|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
C1_12670C_A |
| Systematic Name |
C1_12670C_A |
| Alias |
C1_12670C, C1_12670C_B, CA3509, CaO19.13713, CaO19.6356, CAWG_00175, Contig4-2678_0002, IPF19783.1, IPF20795.1, orf19.13713, orf19.6356, orf6.5785, PRP6 |
| Allele |
C1_12670C_B |
| Strain |
SC5314 |
| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.6356) Ortholog(s) have role in mRNA splicing, via spliceosome and U4/U6 snRNP, U4/U6 x U5 tri-snRNP complex localization |
| External sources |
Open in CGD
Open in KEGG
|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>C1_12670C_A C1_12670C_A
ATGGAAAGGAAATCATTTTTAGATCAAGAAGCACCTGAAGGATATGTTGCAGGTCTGGCA
AGAGGTGCTGTTGGATTTAGAACCAGTACATCTCCAGATAGTTTCAATCGAGGAATTGCC
ATTGTACAAAATGAAGAAGAAGAAGAGGATGAAGACAACAATAATAAAACCACAACCCAA
TTGAATGAAAATGGGATTCTATCTACAAAAAAACGAGGTAAAGAAGATGAAGATGATGAA
GAAGCCGATCGAATATATAATGAAATTGAAAAAAAACTACAATCCAAAAAAAGGAAATCC
CCAAATAATAAAAATGACAGAGCCAAGCCGACAGTCACCACCACCAATGACAATTCTTCT
ACTCAGTTTTCTGATTTGAAACGACAATTAGCAAATTTAACCGAAGATGATTGGTTAAAT
CTACCTGAACCTGGTGATATGACAAGGAAAAATAAACGAACAAGATTATTAGAACAACAA
CAACAAAGAATGTATTCTGCTCCTGATACATTAATATCCACTTCTAGTTCAGCCACTGGT
ACCAACACAACAAATTTCAAATCATTATCTGAATCAAGAGATAAATTATTAGGGTCTCAA
TTGGATAATTTATTACCTGCATATGTTAAAACCAATGGACAATCGATAAACAATTCCAGT
AGTGTTAGTGAAGAATTACAACAAAGCATATTGAATATGACAGGAGTTGAACAAGATTCA
AAATATGCTAATCTTCAAAAAAATCGAGTTATTTTATCATCATTACGTAAATCTGAACCT
TATAAACCAAGTTCATGGATTCTGTCAGCAAGATTAGAAGAACAAGATGGGAAGAATTTA
AAACTTGCTAAACAATATATTTTAGAAGGTTGTAAAAAATGTCCTAGAAATGATGAAATT
TGGTTAGAAAATATTCGATTGAATCAATCTGATATTAAATTATGTAAACAATTAATTACT
AATGCCTTGAATTATAATCCTAAATCAGAAAAATTATGGTTAAAAGCTACTGATTTGGAA
ACTAACAACATAAACAAACGTAAAGTATTAATGAAAGGTTTAGAAAAAATACCTAATAAT
GATCAATTATGGGAGAAATTAATTGAATTAGAAAATGATCCTAATATGGTGAAGAAATTA
TTATTAAAAGCAGTTCAATTATGTTCTCAAAATTGGGAATTTTGGTCAGCTTTATTAAAT
ATATCCAACTATGAAGAAAGTAAAAAAATCTTGAATCAAGCTAGAAAATCTATAAAAGGC
GTTAAAAATATATTAAAAGTTTGGATAACTGCTTGTCAATTAGAAGAAAGAGAATATGGT
GAAGAAACAATTGATATTAATAAATTAATTAAACTTATGGATAAAGCCATGAAAGAAATT
TCAATTTATCAAATGACAAAGGATGATTGGTATAAATTAGCTTGTGATTCTGAAAGAGAA
AATTTCAAAGTCACTACTAAGGCCATAATTATTAGTTATTTGAAGTTTAAGGGGTTAGAT
CAATCATCAATATTTGAAGATGTTGATAAATTTTTCAATGATGGATATATTATTGTTGCT
AAATCAATATTAGATTATATTGTTACTAATTCATCTAATGATATTAATAAATGGAAAAAA
GTCTTTAGTGTGATTAAAAAATTCAATCAAGAATTACCATTATTGTTTTCATATTATGAT
