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Orthologs
Standard Name
VPS53 Systematic Name
C1_00130C_A Alias
C1_00130C, C1_00130C_B, CA3859, CaO19.13513, CaO19.6094, CAWG_01352, Contig4-2998_0005, IPF21026.1, IPF4632, IPF4632.2, orf19.13513, orf19.6094, orf6.6247 Allele
C1_00130C_B Strain
SC5314 Description
Uncharacterized ORF; (orf19.6094) Ortholog(s) have role in Golgi to vacuole transport, cellular sphingolipid homeostasis, retrograde transport, endosome to Golgi and GARP complex, Golgi apparatus localization External sources
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>VPS53 C1_00130C_A
ATGGACTCGCCGACGTATGACCCCACGACACATCTAAATAAAATATTTAGTTCTCCCGAT
ACGTTGAATGAGCTACCTCAATTGTTAAACCATGTGTCGCAGTACAAGAGACAGTTGACA
GAGGAGATTAATAAATCGACAGCCAAGTATGAGAGGGTTGATTTGTCGGAAGATATTTCC
CATCTTGCCACTAGCATTGGCGAAATCAAACGCGATTCCAGTATGACCAAACAATCGATT
TCCCAAATGACAGGCTCGATACAGAGATTGGATTGCACAAAGAAGAATTTGGTTGCGTCG
ATGACCTTGCTAAAGAGATTACAGATGTTGGTTAATGTGAACAACACGTTGAGTTCGATA
TTGCCGAGCCACGACTATAAGGAGATATATCAGTTGTTGGGTGTTTTGAAGGAGTTGCTA
CAGTTTTTCCAGCCGTACAAGTCGATTGACGAGATAAACCAAATCAATCTTATGGTTGTC
CACACCCAGAACAAGTTGATTGATGATATTTTTATGGATTTTGAGGAGTACAAGAACAAG
GATGAAGAGCAGTTGTTGTTTGGCGCCAGAATTTTGGAATTGATTGATGTAAAGTATAAG
GACAAGCTACTTGCGTGGTTCTACAATTTACAGTTGCAAGATTTGCAGGAGATTTTTAGT
GGCGAGGCTGGGTCGTTAGACAATTTGAATCGGAGGTTCATTTATTTCAAAAACATACTC
AAACAGGTTCAGCAGTATAAGATTTTTCCGTGGGACATTTCTAATGCCATAACACAAGAG
TTTTGCCAGATTACTCGACAGGATATATCAAAGTTGTTGTACAACTCCAAAATCGAGTCA
AAGACGCTTTTGGATAATTTGACGAAAACGTTGGAGTTTGAAAAGTCTTTGGGTTTGCAC
AACGAGATTTCGCTGGTGTTTGAGCCGTACTTGTCGATCTGGGTGCATGAGCAGGATAAG
TATTTGAATTCAAAGATGTTGGAGTTTTCGGCCGTACCGCAGTTACCGCCTGACGTGCCC
AATATTGCTGTGTCGTCGACCGAGTTGTTTAAGATCTTTAATCGGTTATTGTCGCACATC
ACTAAGCTTACCAATGGCGATACCATTGTTGATTTGGCAAGGGTGTTTAACAAGTACTTG
CTGGAGTATAATCGGAGGATTTTGGCTCCTATTTTGTCGACCGACGATTTTGGTGCTGAG
TCGTTGAAATACTTTACCATGTTGTTGAACACAGGCGACTATATTATCAACAATATTGAA
GAGCTTGCCGACAAGATCCAGAAAACGACAACGCACACTATTGCGCCGTTCAACACCGAC
