PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name KEM1
Systematic Name C1_13420C_A
Alias C1_13420C, C1_13420C_B, CA0767, CaO19.4969, CAWG_00109, Contig4-2907_0019, IPF13214.2, IPF28204.1, KEM1.3, orf19.12434, orf19.4969, orf6.1895, orf6.2836, XRN1
Allele C1_13420C_B
Strain SC5314
Description Verified ORF; (orf19.4969) 5'->3' exoribonuclease of cytoplasmic stress granules; role in filamentous growth; complements slow growth/mating of S. cerevisiae kem1 mutant; required for SD or Spider medium biofilm formation
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>KEM1 C1_13420C_A
ATGGGTATTCCAAAGTTTTTCCGATTCATCTCTGAGAGATGGCCATTGATTTCCCAATTA
ATTGATGAAAATCAAATCCCCGAATTTGATAATTTGTATCTTGATATGAATTCTATATTG
CATACTTGTACTCATTCTAATGATAATACAATTACCAGACTTCTGGATGATCAAATGTAT
GCTGCCATATTCAATTATATCGAACATTTATTCCAAATCATTAAACCTCAAAAAACTTTC
TATATGGCTATTGATGGGGTTGCTCCTCGAGCTAAAATGAATCAACAACGTGCCAGAAGA
TTTAGAACTGCTTATGAAGCAGAAATAAATTTAAAGAAAGCCATTGAAAATGGAGAAGAA
ATACCTAAAGAAGATCCATTTGATTCAAATTCTATTACTCCAGGTACAGAGTTTATGGCT
AACTTGACAAATAATTTGAAATATTTCATTCATAAAAAAATCACTGAAGATTCAAGTTGG
GCCAATATTGAAATCATTTTGAGTGGTCATGAAGTCCCCGGTGAAGGTGAACATAAAATT
ATGGAATATATTCGTTCAATAAGATCTCAAGATGATTATAATCCAAATTTAAGACATTGT
ATCTATGGGTTAGATGCTGATTTGATCATGTTAGGATTGGTCACACATGATCCTCATTTT
GCATTATTGAGAGAAGAAGTCACTTTTGGCCCACAACGTAAAGTTGGTCCTAAAGATTTA
CATGATCAGAAATTTTATCTTTTACATTTATCATTATTAAGAGAATATTTAAGTTTAGAA
TTCCAAGAAATTGAAAATCAATTGAATTTTGAATATGATTTTGATAGAATTTTAGATGAT
TTTATTTTAATTATGTATGTCATTGGTAATGATTTTTTGCCAAATTTACCTGATTTGTTT
ATCAATAAGGGAGCATTCCCATTGTTAATTGCTGCTTTCAAACAAACATTGTTAGAAAGT
GACGGTTATATCAATGAAAATGGGAAAATTAATTTAGTCAGATTAAACATTTATATCAAA
ATTTTATCTAAATTTGAATTTGAAAATTTTGAAAAACATGAAGTTGATGTTGAATGGTTT
AATAAAAAATTAGATGATATTTCAATTTCTGGTGAAAAGAAACGTCAAAGAATTGGGAAA
TTATTAATTTTAAAAGAGCAAAAAAAATTAGTTGGATTTATTAAACCCTGGCTTATGGAA
TGGGCTAGTCAACCAATCAATGAAATTTTGAATTTAGATCAGCAAGGTAAATTACCAACT
TTACATTTAAATAAAGATGATGTTGAGAAAAATTTGGAGTTTATTAAAGAATTTGCCATT
GAAGCTGGGTTTTTAATAATTCATTCCCAATCTAATGATACTTATGAAGCCAAATTAGAT
ATTGATGGGATTTCACCTACTGAAAGTGAAGAAGAACATGAAGAACGTATAACTGAATTA
AGGAAAACCATTAAACAATATCAATCGGCTAATTTAATTGAAAGTGAAGAAGTTTTGAAT
