|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
RPA190 |
|---|
| Systematic Name |
C1_10670C_A |
|---|
| Alias |
C1_10670C, C1_10670C_B, CA2368, CaO19.1839, CaO19.9397, CAWG_00367, Contig4-2684_0001, Contig4-2684_0002, IPF10842.2, IPF25490.1, orf19.1839, orf19.9397, orf6.4247 |
|---|
| Allele |
C1_10670C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.1839) Putative RNA polymerase I subunit A190; Hap43p-induced gene; flucytosine induced |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>RPA190 C1_10670C_A
ATGGATATTTCTAAACCAGTAGGTTCAGAAATTACTTCTGTTGATTTTGGAGTGTTATCT
GACGAAGAAATTAGAAAACTATCCGCCAAACAAATCACGAATCCAATCGTATTTGATAAT
TTGGGTCATCCAATAAATGGTGGGTTATACGATTTATCACTTGGTGCATTTTTAAGAAAT
GTATGTACAACATGTGGATTAGATGAAAAATTCTGTCCTGGTCATTTGGGACATATTGAA
TTACCTGTTCCTGTTTATAATCCAATGTTTTTCAACCAATTATATATTTTCTTGAGAAGT
GCTTGTTTGTATTGTCACAAATTCAAACTTAATCAATTAGAAGTGCACAACTTTGAATGT
AAATTACATTTGATTCAATATGGATTGTTATTGGAATGTGTTGAGTTAGATAATATTATG
GCTAAATCCTCTAAATCCAGTAGTGTAATTGATGTTGATGGCGAAGACAATGATGATGAA
GAAGGAGGAGGATCAGTAGATGAAAAATCTAAAAAAGACCTTATGAAACGTCGTGAATTA
TTTGTTAAAAATGCTATTGAAAGTGCCTTGAAAGACGGTAGAACTAATCATAAGGGAGTT
GTCACTGCTTCTGTTTCTGAAGAAAGAAAAGCAACTATTCATGAATTTTATAAAAGATTA
TTGAGTAGACCAAAATGTACCAACTGTGGTATGTATTCACCAGGTTTCAGAAAAGATGGG
TTTACCAAGATTTTTGAAAACTCATTAACTGATAAACAAATAACAAATAATCGTGTAAAA
GGTTTGCAACGTCCAGATATGATCAAGAAAAATGCCGGCAATGGTAATGGTAATTCTAGT
AGTACTGGAGCAGCAAGTGATCTTCCAAATATAAAACACAAGGGAGGATCCAAATATGTG
TTATCAACTGAAGTTAGAAATATTTTGAGATCATTATTCCACAAGGAACAAGCAATTTTA
CAAAAAGTTTTCCATTCGAGACCTTACCAACACGACCCAATTAGTGGAGACCTTTTTTTC
AAACAATCAGTTTTAGTTCCTCCTACTAGATTTAGATTGCCATCTAAATTAGGAGATGAA
ATACATGAGAATGCTCAAAATGAATTGTTATCAAACATTATTAAAACATCTGTTCTCATA
AGAGATTTGAACGAAAGAATTACCAACATGTACAAAGAGAAAATCAGTGGTGAAGACAAG
AAAATCATTTTCAATAGATTGATGAATGCATTTGTGACTTTACAAAATGATGTCAATGCC
TTTATCGACTCCACAAAAAACCAGAATGCTCCAGCAGGGAAAATACCAAATCCAGGTATT
AAACAAGCCTTGGAAAAGAAAGAAGGGTTATTTAGAAAACATATGATGGGTAAAAGAGTG
AATTATGCTGCTCGTTCAGTCATTTCCCCTGATCCTAATTTAGAAACTAATGAAATTGGT
GTTCCACCGGTTTTCGCCAAAAAATTGACTTATCCTGAACCCGTTACCTCTTATAATGCT
TCTGAATTGAGACAAGCAGTCATAAATGGTCCAGATATCTGGCCCGGGGCCATCCAAGTG
CAAAATGAAGATGGGTCTTTGATTTCATTGATTGGTATGACATTAGAACAACGTAAAGCC
ATTGCCAATCAATTATTGACTCCTAATGGAGGTAATTCAGTTGTTGGTAAAAAAGTTTAT
