PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name IRA2
Systematic Name C1_12450C_A
Alias C1_12450C, C1_12450C_B, CA1967, CaO19.5219, CAWG_00196, IPF10866, IPF10866.2, IPF21959.1, orf19.12686, orf19.5219, orf6.3680
Allele C1_12450C_B
Strain SC5314
Description Verified ORF; (orf19.5219) GTPase-activating protein; negatively regulates RAS by converting it from the GTP- to the GDP-bound inactive form; Spider biofilm induced; flow model biofilm repressed
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>IRA2 C1_12450C_A
ATGAGTGATTCCATAATGAAAGATGACCATTTTATATTTATTCAGGCGTTGGCGAAAAGA
ATCGAGTCATTGTTACCAAATCACACCGGTCGTAGCATAGAAGAAGTCGAACTTGACCAA
CAGTTCTCCATTACGAGAAAATTATTATTAGAGAACAATAGTAAAGACCCCAGAACAGTA
ACGTATATTTTGGTAACTTTTGCTTCCATTTTAAAGACCATTAATACTGAATTCACTAAC
AACAAACTCAAATATCGTGATGATAAATCAAGAAACTCAATTTTATTAATTTGCAAATTA
CTTGCTGACGTTTTGAAAGTGAGTTGGGATCGAGAGTCTACTATTGTGGATGATAAAGAT
TTTTTAAGCAATTACTCAAAGTTCTATTATTATGATACTCCAAACAGAATAGAATCGTCG
GTAGTTTCTGATTTGGTTGATACATTTGTCAACATGATTTCATCTAGTGTTGTTAGGAAA
GTGGTGTCACTAGTGCGTAATGAACAAACATTAACAACCCTAATTGTGGCCAAAGAAGAG
TCTGAGATTTTGCGTGAAGACCAACTAATGACAAAAGAGGAAGAAACAGAATTGGTGATA
GGTAAAATTGATTTTTATTTGGATACAATAATTCGATATATTGCTACCGCCAATCCTGAA
GACTATTATGATGTTTTAAAGGCAAAAATTTTCAGGTATTCTCAAAGAGACGCAACAATT
CCCTTACCCGTTTTGCAGACATATTTACCATTGCTTAAATTCATTTTTTTTGCAAAAGTT
AATTCAGTCACCATTGTGGACGATACTTTGAAAGCCTTACCATGTATAAGGTCAAATACT
TGGAAACAAGTATACTTGCATTTTCTAGCTAGCAGCATCAAAGCTCAATCTTTTTCACGT
ACTTTAGATTACAATGTGTTAGTGGATTTAAATGATACCCATCAAACTCAAGTGGCGCGA
AGCTTGTTTGACATATCATTTAGCCTATTTTCTGATGAGTCCTCCACAAATCTGTTTAAC
TCGCCATTTGTTTTGATTTGGTTTTTCGTTATTTGTCTCGAAGATGTTATTGAAGTTAGC
AGCGATAAGCCATTAAACAAATTAAAGCTAACATTCAACAAAAGGCTAAAATTCATAATG
TCACAGTTGAAAGAGAGCAGTAATGCTTCTAGTTTGGGAAGTTTTGATTCATTTATCCAT
CTATTTCATTTAGGTGCCCGTTTACAAGCATATAACCAATTATGGCATCCAATTTATAAG
TTTAGCATGAAATTTCTCGATGAAATCCACCAAAATTTGATAAAGTTTGGCGAAGTTCGC
AAGGACGACCTTCTAGTTGATGATGATTTGCTTTTCAGATACGATTTACTTACAGTTAAT