GAAACTAAAGAAGTGTATTCCGAAAAATTTCAATCTTGGAAAAATGATTATTATCAACCA
AAATTACATTTCTCCATTGATACCGAAGAAGGTAAAGGTGACCTAATTGAAATGACCAAA
CATTATATTGAAGGTTTACAATGGGTTTTGTATTATTATTATCGTGGTTGTCCATCATGG
AATTGGTATTATAGATATCATTATGCTCCTAGAATTTCTGATATTTCATTAGGATTAGAA
GAATTGATCAATGAAAAAACTGATTTAAAATTTGAATTATCTCATCCTTTTAAACCTTTT
GAACAATTAATGGCTGTTTTACCTGCTCGATCCAAAAAATTGATGCCAGTGGTTTATCGT
CCTTTAATGACCGATGAAAAATCACCAATTATAAATTTCTATCCTCATGAAGTTGACATT
GATATGAATGGTAAAACTGCTTCTTGGGAAGCAGTAGTATTATTAGATTTTGTTGATGAG
AAAAAATTGATTGAAGCATTAAAACCCATTGAATCTAAATTAACCCCTGAGGAGAAACAA
AGAAATTCTTATGGTCATGCTATCAAATTCATTCATAATCCACAAATTGATCATGTTTTT
TCATCACCGTTACCAGGGTTTTTCCATGATATTGAACATGATCAATGTTATGAAGAAGAA
TTCAAATTACCTAAAATTGAAAATTTGAAAATTGGATTTATTAAAGGAGCTAAAACTGGT
AAAGATTTATTAGCTGGATTCCCAACATTATCAACCATTCCATTTACTTCTGAATTAGCA
TTGAATGAAGTTAAAATTTTTAATTTCCCTTCAAGATCAGAATCAATGATTTTGAATGTT
GAAGATGTTTGGTCTGATTTGACCGTGGCACAATTTGCTCAAAGTTTTGTTAATAAATTA
GTTTATTCCAAATGGCCATTTTTAAGAGAATGTCGAGTGGTTAAAGTTGTAAGTGAAGAA
AATAAATTTGAATCAATTAAAACTAACACGGGATTGAAAAAAGTTGTTACTAATGAGTTG
AGTGTTGAAGATAAAAAATCATTCCGTTCCGAAGTTTCTAATCTTAAAGTTACTTGGGAT
AAATTTAAGGGGGTCAAATTAGGTGAAATAAATGCATTAGTTTATGTTAAACCGGTAAAT
GGATTAATTAGGAATCATAAGGGGGCTTATGTGAAGACATATTCTAAAGATGTTGAGGTC
TATCCTTTACAATTGATTGTCAAAGAAGTTACTAATAAAGATCAAAGATATTTGACTAGA
CCACCATTACCAATTGATCAAGAATTCCCTATTGATTCTCAAGTTGTATTCTTGGGAGAT
ATGGCTTATGGATCACCAGCAAAGATTGTTGGATATAATGAAGATAAAACTAAATTGGGG
GTGAAAATTTTTAAGATTCAACTGACAGCAGAACCAAACATTGGTAAAAAGAGATTAACT
ATTGAGAAAAATGAAATCAAATATTATCCTTCATTTGAAGTTGCTAAAACTTTAAGACTT
AATCCATTATTGTTATCTAAAATTACTAGTCAATTCATGGTTCAAGATTCTTCCAAAGGT
AAAGTAAATATTGGATTAGAATTAAAATTTGAAAGTAAACGTCAAAAAGTTTTAGGTTAT
ACTAGAAAACTGAGTAATGGGAAATTTTGGGAATTTTCTCCATTGGCTATTAATTTAATT
AATACTTATAAAACAAAATTCCCTGGGTTATTTAAAAAATTAGTTAATAACGTTAGTGGA
TCCAATTTTCCTACTGTGGATGAAATTCTGAGTCTTGAAGAATTGAAAGAAATTAGATCA
TGGTTAAAAGAAGTGAAAAGTGAATTAATCCCTGTTTCATTAGAAAGTGAATCATTTACC
AAATTTAGTTATCAAGCCATTGAACAATATATGGATAATTATTTATCAATGAATCAAATC
CCAACTATAAATAAAGATATTAAAGGTGTTCCTCGTGAAGCCATTTTGAATGCTAATGAA
TCGTATCAATTATTAAGTGATCAAAGGTTTGAATTAGGTGATAGAATAATTTATGTTCAA
GATTTTGGTAAAGTATCTATTTTATCTAAAGGTACTGTGGCTTCAATTTTAACCGTTGGA