AAGGCAATTTCTTTAAATCCTCAAGTACCATTATTCTATTTGATGTATGCTAAAGATAAA
TGGCAATTATCTAAAGATATCCCACAAGCTAGATCAATTTTAAATTCAGGTGAATTGGCA
AATCCAACTGATTTATCAATAAAATTTGCCATTATTAAATTAGAACTTAAAACAGGTAAT
TTACTAAATGCTGAAAAATATATTAAACACATAATTGATACCAAACCAATGGAATCAGAG
AAATTTTGGTATAAATATATTCATATTCTAAGATGTCTTAATAGTGATATAACCGTATTA
AAAGATGTGATACAGAAGGCATTGAAACTATTCCCGAATTGTTGGAAATTATATCTTCAA
AATATTCAAATTTTAGAAGATATTGATGAATTGGAACAAGCAAGAGAAAATGCTTTAGTG
GGTGTTAAAAAATGTCCTCAATGTATATATTTATGGATAAAATTATCTCAAATTGATGAA
AAAGCTCAAATCATAATTCGAGCTCGTTCAATATTAGATCAAGCAATATTGCAAAACCCC
AATAATCCAGAAATTTGGGTTTATAAAATACAATTTGAAAAACGAATTGGTAATTTATCA
TCATTACAAAATTTAACTAATAAAGCCCTTAAACAATTTCCTACTGATCCTTGGTTATGG
ATTATTAATTTATCATTAATCCCGAAAATGTCTCAACGTAAAACAATTTTCTTGGATGCT
TTAAAGGCAACTAATAATTCAAATTTAATATTATTGATCATTGGGGTATTTTTTTGGTTT
GATGGGAAATATTCCAAAAGTAAAAATTGGTTTGAAAGAAGTTTACAACTGGATAATACT
AATGGTGATATTTGGAGTTGGATGTATAATTATTTGAAAAAATTTGGTACCCTGAAAGAA
CTAAACTCATTTTTAATTGATTATGAATCAAAATATGATTCAATTAATAAAGGTCATTTT
TTCAACAAGATCAATAAAGATATTAAAAATTATAACAAATCTCCTAAAGAAATTTTAGAT
ATTGTCGCTATAGAAGTTTTAAACTATATCAAATGA |
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>C1_12670C_A C1_12670C_A
CGATGATTTAGGAATCATATAACCTGGTGTGTCAAATGCCTTATATTGTGCCAGTAAATC
AAATATATAAACTTCACCATTTTCTGACATTGAAGCAGTTAAGTATTCCCCAGTTTGTTG
AGCATGAGGGCTTACTCTTATTCTATTTGTAGTATGTCTTAATGGAATAGATTCTGAATC
TAATATTGGATCACTATCAACATCATCGTCATCGTCTTCATCTTCCTCATCTTCTTCATT
TTCATCTTTAACTAATGTTTTGGCCAATGAAGATGCTTTCATAGCTAACAATTCATTATC
TTTGGCTTTAGCAGCTTGAGTCGCAGTAGCTAAATAAACTGTTGCTGGATATGATCTTCT
TTCATTACCTAAAGAATCTGGTAAAATATCAACAGTCAAACATGGCCATGGTAAATTGAT
ATTATGCAACATTTCATAGACTGTTGGATCGGCTTCTAAGACTTCATCTGGTCCTAATGG
TTTTGATTTATGAGGTAAATATATTGATGATTGTTGTTCTTGTTCTTGTTCTTTGGCTTC
TAATTCTTCAATTTTGGCTTGTGTTGAATTTTCATCAATCATTTCATCATCTTCTTCATC
ATTGTTATCGTCTAATTCTATAATTTCTTCATCACTTTCAAATTCATCACCGTATGGATC
TTCAAATTCCCCAATATCCATATTGTCTGGTTCTTCTTCCTTTCCATTTGTAGTAGTTGG
AAGAGAATCTTTATTAGTTTTAATGGCAGTATGACTGGTGGATCTATTGCCACTTAAATC
ATCTTCAGCTGATCTTTTTGACATCTTTATTGTTGTTGTTGTCGTCTGTAATCGTTATTA
TGAATGTTTTCGAGTGTGACAGTGGAAGATGAAATTTTTTTGTAGTGATGAGATGAGAGG
AAAAATGAATGGGAAATTCTTTGTGTGCGACACGAACTTAATTCATAACCCTCCCGCAAT
ACACTTTTATCATTTAGGAGACTTATAGTATTTATAACTT
|
| Chr coordinates |
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2764434-2761699C |
|
|
|
|