TTCTACTTGGCAGCCATTTTGATAAATTCAGATAAATACATTAGAATTGTCATCAATAAT
TATAAGCAAAACCAGGAGGATCTTCGGTTCAACAAAATTTTTGTCAAGATAATTAAAGGG
TTATCAGAAATTCAGACAGCCAAAAAGTCGTTTTTTGCAACAATGAAACAAGTGACACCC
ACTTTGAGATTAATGGTTTATGGTGCTTCCAAAATCTTGTATCAATATGAAATTCGACGT
AGTATCAATCAAATAAGTCAAGGTAGCATTAATGGTTCTTCAGATGCTTCTACAGCTTCA
TATATCGACAATGAACAAAACAGTGACGAGGTAACAGCTGCCACTCAGGAAGCTTTTAGT
CGAATCAAAACAAGTCTAGATCATTATACAGCGGACTTATTTGACACTGACTTGAAAAAA
CTAAATAGTAGTAAAAATTTTACTACCTCATCATCTTCAGTATTATCAACTTCAACTTAT
AGATTCCGAGTTGTCAATGGAGCAGAAGAGTTATTGTCGGACATTTTTCGAATATTTGCA
GCAGCACCAGAATTCTATTTCAATGATGAAAAATTAATGAGTAAAAAAGTATACGAAACC
AAACCATTATCAGAATCACTTCCACCTATAATAAGATTTTGTCATGACGCGATTATCCCA
ATAAGATTAGCATTCAAGTCAAAATGGATAATTCAAGGAGACACACGATTATTGGACTCT
ACAAAAGAGCTATCATTGAAAATGGTGGAGCCAACCACTAGTTTGATTGACATTCGTACT
GACTTATCGGTTTTTGCAAATTTTCAAATTTGTTGTTGTATTATTTACGTCACCTGTGAA
GCATGTTTATCCATTTCATTACTTAACCCAAAGTTTAAATCCTGCTTTTTGTTTTTAAAC
TCGTTTTTGCAAAAAAGAACCTACTTTAATAAATTTGTGATTGAGAATCCTATCTTGACC
AACCCAGATACTCGAGTGTATTTGGGATTTTGTGGAGATATTATACATTCTGTGGAAAAA
GTTTTGTTACTTTCGTTATGTACCCATGACATACTGTTTTATAATTATGCATTGCAAGGG
ATTGATTGGTATCTTGATGAAGTGGAAACTAACAAACCTTTCTATCCATCTGAGGATGTT
CGTGATACTTTAGTTGACACATTTCAAAAAATCCTGGAAGATAAAGCTGTTTTCACTGGG
TTTGTCAGCCTTCACAAGCGCCATAGAAATATTTTGCGTAATTCCAAACCGACAAAGTCA
TTATATCAAACATGGGTGACCATTTATCATCGATGGGTCAGAATCCTTGATACCAAATCG
AGCTTAGGAAATGACAAAACACTCATTTTGAGACATTTCACTGGATTCCTTGTCTCTACT
TCTGGTTGTTTCTTATCAGGCAGTCTAGTCTCTGAAGAACTTGCGGCAAATACCTGGCCA
ACAGCGCCTATTTCCGAGTTTTTCGATAAGTGTATCGAGTTGTTAACTTCACCTGACATG
GTGATTCAAATGATTATTAAGGAAGCTTTAGCAAGTGAATCGCAAGCAGAAGTATATTGC
TTGACTGCTCGAAAGTTAATGGAAACAGCAACACACTATTTTGAGAATAATAAATCAGAT
GAAATTGCAGTTTTTCTAGATCGTGCAATAATAGTTATGACGTCCATGATAAATGTGAAA
AGCGAGGGAGCACTTTATCTTTCAACCTTGTTACCAGAAATTTGCCAGGACTTTATCAAA
TTTATCAATGCAATAGATGATCCATGTGAAAGATTCAAGTTGCAATTAAGGTTTTGCAAA
CTTGGATGTGCTTTAGAATTAGATCGTACAAATGCCGGTTTAAATGGGGCTTACAAATTG
AGAAATCTATACTCCAGAGCAAGTTTGGAATGGTTAGAACCAGCTGTATTTTATGATAGT
GCACTTGAGGAAAACATAAAAGCTGATGATAGCTCGAGTGTGAAAACCAATAAAGAAGTT