TCCAAAACTTCATTAGGGGTGATTTTCGATCAACCTTTATTGAGTGGTAATAATATGAAT
GGGAAATTGAATTCTAATCGAGGATTAATTATTGATTCTTCATTGGTGTTGAATTTAACT
AATAAACAATTTGTTTATCATTCTCATGCATCAAAAAATAGAAAGAAATTGACTGATGAA
GAAAAAATTGCGAAATTGAAAGCAATAGAAGCTAAAAAGAATCAGAAGCAACAACAGCAA
CAAAAAGAACAACAAACTAAGCAAAAGCAAGTTGAACAACAAAAACAAAAAGGTGCTAAT
GAATTGTTGTCTTTGTTGAAGAAAAAACTGGATATGAATAGTACTACCACTACTTCCACT
ACTGATGGAGATTGTAAGAAAACAGAAGAAAAAGATTATGACAAAAATAATGGTAATGAA
GATGAAAGAGTTGATCCTAATGCAATTAAACAAATTTATGGCCATATTTATTCTAATGTT
ATGAATCAAGGTAATGTTCGTCCTCCACCACCGCCACCAACAGGTCCAGGTCATCCACAA
CAATTTCCTTATGGTATGCCTATTCCTCCACCAGGTGCACCAATGCATCCTGGTTATATT
CCTGTAGTTCCAGGAAATCCATTACCTCCTAGTTTCTACCAACAATATCCACCAAATGGA
CAACAGTTTGTCAATTCACAACCACCGCCACCACCACCACCACCGCCATCACAACAACAA
CAACCTCAAGTAGCTGAGTCAACCTCTGACGAGAAATCAAAAAATGATAACAAGCACAAT
GTAAATGGTAGAGGAAGAGGTGGTTCTAGAGGAAGAGGCGGATATAGAGGAAGAGGCGGA
GTTAGAGGTGGGCGAGGTGGAAATAAATCATCTCATCAAAATCAACCTAAAGATAAGGTA
AAACAAGAATCATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>KEM1 C1_13420C_A
TATTTCAATTCTTTTTTTTATATTAGCTTCTGTAAGTGGAGCCATATTTTCCACTCAAAT
GATGCAGTAGTTACTTGATTTCACCTATTGGTTGATTTGATAGTCTTTGGAAGACGATTC
GTGGGTTTACAGGTAAGGTAGTGTATGTAAAACCAAAAATTGAAAGGGCGTACAATTTCT
ACAGCTTTTTGGCAACACTCAATGTACGTTGTTGTAATTAAAGATAAAAAAGCGTATAGA
ATAAGAAATTATAAACCAGAATTCAGTCTGATGTTGTGTTTTAACAATTGTTGAATTTTA
CATCAAGAGTTTAAAGAGTAGAATGAGAACAAACTTGACACCAGTTTCCCACATACAATG
CACACTTTTATCTCGGTTGCTAAAATTTCAGCATTTCCCATTCTTGGTTGTAAACTTAAC
TCCTTACCTCCCTCCCTCCCCTTAAATATGTTCAATAATCAACTCAAACCCAATGGTCAG
GTTGATTAATTGGTTGGTTGTTCAAGTTGTTAGTTGTTGGTTCTCGGATAATTTATCAAT
CGCCCAAACTTCGAACTAGCACCAGCCAACAGGCAACAGGCAACAACGAACAAAAAGCAA
ACAATGAGAAAATTTTTTGCGTACGAATCTCAAACCAAGAAATTAGAAGGAGAAAGAAGA
AAATCTCAACAACAACCAAAAAAAATGACAAGTTAAATAATTCAGGATTCCACAATTGTT
CACATTTCAGCAACAACAACAACAACAAATCATCATTTTACATTTTACTATTGGAAGAGG
AATTACTATAGAAGATCAATTTATATATCCCCCATTTCAATTCAATCAACTTATTTGTAT
CATAAAGTAAATTACCTTGTATTATTGATTGTATTTGGTTTAAACAATCTTGTGTTTTTT
TTTTGTAATTTCAATCAAATTGTATTATTTCATTACTTTATAGTAAGCATCCAGCATATT
TTGAATAAAGAAAGACAAAAAAAAGAGATAGACATATATC
Chr coordinates Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2930585-2925999C
w3c xhtml validator w3c css validator