AGACATATCAAAAACAATGATGTGGTTATTATGAATCGTCAACCAACATTACATAAGGCT
TCTATGATGGGTCATAAAGTGAGAGTATTACCAGGAGAGAAAACTTTAAGATTACATTAT
GCCAATACTGGTGCATATAATGCTGATTTTGATGGGGATGAAATGAACATGCATTTCCCC
CAAAATGAAAATGCTAGAGCTGAAGCTTTAAATTTAGCAAATACTGATAATCAATATCTT
ACTCCAACTTCAGGTTCTCCATTGAGAGGGTTAATTCAAGATCATATTTCTGCTGGGGTT
TGGTTAACCAATAAAGATACATTTTTCAATAGAGAAACTTATCAACAATTGATATATGGT
TGTATTAGACCTGAAGATGGTCATACTTTGAAAAATAGAATTGTAACGGTTCCACCAGCA
ATTTATAAGCCAGAAATGTTATGGACGGGTAAACAAGTGATTACTTCCGTATTGCTCAAT
ATCAAACCAGATAATGTTCCTGGGGTTAATTTGATATCTAAAAACAAAATTAAAAGTGAT
TATTGGAGTGAATCAAGTACTGAAAATGAAGTTATTTTCAAGAATGGTGAATTATTATCG
GGTATTTTAGATAAATCACAATATGGTGCTTCTCAATTTGGTATTGTCCATTCATTACAT
GAAGTTTATGGTCCAACTGTTGCTGGTAAGGCATTGAGTGTTTTAGGTAGATTATTTACC
AATTATATCATGATGACGGCATTCACTTGTGGTATGGATGATTTAAGATTGACTGATGAA
GGGAACACTTGGAGAAAAGATATATTGAAACAATCGGTTGATATTGGAAGAGTTGCAGCT
ACTGAAGTTACTAATTTGGATGAAGACACTAAGAACAACAATAAAGAATTATTAAGAAGA
TTGGAAGAAATTTTAAGAGATGATAATAAATTAGGTATTTTGGATGCTATTACTCAATCT
AAAGTCAATGCCATTACGTCTCAAGTTGTTTCTAAATGTGTCCCTGATGGTACTATGAAA
AGATTTCCTTACAATTCTATGCAAGCGATGGCATTATCTGGTGCTAAAGGTTCTAATGTT
AATGTTTCACAAATTATGTGTCTTTTAGGACAACAAGCTTTAGAAGGTAGAAGAGTCCCC
GTTATGGTTTCTGGTAAGACATTACCATCTTTTAAACCATTTGAAACTGATGCTAGAGCT
GGTGGTTATATTAAACAACGTTTCTATTCTGGTATTAGACCACAAGAATATTATTTCCAT
TGTATGGCTGGTAGAGAAGGTTTAATTGATACAGCTGTCAAGACTTCTAGATCGGGTTAT
TTACAACGTTGTTTGACAAAACAATTGGAAGGTGTTCATGTCAGTTATGATAATTCTGTA
AGAGATGCTGATGGAACGTTGATTCAATTCCTTTACGGTGGAGATGCCGTTGACACTACT
AAACAATCACATATGAATCAATTCAAATTCTGTGTTGACAATTATGATGCCTTGTTGACC
AAATATAATCCTGGAGATATGACAGAAAACATTGATACTGATTTGGCATTATCATATTCC
AAGAAAGTACGTAAATCGTTGAAGAAACAAAAAGATGTACCACATTATGATCAAGTTATT
AAATATGATCCAGTTTTGAATGTTTATAATCCAGCTAAATATTTGGGATCAGTATCAGAG
AAATTCCAAGAAAAATTGGATACTTATGTTTCTAAGAATCCAACCATATTTGCTCAATCA
AAAGAAGAAACTAAATCTACTGGTAAGATCACCGAAAAGAAATTTAGAGCTTTGATGCAA
TTGAAATATATGAGATCATTAATTAATCCTGGTGAAGCCGTTGGTATTATTGCTTCTCAA
TCTATTGGTGAACCATCAACACAAATGACGTTGAATACTTTCCATTTTGCTGGTCATGGT
GCTGCAAATGTTACTTTGGGTATTCCACGTATGAGAGAAATCATTATGACTGCCTCTGCT
AGTATTAAGACTCCCCAAATGACATTACCTATTTTAGCCGATGTTAATGATGAACAAGCC
GATGCATTTTGTAAATCGGTTGCTAGAGTTGTTATGTCGGAATTTGTTGATAAAGTTGTT
GTTACTGAAACTACATCTCAAGATGTTGATGGATCTAATAGTAGATCATATGTCATTGGG
TTGAAATTCTATACTAAAGAAGAATATGAAACTGAATATGATATTTCTCAAGAACAATTA
GAAGATGTCATTACAAGTAAATTCTTACATGCATTAGAAGGACAAATTGTTAAAGAAGTC