GAGCTTCTGCATTTAGCATTGGATTTTGCAGTTGAATGTTCTATTCTTTTACGAGGACAA
GTAGAAAACTTATTATTGGAAGTTCCAGATGGCATCAAAGAAGATGAAATCAATAAATAC
AAAGATTTGTCCTTTAGTGTTTATTTCTCATTATTTTACAAAGTGATTCAAAAATATACT
AAAGCAACACCAACTAATCGTGAAAAACATAAGCATCATATAATTATTGATAACATTCTT
CAATCTATCACAAATATTTTACAATATGACTCTCAGATTGGAATGAGATTTATTTTACCA
ATGGGATATCATGAAAGCAAGAAAATCAGATCAATCTTTTTGAATGTCTTTTCAAAAATG
TTAGTTCATCAAAGCAAAATTTCCAACAGGGAAGAGTACCCAGATAAGTTGATTAATGAG
TTGACGGATCAATTTGAAATTTTTGGTTCTATTGCAGAATGTGCTTCTTCATTTGAACAT
AATTTACTAGCATCTGCATTTTTCGAAGTGTTTTCCTATACCGGGAAATTGAATAATTTG
TTTAATGTCTTGTTAAATACAGAAGTAGCTCTTCTGTCGAGGTCCACGGATTTGTTCAGA
AGAAATTCAACTTTGACAAAGTTTTTATCATTTTACGCACAAACTAACGGGGTTGATTAT
TTGAATGAGGTTTTGTTACCTGTTATCAAAGAACTTGTTGATAATGATGTGCAATTTGAA
GTTGAAAAGCAAGACAATTCAGATACCGCAGATCTCTTCATATTATATTTATCAAGAATA
ATCGATCTGATTGTGAATTCGACTGACAAATTGCCGCATGCATTCAAACTGGTAAGTAAG
GCAATTTACGATTCTGTGTCGAATAAATTTCCTGAAGCTGCACTCACGGCCGTTAGTTCT
TTTGTATTTTTGAGATTCTTGTGTCCCGCAATAATCAGTCCTGAACAACATTTCAAACTT
CCAATTAACAACCCCAAAGTTAAAAGATCATTAATGCAATTGGTAAAAGTATTGCAAAAT
ATGGCCAATGGAACTTTGACGTCTATTAAATGGCCTGCAATTGCCGGAAAAACTGAAGAA
TTGAATTTCTACAATCAAAAAATTGATGGATTTTTGAAAATTATTTCCACAGATGTAACA
ACGGAGAATCAAAGCGCTGAATTATACAAACCCGAGAAACCATTAACTTCGTTGAGATAC
TTGCACAAGTTCATTTACCATTACTTTGCAAAAATAAGATATAACTTTCTTTTCCAACAC
TCATGGAGATGTAATTACCTGTTGCATGATAAAGCAGTGAAATTTAAAAAATTTGATTAT
CTAGTAATGCAAATGGGTCAACCAAATCCTGGTGTTAAATTACAGATGTCCAGTAAGTTG
AAGCTTTTAGATACTAATAACCTAGATGAGGAAGAAATTAAACTTAATGATTTTATGACA
AAAATGTCAATCAAATTTTCTGACACACCACCGGATGCAATTGATGTTATTCATAGTTCA
ATTTTCAAAGATGGTACACCAGCAGTAGTGGTTAATTTGAAAAAATTGAGTGGCCGACCA
CATGATTTTGAATACTTGGCTTACAAATTAATAGAAACTGCATCTCAAGTGTGGGATAAC
AAGTTTTATTTGGTATATGATTTTACAGAATATTACTATTATATTGAAACAGTTACGATT
GAATATGCTAATTTGATTGCAAACAGTGGCACCAAACTATTGTTCAGTAATTGTCAAAGA
GTTTATTATTTCAATATACCTAGAATTGAGAATCCGGGTATTATGGAAGGTGTTAAATTG
GTTAGATCAAAGGGAGAAAAATATGGCACTAAAGTTTACATTTACTCGCTTGCAGACCCT
GACAGTATCATTAAAAATTTATGTCTTGATCTGGAGACATTGGCAATTAATCGTGAAAAT
