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Orthologs
Standard Name
MSH6 Systematic Name
C1_13170C_A Alias
C1_13170C, C1_13170C_B, CA3705, CaO19.12411, CaO19.4945, CAWG_00132, Contig4-2994_0011, IPF22327.1, IPF5670.1, orf19.12411, orf19.4945, orf6.6045 Allele
C1_13170C_B Strain
SC5314 Description
Uncharacterized ORF; (orf19.4945) Protein similar to S. cerevisiae Msh6p, which is involved in mismatch repair; repressed under Cdc5p depletion; Hap43p-induced gene External sources
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>MSH6 C1_13170C_A
ATGGGTCAGGTATCAACTCCTACAAGATCATCACCAAATGTTGGCTCAAACTCCACTGGG
TCAACAAAGAAACAATCATCCTTGATGGATTTTTTCAAGCCAATGGCATCCAAAGATAAA
CTGAAACCAAAACAGCAACCACTGCCATTATCATCGTCTCCACTCAAATCCAAATCCAAC
GATACTAAACCATTTTTATCAAGTGACAAAGAGAATGACGATCATTCGATAATGGAAAAT
CATAAGAATACTACTTTGGTCACATCTCAACCTGACGATACTGGTGATAAACAAATCAAA
CCACAATTAGCTTCGTCACCCAAGAGAGAGGAATTGAAGAAAGAAAGAAAACAGCAGCCA
TTAAGAGAGAAGACTACAGCTGCATTAAACTCGAGTCCCGTTGCTGCAACTCGTCGTAGC
AAGCAAATTAACTATGCCGAATCTGACGACGAAGAAGAGGTTTTTACCAGTAGAAAAAAG
AGAAGAGTTGTCCAAGATGACAGTGAAGAAGAGGAAGACGACTTTAAGCCAGCCGAGTCA
GGAAGTGACGATGACGATGATATGAGTGATTTTGTTGTTGATGACGACAAAGATGAAGAT
ATGGAACCGGTACTGGATGACGACGATGAAGTAGTTGCTCCAAAAACCAAAAGCAAGAAA
CCATTGTCTAAGTCTTCAAAACCAACTAGTCTGCTGGTATCTGGAATTCTTGGCAGATTT
GATGCTGGTTCTGGTTCTTTTCGTCAATCTAGTTCCGTGGCCACACCAAAACCTAAGAGT
ACCACCATCAAATCTTTAACACCTTCTAAAAAGTCTTTTGAAAAAGAAAACGAAGAAAGA
TATCAATGGTTGGTTGACATCAGAGATGCTGAAAAACGTCCTATTGACCACCCTGATTAT
GATCCAAGAACCTTATACATTCCCCAATCGGCATGGTCCAAGTTTACTGCTTTTGAAAAG
CAATATTGGCAAATCAAATCAAAAATGTGGAACACCGTTGTTTTCTTCCAAAAGGGAAAA
TTTTATGAATTGTATGAAAATGATGCTGTTATTGCCAATACCCAATTTGATTTGAAAATT
GCTGGTGGTGGCAGAGCAAATATGAAATTGGCTGGTATTCCCGAAATGTCATTTGAGTAT
TGGGCCAAGGAATTTATCAGTCATGGATACAAAGTTGCCAAAGTTGAACAAAAGGAATCC
ATGTTGGTCAAACAAATGAGAGGTGGTGCTACCAAGGAGGAAAAGATTATTGAAAGAGAA
TTAAAGGGAATTTTGACTGCGGGTACATTGACTAATTTGGATATGATCAGTAACGATATG
GCTACCTATTGTTTGAGTATCAAAGAAGAAGATAAAGAAGATGGTACTAAAACTTTTGGT
GTGGCATTTGTAGATACAGCCACTTCTGAATTAAACTTTATTGAACTAGATGATGATGCT
GAATGTACAAAATTGGATACTTTAATCACTCAAATTAATCCTAAAGAAATCATTTGTGAA
AAGGGAAACTTGTGTCAAATTGCAACCAAAATTCTTAAATTTTGTACCCATAGTGATCAC
CAAATTTGGAATGCTTTGAATCCAATCACCGAATTTTGGGATTATGATATTGCCCTTGAA
CAATTGGTTAAAGCCAAATACTATGATGCAGAAAACTTGGATGATTACTCAAATTATCCA
AAAGTCTTAGTTGATTTCAAAGAGAACCATCAAGTTGCTTTCAACGCATTTGGTGGGTTA
TTATACTATTTGAAAATGTTGAAATTGGATACAAGTATTATGAGTCTCGGCAATATCCAT
GAATACCACATTTCTCGCAATTCAGCTTCACATATGATTTTGGATGGTGTTACATTGAAC
AATTTGGAAATTCTCAACAACACAAGCGATGGTACTACTAAGGGGACACTCTTCAAGTTG
GTAAATCGTGCAACAACTTCATTTGGTAAGAGACAACTACAAAAGTGGGTTTTGCATCCA
TTGTTTAAAGTTGACGAGATCAACCAAAGATACGATTCAGTTGACTATTTAATGAATGAT
GGATTAGAGTTGAGGTCTATTTTACAAGATACTTTGGCAAATATTCCTGACTTGGAAAGA
