PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name C1_12350W_A
Systematic Name C1_12350W_A
Alias C1_12350W, C1_12350W_B, CA1110, CaO19.12694, CaO19.5229, CAWG_00206, Contig4-1973_0007, Contig4-2357_0011, DIS3, IPF10406.2, IPF21994.1, orf19.12694, orf19.5229, orf6.2439
Allele C1_12350W_B
Strain SC5314
Description Uncharacterized ORF; (orf19.5229) Ortholog(s) have 3'-5'-exoribonuclease activity, endoribonuclease activity, exoribonuclease activity, ribonuclease activity, tRNA binding activity
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>C1_12350W_A C1_12350W_A
ATGACAGTATCAACAGCAATTAATAATAGGAAACGATTATCTAGTGGATTAAGTGTTACT
TCAAAAGTATTTGTCCGTTCAAGAAATGGTGGAGCATTAAAAATTGTTCGTGAACATTAT
TTAAGAAATGATATTCCATGTTATTCCACCATTTGTCAATCATGTCAAGATATAATTAAA
CCTGATGCTCAAGGTGAATTACCAAAATTTATCTTATCACTGAATCCAACGAAAACTGCT
AAAGGTGAACCACACTATTTGGTGTTAGATACCAATATTATCTTACATGCCATTGATTTA
TTAGAAAATAATCAATGTTTTTATGATGTAATTATCCCACAAACAGTTTTAGAAGAAGTG
AAAAATCGTTCATTCCCTATATATCAAAGATTAAGAAATTTGGTTAAATCGGAAGATAAA
CGTTTTATTGTTTTCCATAATGAATATAATGAACAAACATATATTAATAGAAATAAAAAT
GAAACTATTAATGATAGAAATGATCGAGCCATTAGAAAAGTAGCACAATGGTATCAAACT
CATTTACCATCCAAAATTAAAACTTTTTTCATTTGTAATGATAAAGATAATAGAAATAAA
GCCATTAAAGAAGGTATTGATGCAAGATCATTAGTTGAATATATTGAAAGTTTACCAAAT
GCTGATGATTTAAGTGATTTAATCCCTCAAGATGATTCTACATTTGAAAATGATAAAAAT
AGTACTACCGCTACAGCTGGTCTGGATGATGAAGAAACTTCATTCCCGGAATATTATTCA
AATGCAAGAATAATGGCAGGTATTAAAAATGGTACTTTATATCAAGGTATTTTGAATGTT
TCATCTTATAATTATTTACAAGGTGAAGTTCTGGTTCCCGCATTTAAAAAACCTTTATTA
ATTCAAGGATCGAAAAATTTGAATCGTGCATTCAATTCCGATTCAGTTATTGTTGAATTA
TTACCAAAAGATAAATGGAAAGAACCATCAACTACCATTATCGAAGAAGGAGCTATTGGT
GCCAATGATAATGCCGCAGATGGTGATGATGAAGAAGGTGGCGGTGGTGATGTTATTGAA
GGTACCAAGAGTGTGATTTCAGATAAAGAACGTATATTATTAGCTCAAGAAGCTATAAAA
GTTATTGGTTCAAAAAATGAGGATAAAAGATTACAACCAACAGCTAAAATTGTTGGAGTA
ATGAGAAGATCATGGAGATATTATGTTGGACAAATTGCTCCATCATCAGTGAATCTTGAT
GATAAGACTGGACATGCTTCAAGAAGTTGTTTTGTTATTTTAATGGATCCTAAATTACCT
AAAATTAGAATTAGAACTAGGAAAGCTAGAGAATATTTAGGACAACGAATTGTTGTTGTG
GTTGATTCTTGGCCAATTAATTCAAGATACCCTAATGGACATTTTGTTAGAGCTTTAGGT
GAAATTGAAAGCGCTGAAGCAGAAACTGAAGCATTATTATTGGAACATGATGTTGAATAT
AGACCATTTCTGAAAAATGTATTGGATTGTTTACCAAAGGAAGGTGATAATTGGGTAGTC
CCAGATATCACTAATAATACTGAAGATCCTCAATTACAGAAAAGAGTTGATTTGAGAGAT
AAATTAGTTTGTTCAATTGATCCACCAAATTGTGTGGATATTGATGATGCCTTACATGCT
AAACAATTACCTAATGGGAATTATGAAGTTGGAGTCCATATAGCCGATGTCACTCATTTT
GTTAAACCAAACACTCCATTAGATCAAGAAGGTGCCTCTAGAGGAACTTCGGTATATTTG
GTTGATAAAAGAATTGATATGTTGCCTCAACTTTTAGGAACAAATTTATGTTCTTTAAAA
