAGTTATTTAAATAATATATTAATTGCATTATG
AAAACCTAACTTAAAGTTATAACGTCGAGTTTTTACCCACTTTAAATACACTCTTAGTCT
TCATTTAATATATAGATTAAACGGTTTTCTGTAATTTATTATCTGTTAACTATTAGTTAT
TATTAATAAACAGAAAGAAACTGTGTCACTACTTTGTCATCAATCATAAGTTAACGAGAC
TAATACATTCAATTATATTGTATATAATTTATTAGGGTGGGTTTAGTTAAGTGATCAACT
GGAAGCAAAACTAGTAGGAATTAAAGGGAGTAGGTTAACAAAGGGCACCGTAGGGTTAAA
CAGGAGTTTCACTTTAGGCGAGTTAAGGTTTGGTAGCTGTTGCAGTAGTGGACTATCGGG
GTAAGTAGATTAGTGACCATGGGGCGCTTTTAATTGAGTTGACGGTGTAAAGTGACCTTG
CAAGGTCAACTAGATTCTTTTAGGGAGTGATAGGCCCTAATAGATCTTGGAAGATCTTCA
GGGGGGAAATTTTTGGTCCACTACGGAAAATCCGAAACCATAAATTCATGGGGGTAATGG
GTGTTGATGAAGGTGTGATAGGTTTGCTAGTTAATTTTAG
w3c xhtml validator w3c css validator