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Orthologs
Standard Name
C1_11090C_A Systematic Name
C1_11090C_A Alias
C1_11090C, C1_11090C_B, CA3310, CaO19.2307, CaO19.9843, CAWG_00325, Contig4-2919_0001, IPF24977.1, IPF8808.2, orf19.2307, orf19.9843, orf6.5543, PFS2 Allele
C1_11090C_B Strain
SC5314 Description
Uncharacterized ORF; (orf19.2307) Ortholog(s) have role in mRNA 3'-end processing, mRNA polyadenylation, pre-mRNA cleavage required for polyadenylation and mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex, nucleus localization External sources
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>C1_11090C_A C1_11090C_A
ATGTATAGATCTCATAATAATAATAACAATTATCACTCTCGTAATGATGGCTCCAATGGA
CGAATAAACAAACCAAGGGACCCTAAACTGCAAGATAAATACGTGGCGTATCAACAAAAC
ATTGAACAACAATTGGCAAGTCAAGAAAAGAAACAAGCGTATAGAAGAATCACCGATCAT
GGGAATAATATGGGACGATGGTATATTGAGAAATCATTAGGATTAACTAATAGATCACAA
CAGGCAATCGGAACTATACGACCGGAATCATCATATTTAATTGATTTATTACCTTCATTG
GCGTATAGTTCATCATTCAATTTAAATCGAAGAAATAATAAAAACAATTTAGCTGTATTA
GATTTACAAACGAAATTTGTTCATTTGTCTTCAAATAAAGTTAAACACACGATAAACACT
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TTATGGAATGGGATGACGTTTAATTTCGAGACTATTATGCAAGCTCATGAATCGCCAATT
TTAACAATGAAATATTCCAATCATGATGAATGGTTATTGAGTGGTGATCAAAATGGGACA
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GCAATTAAAATATGGAACTTTAATAATGGTAAAGAGGAAAGAACTTTGAGTGGACATCAT
TGGGAAGTGAAAAGTGCTGATTGGCATCCTAACTTGGGTTTGATTGTCAGTGGCTCAAAG
GATAATTTAGTTAAATTATGGGACCCTCGACTGGCTAACTGTGTTTCTACATTACATGGG
TTCAAGCATACAGTTAACAAGACAAGATTCCAGCCAAATGGGACAGCAAGGTTGTTGGCT
TCTGTGTCAAGAGATAGATCGTGTCGAATTTTTGATTTGCGTACCATGAAAGATATGTTG
GTTATCAGAGATTCCGAAACGGATTTATCATGTGTTGCTTGGCATCCTATCCATGCCTCA
ATGGTCACTACTGCTGCTTACAATGGATCTATAAGTAATTTCTTGTTGGATTCATACATT
CCTGATTCAAATGAATCTGTACCCAAGAGAAGTAATAACAATAGTAATCTTTCCACCAAT
ACTAACAACACAATTGATGCCGTACAGAAAATCCCTTATGCTCATGAAAAGGCTATACAC
GCTGTAGAATACCATCCATTAGGTCATTTATTATGTACAGCTGGTTCCGATAAGACAGCC
AGATTTTGGTCTCGTGCAAGACCCAACGATCCAATGGCTTGGAAAGATGCTGTTTATACT
GATTGTAAAGCTGGTGCTTGGTATTATTCAGTTAATAATAATGTCAATGCGGTAATGGAA
GATCCAAATGCTGTGAAAAATGAAGACGATGAGATTGCTAATAATGACGATCCGTTATCC
AATTCTGGTCGTCGTCGTGGTGTTGGAGCTTCAGCTCTGGGTGGTGCTACTGGTTCTGTT
CCAGGGTTGAGATCTAGAAATGAAACCCCCAACAACGGTTCATATGCAATACCTGGATTA
CGTGGGTTTTAA Promoter Sequence
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>C1_11090C_A C1_11090C_A
TAAATAATCTAACTGCCTTGACGTGTTTTGCAGCATTAGTCAATGTAAAACGATGATAAA
TTCCTGCTGGTAAAATCAACAAATCGTAAGGTGATAATTTAGCTCTAATCCAACGATCTT
GTTTATCTCTAACATCAAAATAACCTTCACCTTCAGCAATATATCTAATTTCCTCATCTT
CATGATAATGTTCTTTGTAAAACTGTTGCATTTTGGCATTATAAGCATCAATATCATTAT
TGAAGGCTGGTAAGTTTAAAGTAACAACATCTCTATTCTTGTATTCTCTTTCAGTAGCCA
ATGCGTCTAATTCTTCCTGGGTAGTAATGTACTTGTAAATAACACCAATTTCAGCTAGTT
GATCAAAACTAACTGGTTCTCCTGAATTGTGATCTTCAGTAAAATTTTCAAGTGTATCTT
TGTTATCATGAAAATAAAATTCGACCATTTTCTTTTAAATTATGAATAGTTATAGGTATT
GGTATATTGAATAGTTGATCTTTAAAAGTATGGTGGTATACTGTGGAGGAGGGTTCATTT
TCTCTTTTCCCTCAATTTTTTTTATTATGGGACATAATATAGAAGAAGCCATGTGCTTCC
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CATACAAACTGTGGATCCAAGTGCCTCCCATTTCTTTTCTTCTTGCCCACATTGTTTCAA
TTTGTTTTGGAAAGAGATATACTTAAAAACCAGAATAACTGAACAATGACTAGGTATTCA
AATTGTAGACTATCAATCAATGACCCCAAGATTAGCACTAATTGGAGAGTATTAACTGAG
AAGGTTTATTGTAATGTCACGTGATACAAATATCAACTGTAGATTCTCTGCGACAAAGCA
ATGAGAGAAATGAAAAAAAAAATGCTTGAGAAACCTCAAAATCTGTACTCCAAAGAATAC
GACAGCCATTTATCTATCATAATACTAATAAAATCAAACT
Chr coordinates
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2444914-2443283C