CCATTTGTTGATAGATTCGCTTTTAGTGTTATTTGGGAAGTTGATGAAGATGCCAATATT
GTCAATGTCAATTATATGAAATCAATTATTAAATCAAGACAAGCATTTTCTTATGAACAA
GCTCAATTACGTATTGATGATCCATCACAACAAGATGATTTAACTAAATCGATGAGAATT
TTATTAAAATTATCGAAAAAATTAAAACAAAAAAGATTAGATGCCGGGGCATTGAATTTA
GCATCACCTGAAGTTAAAGTACATATGGATAGTGAAACTTCTGATCCACAAGAAGTTGAA
ATTAAAAAATTATTAGAAACAAATTCTTTAGTAGAAGAATTTATGTTGTTTGCCAATATT
TCTGTCGCAAGAAAGATTTATGATGCTTATCCACAAACGGCTATGCTTAGACGTCATGCA
GCACCTCCAGCAACTAATTTTGAAACTTTAAACGACATGTTAAATGTTCGTAAAAATGGT
ATGTCGATTTCATTAGAATCGTCAAAGGCATTGGCAGATTCTTTGGATAGATGTATTGAT
CCTAATGATAAATATTTCAATACGTTGGTTCGTATTATGTCGACTCGTTGTATGATGGCA
GCAGAATACTTCCCTAGTGGATCTTATGGATACCCCGAATTTAGACATTATGGGTTAGCC
GTTGATATATATACTCATTTCACTTCCCCCATCAGAAGATATTGTGATGTTGTTGCTCAT
AGGCAATTGGCCGGTGCTATAGGTTATGAAAATTTAGATTTAAGTCATCGTGATAAATCT
AAAATGGAAATGATTGTTAGAAATATCAATAAACGTCATAGAAATGCTCAATTTGCTGGA
AGATCAAGTATAGAATATTATGTGGGCCAAGTCATGAGAAATAATGAATCTGAACATGAA
GGTTATATTATTAAGATTTTCAATAATGGTATTGTGGTTTTAGTGCCGAAATTTGGTGTT
GAAGGATTAATTAAATTAGAAAATATGGGTGATGTCAATTCAGCAAATTATAATGAAGAT
AAATATGAATTGACATTTACCGATTTTAAAGGTAATGAAAGAACAATTGCTGTTTTCGAT
AAAGTTAAAGTTGATGTTAAATCAGTGAAAGATGAAATTAGTGGTAAAAGAAAAGCTCAA
CTTATGTTAAAATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>C1_12350W_A C1_12350W_A
ATCTATTCAAAAGAGTGATTAATTCACGATAATGGATTTTTTTAACTCTCGTCCCGGATT
GAGTTTTTTCTAAATAATCATCAAATCCAATGAATTTTTGACTTTGAATTTCTCTATCAG
GTACTACTCTAACTGGTAATTGTTGATATTTTTTCAAGACAGCACGTAACCTATTCATAT
TATCTTCATGAACTGGATTACCACCATAATATGTCATTAAAGTAGGCACAGTTCTTACAC
GATTGATTTCTCCTATGTTTAAATTCTCAGTGACTTGTGAAGATGTGTATGGAGATCTTT
GTTGTTGATGTGGTTGTTGGTTACGACGGAATCTAGATTGGAAACGAGGTTTGGTTGTTG
GTATTTCATCAGATGTTGTTGTTGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTTGTAGTGGTTGATTGAA
TAGTTTCATTGAGTCTAAAAGTTGATTGATGTAATGATCTTTGAGGTATATTTAACCCTC
TAAATCTGGTTATAAGTCGTAAAGCCATTGCAATTAATTCGAGGCAATCACTTCACCGTG
GTTTGTTGAGGCTAAGTTACGATCTTGTTAACTTGAGAGTTGATCAAAGGCCAGTTTGAA
AATTTTTCCTCTCTCACTAAATGTTTTAAAAAAGTGTTGGTTCATTTTACACGACATTAC
AAAGTCCTACAATGACTTTATTCACAGCTGAGCATATGCTATATTAATTTCACTTTATTA
TTTGATCTATATAAAAGATATTTATTTATAATGTATAGCAACTTCATGTGGACCAACTGT
CTTGTAATGTGGGTGCCTGTTTCTGTTGGTGTTGTATAACTGATCCAATGGAACACCAAT
CATATCTGTGTGAGGACAAATTTGTTGTATGGCAGCGGCGGCAGCGACAACCTCCCTCGT
GCGAAGAGTTTGATACCAGAAAGAGGGCAACAAAAAAAAAATTCAAATCCAATTCGATGA
GATTAAACGATATCTTTTTCATTACTTCACAATCCCAAGT
Chr coordinates Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2690712-2693726W
w3c xhtml validator w3c css validator