AAGAAACAAAAGAAACCTGATTATATGCCAACTGTTGGTAAATCAGCTGGTAAGACCGAT
ATGGAAACTGTATCTGGGAAGATAAAAGAAATAGACAATGACGATGATGATGAAGATAAT
GAAGTTGATGAAGATCACGATGAAGAACAAGCTAAACAAAATGTCAAACAACAAGTCTCA
TATGAAGGACCAGATGATGATGAAATTGAAACCATGAAAAAAGCTGAAGAAACAAGTGAT
GAAGAAATGGATGGTGACAATTCTTCTAGTTCTGATGATTCAGATCTGGATAGTGATAAC
GAAGAAGATGCCGATGCCGATGTTGATATGGATAAACCATCTAAATCAGAATTATCACGT
TCTGCTAAAGATCGTCAATCTGAAGTTATAGCATCCCATAATATGGTGACACAATTCAAT
TTTGATGATGAATTGGGTGAATGGTGTGAATTCAAATTAGAATTAAATGGTAATGAAACT
CAAAAATTGTTGATGGTTAATATTGTTGAAGATTTATTACGTAAAGTTGTTGTTCGAGAA
ATTCCTCATATTGGTAGATGTATTCGTCCTGAACCAGATGCTAAAACTGGTAAAAGAATA
TTAACTACTGAAGGGGTTAATTTCCGTGCCATGTGGGATCAAGATGATTTTATTAATGTC
AATGGTATCACTTCAAATGATGTTTATGCCGTTTTGAAAACTTATGGTGTTGAAGCTGCC
AGAAATACAATTGTTAATGAAATCTATAGAGTGTTCGATACTTATGGTATTAGTGTTTCT
TCCCGTCATTTGGATTTAATTGCTGATATGATGACTAGAGAAGGTACTTATTTGGCATTC
AATAGACAAGGTATTGATAGTAGTACATCGGCATTTATGAAGATGTCTTATGAAACAACT
TGTCAATTTTTGACTAAAGCAGTGTTGGATGGTGATCGTGAAGAATTGGAATCTCCTTCT
GCTAAAATTGTTATGGGTAAATTATCAAATGTTGGTACTGGTTCATTTGATGTATTTGCT
CAAATGCCAAGATTATGA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>RPA190 C1_10670C_A
CCACCACAAGATTCTATTGACAATTCTGGTATATTAACAGTTGAAGTTCTTAATGCTGAA
GGGTTACCATCTGCCGATAGTAATGGGAAATCAGATCCTTTTATGCAAGTTTTCTTAAAC
TCTGACAAGGACCCGTTCACCAAAACCAAAACTATCAAGAAGACTCTTGATCCAACTTGG
AACCATACCGCAACCGTTGAAGTGGCCAATAAATATGATTCTGTATTGAAGTTTGTATGT
TACGATTGGGACATGGCTGATAAGAATGATTTATTGGGTATCGGTTACGTTGAATTGAGT
GATTACGATTTGAAAGACGGTTCTGCTGATGTTACAATTGAATTAGAAGGTGAAGAAGGT
GAACCAGCAGGTGTAGCTTATGCTAAACTTTCATTTAAACCAGAATTCATTTTAAATGTT
AAGCCAAAGAGCTCTGGTACTGGTATAACTAAAGTCGGAAATGTTGGTGTTGGTGTTGGT
AAAGGTGTAGGCAAAGGTGTCGGTAAAGGTGTAGGTGCATTAGGTAAAGGTCTTGGTGGG
GGAATTAAAGGAATCAGAAAGGGTTTACATCTTGGTCATTCTGAATAATCGTTTTCAAGA
GTACTTTTTTAAACTATCTGGCTACACCAAGAATTTTATATTTTATTGAGTTTCTTTGTT
TTTTTCTTTTGATTATGTAGACATGTATATCAACTAATCAATATTGAATTGTGTATGATA
TTGTTATTGAATTACAATTGGAGTTAAGTAGTAGATGTGCGTTCGCAAAACAAAACCAAA
TAACTAATATACTGTGAGCGAGAGATGAGCCTACTAATAATAATTTTTGTTACTTGCGAT
GGCAGACAGAAAAAGAAAAAAATTTTTTGCTCTTACCCTTTTTTTTTTTTCATTTTGTTT
AATCAACATCCCTTGAAACTATCCATATCATTTTTCTCCTATTTATAATACTTCTTATAT
TGTATAAAGAAAAGAAACATTCATATATACAATTTTCAAA
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2369207-2364210C |
|---|
|
|
|
|