GCGTTTTACCAGTTGATCAATAAGAGCATTTCCAGTTTATTGCTTAAAATGTCGATTGAT
TATAAGCCGTGCTGGCGGGAATTTTTTAATTTGGATTGGGGGCAGTTGGATTCGGTGAAC
GATATTTCGTCGTACATGAACGATTTGAAGAGCAAGACCGCAGAGAACTTGAGGGTGATT
CTTCCGCTCATTATCAGGGATAGCTATGTGCGTAATTTTAACGACAAGTTGGTCGAGATG
TTGGTGACCACTATAGCTAACAACCTCAAGTTTGTCAAGCCAATGACTGCGACGAGTGTT
GAGCAGATACTTATGGATGTGTCGTCGTTGAAGGAGGATGCGTTGAGGTTTCCGTTGTTT
TCGGTTAAAGATGTCTCCAAGTCGTACCAGAAGTTTGTTAACCACCAGTTTGGGGATTTG
CAGAGCTTGCTTAAGTTGTTGATGGTGCCGTCAATTCCCGTTGAAAATCTTATTGAGAGC
TATTTTGCGTTGATTGGCGACAAGTCGGTTAGCAATTTTGTCAAGGTATTGAAATTGAAG
GGGGTCGACAAGGCGCAGCACCATAAGTATGTTGACAACTTTAAGTTGCAATTGAGTGTA
GATGATGGGTCGGTTACAAGCTGTTTGTTGTTGCAGAATTTGGAGGAGGAGGAAGAGGCG
TCACGTGCCGCGACCCCGGATGTGAAGTTGAATGAAAAATTTGATGTGAGCAAGATAAAC
GAGAATTTTAAAAATTTTGGTAAATTTTTCCGTAAAGATATAGGTAATGAAAGTAGTTAA Promoter Sequence
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>VPS53 C1_00130C_A
CTGGCGGGTTGTTGTTGTTGACCACTTCGATATTTTCTGCGACATAGTTGATGATATCGC
CCTCGTGGTTGATTTGCGGGACAATTTTCCATGTATCGCCAAATACTGACCCATCCTTCA
ATCCACCCATTAAGAACAACTCATTTTTTTCGCTAGCAATAGATGCGGCTGCGTGTCGGT
ATCTGGGGAAGGGGGAATCAAATAATTTGAACCGGTTCCATGGGGTTGTCACTGACAAGT
TGGCGTGAGGCGGTGGCCTTGAGGTGTGGGCTGGTTGATTGGAAATCAGTGGCATTGGAG
CTGCTGAGGAATGCAAAATGCTGGAAAACCTGCTTGTAGATTTTCGGTTTGCTGAATTGG
TTGATGAGGAAGATGAAACTGTAGTATCAGGGTCCAGTTGATGGTCTTTTTTCTTTAATT
TACCACCTAACTTAAAGAGAGCCATAAATTATTATCCAAATTTTGAAGTGAGGGGGGGGT
GGAGGTTAGTTGATAAACAAACCGGTGAAGAAAAATTTATATTAAAAATTTCTTCTCGTG
GGAAAAATTCACAAGAAACAACAAAATTGAGGAGAAAAACAAAAAAATGTTGGACAATTT
TTTTTGGAAGTTATACAGTTGTCAATAAGGAAAGTGGGAGGTTTTTTTGAAAAAAAGTAT
GATCTACAAGAAATGGGAAATAATTGTATATTTATATAGAAATAAAATAGACTTTAGGGG
TTCCCAAATGGGTCGAGATTCTGTCAATTGGTTATGGGTATAGTTTTGACACAAAAACAG
AGAGGAAAAAAAAATTGATTTCCTAATTAGGCAACTCATTTATTACCACGAATATACTTG
ATTAGGTTAAAAGATTGGCCGAATAGATGAGGATGAGATCCGTAGCGGTTATGTAAGATT
GGTGGGGCAATAAAGGTGTAAACAAAACTATGTTGTTGTGTAGAAAAAAAAAAAAAACAT
CAACAAAAAAAAATTCCACGATAACTCATTCACCAACGAA
Chr coordinates
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:21714-19615C