AAGGTCACCTTCAAAGACGTTTTACTATATGACGCAACAACTGAAAAATTCATGCCTGTA
CAATTCAAAATAGGAAGAAGATTTGTTACATTATGTTTCACTAACAGAGTGAAATTTGAT
TATATTGCAAGTGTTACAGATGGGTTTAACCCAGTCGAGGTTTATCGTATCAGTGAAATG
AACAAATGCGAAGTGTCCAATTTTACTGGGAACAATGACGAATTTACAATTTATTTGAAT
CGTGGGGTCCAACTTACTTTTAGGTCGCAAGATAGACTCGAAATTTTAAGATATTTGTAT
TTTACTATTTCAAGATTACCAAGGGAACCATTTAGTTTGAATAATGAGTTGGATTATCAA
AATGAACGTCACACCATGCATTGGTTTGGCAGATTATATAATATTGTTTTCCAAGGGTTG
TTGAGTCATGATGAAGAATTAAAGTCAAAAGCGGGAGTTTTGTTTGGCTCTTTGTCAACA
TACTTTGAAATTGATTTTGGAATTCGTGAGAACCATGCAAGTAATGTTCCATTCCCAGCT
GATGCTACTAATTTTGTTGTTACTGTTTCAGCACATTTAGCGAAAACATTCCCTCAAATG
ACATATCGTTTTTTCAAAGCATTTTTTGATAATTTCGATCGTATAGATAGGGAGACCAGG
TTTACATCTATTTTGTATTTATCACCTTGGATTCAAAACATATATGAGTACGTGTTTCTG
AATGATGAGAATGGTGCTGATAAGACTGCGGATTTGCTTCGATTGTTTTGTCGTCTTACA
TCAATTTATAAAGACCGCATTCCATTTATTAATGATTATATATGGTCCAAATTATTTCAA
GAGGCAAGATTGGTATCGACTTTAGTGGAAGAGGTAGTAGCATTTGCTATTGATAGTAAG
AATGATAATCCAGACTGGACATTTATTATTGCAGTGATTTGTCCATCAATAGAAGTTTGT
GGTGAAGTTACATCGAGATTATTACAAAGAATCAATAAAGTTGTGACAACTGATTCATCT
ATTGCCTTACAATCGAAATTGTTTGAAATATCGGTTTTAATTAAGATTTGCTCATCATTG
TTTTTCAATTCATATAACCTTGCCAAGACTTATTTGGCCGAGTTGATTTTCTTTGTTACT
TTGTTTATTGATAATCCTGTTTTGGATGTTGGAGAAGATTTACAAAAATTGCTTATGACG
GCAATTCAGTCTTTCTTACACAAGCCAAATTTGACTGAAGCACAACGAGCTGAAATAGAT
AAAGCTATTGCGTATTTTTCAACTCCAAGAGCTAAGATGATTTTCGGTACCAGTAGAGAC
GTAACGAAAAGAAATGATGCTGCACAAGCTTTCAATAAAATCACAAATATCGAACAGTTT
GCTGATTACTTGAATGTTTTCATCAAGGCATTTGCGTTACACGGAGATAGAACTAACTGG
CGAGCTAGATGGTCGTCTAATACTATTGATGTCGCCTTTAACAACTACTCAGTATTTCAA
GATCGAGCATTTTTGATGGTAGGGATTCTTTCTAAAGAAGGTATTAGTGATTCAAATGCA
TGCCGAACCATAAAGTTAGTTTCTAATGGTGAGTTAAATAGTATTGATATAACCATTTGT
GTTGCTGTTGCCGTTGCCAGAATCTTAGATGGTTTACCTGATAGTTCCATTTTACCACCA
ATTTTGATTTGGCCACAATTATGTTTCACATTATTGAATCATGCTGTACTTTATCCTTCT
GGGTTAGAAAATGTTATTGCTTCAATTACAAAAATAATGAGACTTGGACCAAATTATTTG
GACACTATATTTGAACAACAACAATATTTAGAACCCGATTTATCTAAATTCCAGGAAAGG
CATGGTTATATAATAACTAAAGAGAATTTTGGTGTCCACATATTTTTCATATTGGGTCAA