CTTTTAGCAAGAGTTCACGGAGGAACATTGAAATTTAGGGACTTCTTAAAAGTTATAGAA
AGTTTTGAAAGCATTGCCGGTGTTAGTTCCAAGTTGGTCGATTTCACCAATGTTGAAAGT
GGTATGCTTTACAAATACTTGAAAAGTTTCCCTCATGAAATGCGTGAATTGATTCAACAA
TGGGAAGATGCGTTTGATAGAGAACAGGCAAAAAATGATATTATAGTTCCTTCAGCTGGT
ACCGATGAAGAATTTGATAATTCACAAGCATCCATGGAGGATTTGAAGACTCAATTGGAC
AAACTATTAAAGGAGTATAAAAGAACCTATAAATCACAAGAGATCTGTTATCGTGATTCA
GGGAAAGAAATCTATCTTATTGAAGTTCCATTCAAACTTAAAGTACCAGGTGATTGGAAA
CAGATGGGTTCTACTTCAAAAGTGAAAAGATATTATTCACCAGAAGTGGAAACATTGGCT
AAAGAGTTAAGAGGTCAACAAGAGCTACACAAAATGGTTTGTGACACTTTGAAGATAAGA
ATGTATGAGAAATTTGATAAACACTACAATGTTTGGATGCAAGTCATTCAAACTATTGCC
AATATTGATTGCTTGTTAGCATTAACCAAAGCTTCAGAAACAATCGGATACCCTTCTTGT
CGTCCAAAACTTATCGAAGCTGATAAAGGTTGCATTAACTTCAAAGAGTTGAGACACCCA
TGCTTTGTGAGCACTAAAGAATTCATTCCTAATGATGTACAATTAGGGGGTGACGAACCT
CATTTTGGTCTTCTTACTGGTGCCAATGCTGCAGGGAAATCGACATTGATGAGAACAACT
GCATTGGCAATTATCTTGAGTCAAATCGGATGCTACATACCAGCTGAACTGGCAGAATTG
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TCCACATTTTTCGTTGAATTGTCAGAAACAAAGAAAATTTTAAGCAATGCCACACCACGA
TCATTAGTTATATTGGATGAATTGGGCAGAGGTGGGTCCAGTAGTGATGGTTTTGCTATT
GCCGAATCAGTTTTACACCATTTAGCTACCCATGTTCAGTCATTAGGATTTTTCGCTACT
CATTATGGTACTTTGGGATTATTGTTCAAGACTCACCCACAGATCAAACAACTAAGAATG
GGTATCGTTGTTGACAGTGGCTCGCGTAATATCACATTTTTATACAAGTTGGAAACAGGA
ACAGCACCTAAGTCGTTTGGTATGAATGTTGCATCCATGTGTGGTATTCCTGATGCAATT
GTTGATAATGCCGAAATTGCAGCTAAGGCATATGAACAAACCTCTAAATTGAAGAAATTA
GCAGAAGAGAGTAAAGGTGATGATATTAGTTTAGGTTTACAAAGTGACTTTGTTTGGTTG
GCCACTGGCAAAATTAATGACTTGAGTAAAGATATACTCAAGTATGACGAACCAATTAAA
AAGAGTGCTCTTGAAAACATCTACAAAATGATAGATAGGTTATAA Promoter Sequence
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>MSH6 C1_13170C_A
TGGATTCCGCTATTGTTCTATTACACGTCTGTGATTTACCCTTTTGGCAATAGAACGTAC
CGTTTACAGGTAAATATGTTGTTGTATACACCAGTCTCAGTCCATCAAAATTGGGGTTGA
TTTTATCAAATTGGCAAGCATCTGCTACTTCTGTTGTTCCCATCAAATTAACCTCAACTA
CAGTTTGTTTAAAATGAACTTGCATCAACAGTTGATAATCTACAAGACATTGTAAATCGT
AATTCAAATTATTGTTAAAATCATTAAACTTAAACTCTTTGAATTGACGGAAAGAACTGA
AATGGTCCACCAAGTTAGTTTTCAATTGGGTGTCCAAAGAGTCTTCATCTCTCAATATCA
AATTGTGGATATTTGTCGTTGGTTGCAAGATTGATTGAAATCGTGCATTAAGATTAGTTC
GACATTCACTGGCAATAAAAGTTCTATCTGTGCATTTGATTTCTCGAATATAAAACTTGA
TGCACGAGCCTTCAACACATTCTCTCATTTCATTGGATGATAACCGGTTGAACTTTTCAT
AACTCGTCATTCCAACCGATATATTGTTGGCAATCTCTTGTAGGTTATTGATTATGATAA
TCTTATCGTGAGTTCTTGTACTGATTTTTAAAATGGGCCTATCTATTTTGCTTGGATTTG
GGTCTGGCAGCACTGAGAGACATAATGAAGTAAATAGTGATAATATCAACCAAACTATAA
TCATCACTAAGTTTGCCGCCTATTGAATGTAATTAAGTGTTGCAAAAGAATACGCAAAAA
ACAAAAGTAGTTAGAGGGATTGCACTTTGAACGCGACAAAATCGCGTCTAAGGGATTTTT
TATATTTTTTGGCGCGTGGTAAACACAACAATAAAAATTTAGGTTGGCTTTTCTTTTAAA
AAATTCTGACAACCAAAACATTTTTCCAAACCCTTAATCACTTTCTTTTTTTAATTACAT
TGGTTTTGACTTATAGTTTTGTATTAATTAATTACTAAGT
Chr coordinates
Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2879164-2875520C
