|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
RBD1 |
|---|
| Systematic Name |
C1_12290C_A |
|---|
| Alias |
C1_12290C, C1_12290C_B, CA5013, CaO19.5234, CAWG_00212, Contig4-3067_0034, IPF11263.3, IPF13941, IPF13941.2, orf19.12698, orf19.5234, orf6.2435, orf6.7708 |
|---|
| Allele |
C1_12290C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Verified ORF; (orf19.5234) Rhomboid-like protein; similar to putative intramembrane serine proteases; role in filamentous growth; Gcn4-regulated; caspofungin repressed; Spider biofilm induced |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>RBD1 C1_12290C_A
ATGCCTTTAAATACTCCATACCCTGTTGAAAAGAATACTTTCAATATTTCCGATGAAGAC
GACGATTTCCCTACAAGAAATTTAAACGAAAGTTCACCTTTAACACAATCGACAAAAAGA
TATATGAAACAAGATTTTGCCAATTCAGTTACATCTCTACCTTCATTACCTCCCAAACCA
TCACATCTACAACCACAAAATCGTCCACAACATCAACAACAACAACAGCAGCAGCAGTAC
CCATACGGCAACTTATCAGCCAAACAACTGAATAAACACAAACAAATGTTTGAAAATTCC
GTTCCTGAAACCAATAAAAAAGATTATCTTGGGAATACTACCACAGTTAGGGAATTACCT
CCTATACCAGATAATGAGAAACTCCATTCGAAAAATCCATTTTCTGATTCACGTTATGCT
AGTCGTGATTATGATGATGTGGATTTACCTCCTTCACCACCTCATTCAGATCCATTTAGA
AATGATGAAATATCTGATGATGATTCTCATTCAGATTTAAAACATAAAATGAAACGAAAT
GAAAAAAATCGAATTCGTTCATTACGAAGGAAACCAAGATTTCATTATACTAAATTACCT
TATTTTACCATGGTGATTTCTCTTATTCAAATCATTGTATTTATAGTGGAATTAGCGAAA
ATGGCTCATCTTACAGGTTCAGCTTTCCAAACGAAACCATATTTTAATCCAATGTTGGGA
CCACTGACATTTCTACTTATTAATATGGGGGCACGTTATGTACCTTGTATGCATCAAATT
AAAGATATAACCGATGATACTAGTATATTATTCCCCTGTGCCAATTCTACATCAGTAGAT
ACTTATGTATGTTCATTAAGTGAATTGTGTGGATTAACTAAATTAAAATTAAGTAGTGAT
GGTTCTGCATATTTACCTGATCAATGGTATCGTATATTTATTCCTATTTTTTTACACGCG
GGATTTTTACATATAATATTCAATTTATTGTTACAAGTGACAATGGGGTCATCAATTGAA
CGGAATATTGGTATTATAAAATATGCCATTATTTATATTTCAAGTGGTATTGGTGGGTTT
TTATTGGGTGCCAATTTTACTCCTCAAGGGATTGCTTCAACTGGAGCCCTGGGAGCTTTA
TTTGGAATAGTTGCCACTAATATAATCCTTTTCATATATACGGGTAAGAAAAATACTAAT
ATGTATGGTACAAAACATTATGCCCTTTTCATCTGTATAATGATTGGAGAAATTGTTATA
TCACTTGTTTTAGGATTATTACCGGGATTAGATAATTTTAGTCATATTGGAGGATTTGCC
ATGGGGATATTATCATCAATTGTGGTATTAAAAGATCCATTTTGGGTATTTATTGATGGA
ATCATTACTTATCCGAAAAACCCTAGTACTTGGCAACAATTTTTAAATAATTGGAATCCA
ATGTATTCAATTGAAGATAAAATAAGATCAAGATTTTTCATTTGGTGTGGAGTTAGAATC
ATCGCCCTTATTTTAATGATTATTTATTTGGTATTACTTTGTAAGAATTTTTTCAATAAT
GATATTAATAGAGGGAACAATTGCAAATGGTGTAAATATTTCAATTGTATACCCGTTAAA
GGTTGGTGTGATATTGGTCAAGTTAGTGTGACATCAACTACAACAACATCTGACTCTAAT
TCCAATTCCAATTCCAATTCCAATCCAACTACCACTGCTAGTTCAAGTTCATCTAGTGTC
CCAACAACGAGGTATTCAACAATGACTTATACAACTTCAATGCCTTCAAGTGTTGAAAAT
CCTAAATCAAATACTAATTCTGAAGGTACTAATGGTGGATTAAGAAAAAGATTTGCCAGT
AGTTTTACTGGTGGTAATAGTGGTGGTACAGCTAATATCGCTGCACGTGCTGGTGGTGAC
ATTCAACAACAATACGGAATTGGTAGTGGATTATATGTGATAGTGATCTTTTTCACAATT
TCATTTTTGAAAAAGAAGAAAATTATATAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>RBD1 C1_12290C_A
AATATATCGATTTTAAGGTACACAAACACAATCAAGAAGAATGAATAGATTATAAATTGT
TATAAAATTGGAAAACAGTGCTCACATAAAGAATTTAATTTTAGTGTTTCTTGAACTAAA
CCAAAAAAAAAAATCTAAAATTTAAATATAGCATGATAATAATGTAGTTTCAGGAGATAA
ACACACATAAATAAATAAACCCTCAATAGCAGAAATATACAAGCCAATGAAAGGGATAAG
AAAGAGGTCTGTAGTATATTACTAGTTGTTGTTGATCTTTTTTCAACAATGAAAATCCAC
AAAAAAGCAAACGCAAACGCAAACAACAATAATAATAATAAGTAGGAGTAGGAATGGGAT
GTATCAAAAATAAACAAATAGTTACGCGGTGCACGTCCCCAATCACACACACACGCATCT
TACATTAAAACGTTTCCATTCTACACTACTAAGCTAATTTTAGTCAACGAATTAAAAAAA
AAAAATAATACTGGACAACTCACACGCTACACAACAACAACAACAGACAGTTGGAATAGA
ACGAAAACCTTTTTTTTTTTTCCCCTTTGTCAATTCTTCTTTTAAAAAGTCTAAAACAAG
AAAAAGCAGAAAAGCAGAAATTTATATTTAGGAATCAAACATCCCACTTTATTCACAGAA
TTTTTCTATATTTATATATATTTATATACTTGATTATATTTTTGATAACACAGCCCATCC
TTGGTTTTTATTTTATTTTATTTCATATTTCATATTTCATATTTTTATTCTTCTTTTAAA
CACTTGGTCTTTAGTTGTTCATTCCTTTTACTTTTTTTTTTTCTTGTTGGTGTTGTTGTT
CGTGTCAGTTTATTTTTATAATACCCACTTAGGATCATTCCTCATTCGTTTGATAACTTA
TTCCCCAGTTTTGTTTTCCTAGTCACATCTTCTTCCCGCTTTCTCCTCAACAGCAATATT
TTCATAATTATTGATCAACTCCCCTAAAAGATTCAACAAT
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2682487-2680478C |
|---|
|
|
|
|