GGATTAAGAATTTCTCAATATAGACACTTAGCAATTGCGTGTATTAAGAGATATTTTAAG
CAAAGATATTTAATGAGAGAAGGGAAAACAATGGATGGGAAATTTATAACAAATAACACA
TATGCCTATATTTTCTATCTTTATTTGTGTTGTGATGCCAAGGAGGTTGAAGATTATTTG
AAGGAGCTTGAAATCGATCGTTCGTTTATATCTTTAGATGATAATCAAAAAATTCCTAAA
TTATTAATTGACTTGTTGTTTGACAATACTGAAGTATCCAAAATATTAATGATACATGTT
GGATTTTTGTTCTGTGACATTCAAGGGGTCGATATCAGTTTTAAAGCAAGATTTATTCAA
ATCTATCTTTATATGCTCAAGAATAACAGAGAATTGGCATTACTTGTGTATCATATCATC
AAACCAACATTGATGCATGATTTGTTGAATACAGTTTCAGTGGAAGTTGTTAAAAATATT
TCTGAAATAGTGGAGATTGTTTCCCAATGTACTGATTATGATCCAGAGTATCACAAAAAT
GTTGTTGATGATATATTAATACTGAAAAAAATCACAATTCTTAAAACTTTGAGACATTTG
AAACCACTTAGTGAAACCATAGATGAAAACCAAATATTCAAACCTGAATTTGATTCTGAT
ATTAAACCAATCCAATCGATGCTTTATAGAGCTGCATGTAGTTACATCAGTGGGTCGAAA
TTGGAGGATTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>IRA2 C1_12450C_A
CCGTTTGATTAAATATTTAATCATTCTCCGTTCAATTTAGATTGTCTCATTGAAAACTAT
TACTAAACTTGCTCAAAACTCCTCCTCTCTCTTTATAATTGTATTCTTTAAACAATATAT
ATATACATCGTAATTGCTTATGAACGTTGATTGCTTTTCTTATGATTATCTGAATTTGAT
ATAAAAATTTGCTTTTTTATTTAATTAGAATTTACTTTCCTCCCTTCACTCATCTCCCAC
CTACCCCCCTATTTCTAGTACATTTATTTAGAGTTTAAAAAAGATAGTATAGTATAAAGT
GATAGATACCATCCACAAACTATACTCCAAACTAAAAGAAGAGATAACAAATTACATTAC
ACTTTTTATACAACTTAAAACAACAACAACAGTATTAACAAGGTTTAGTGTGTGTGTGCG
TGTCTGTCTGAACAAAAATTTTGACAATCAAGAAATTTTTTTTTACTTTCTCACTCTTTT
CCCTACTACTACTGTTTACTGCTTGCCTGCTTACTTCTCCCTCCTCCAACTTAGTTAACA
GTTTTTTTTTTACAACCACCACCAAGTGTGTTTTGTTGAAAGTGTGTGTCTGTATTTTTT
TTTGCTTGGTTTTTTTTTGGATTTAAATTTTTACAACTCCCAATTGATACCATCCACTCA
TAACCACATATATATATCGCAAGTTCAACGGTATTATAGATATTGATTATTTGATCTCAT
CAATTTACTTCAACACATTTGAATTTATAGAGAAAAAAAAACATATCCACACCCACATCA
TCATCAAACAATATCCACTTCAAATTTACAGCCAACACAACTGAAAGAAGTGGACTACAT
ATCAAACCAGATCAAACAACCACTGCTATCAATTATCAATACTCACAATATTGTCAAAAT
CAACAAACTTTTCCGGAGTTTTTTTTTATTTTGGCTTTTTCAATTCACATAGACATTATA
TTTGCTTCATTGTTATTGATAAGAGTTGTTAATTCCACAA
Chr coordinates Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2716906-2708975C
w3c xhtml validator w3c css validator