|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
HNM1 |
|---|
| Systematic Name |
C2_01210C_A |
|---|
| Alias |
C2_01210C, C2_01210C_B, CA3939, CaO19.2003, CAWG_03896, Contig4-2862_0011, HNM2, IPF19469.2, IPF4757.1, orf19.2003, orf19.9554, orf6.42, orf6.6357 |
|---|
| Allele |
C2_01210C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Verified ORF; (orf19.2003) Putative choline/ethanolamine transporter; mutation confers hypersensitivity to toxic ergosterol analog; colony morphology-related gene regulation by Ssn6; clade-associated gene expression |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>HNM1 C2_01210C_A
ATGACTCAATCAGATCTAAATCAACTGGACTCTGTTAGTCCCCAATTATCATCATTTGCT
ACCGACCCAACAGATCAAGAAAAAAAATTAACTGAATTCAATGATGATAATAAATCAGTG
ACATCTAAAGATGAAGATACCAAAATGTCAAGAAACTTCTCGACATTACAAATTGTTACT
ATTGGATTTGGTCTTACAAATTCATGGTTGGGTATTCTGTCAACACTTATATTGTCTATA
TCTTCCCTTGGTCCCTTACTTGTTGTCTATGGTATTTTGATTGTTGCTAGTGTATCTGTT
TGTATTGCTGTTACTCTTGGAGAAATGGCCCTGGCTATGCCATCAGCTGGTGGTCAATAT
GTCTGGGCTAGAGTATTGGCACCAAAAAAATATTCATCATTTTTAGCTTATATAACTGGT
TCTATATCATGGGGTGGTGCTATTTTCACCACGGCATCAATGAATCTTGCTGTTGCTTAT
CAAGTTTTGGGATTTTGGAATATGACTCATCCAGATCATGTCAATCAAAAATGGGAAGTA
TTTATTATTTATAATATTCTTAATTGGATTTTATTTTTTTTCAATATTTGGCATCGATTT
TTACCAATGATTGGTGATAGTGTTTTCGGGATTTCTTTAACTTCATATTGTATTATTCTT
ATTACAGTTTTAGTTTGTGCTAGAGGTCATTATCAAGATGCTAAATTCGTTTTCGTTCAT
GCAGTAAATAACACTGGTTGGCCATCAAAAGGGATTGCATTTATTGTTGGATTAGTTAAT
CCGGCTTGGGCATTCTCATGTTTAGATAGTGTCACTCATTTAAGTGAAGAAACTGCTCAT
CCGGAACGTGATGTACCAAGAGCTGTTTTATCAACTGTGGGGATTGGATTTGTCACTTCA
TTTACTTTTTCTATTGCCATGTTTTTCTGCATTAGAAATTTAGAAGAAATCATGAATTCA
GCAACTGGTTTCCCCATGTTGGACATTTTTTATCAAGCTTTAGGTTCTACAAAAGTCGGG
GCCATTTGTTTGGGTTCATTAATTACTTTGGTTGCTACTGGTTGTACTTTATCTTGTATC
ATTTATCAACTGAGACTTCTTTTTTCATTCCTGCGTGATAATGGTATGCCACTCTCCAAA
TATTTATCAATCATTGATCCTAAAACTGGTGGTCCATTTTACGCTCATTTATTTTCTACT
GTGATTGTATCTGTGGTATCAGTATTGGTATTTTCTGATGCTGCTCTTCAAGCTACGGCC
TTAGCGTGTGTTTCATTCCTTCTTATTGCTTATCTGATTCCAACAATTTGTTTACTTGCC
AGAAGGCGTCAAATTCGTCATGGTCCATTTTGGTTAGGGAAAATTGGTGTGTTTTGTAAT
TTTGTTCTTTTGGCTTGGTGTATATTTGCCGTGGTATTTTTCAGTTTCCCAGCTAATTAC
CCAGTTACCGCTGAAGGAATGAATTATTTCTGTGTTGTTTTAGTGGTATACATTATTTGT
ATGCTTGGATATTGGTGGTTCCCAATTAAAAAATATGCTTGTAAATATAATTTCAGAGGA
GGTAATTTGAATCAAGAAGAAGTTGAATTCCCAGATGTTTGCTTAACTAAATGGTAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>HNM1 C2_01210C_A
GACGATAAAGTCGTTATTATTAATAATAATATTGACTGTAAACCCAACAAACACGATTGG
TTTCGATGAGAGACAAGGAAAAGATGAAAAAAAAACAAAAATATCACATGCAATTTATAA
TAGAATTTAGTTTGTGAAACAAAAAGAATATCGTGTGCATGTTTGAGTGTTTGGTACCTT
TACGATTTATGAAAGAACAAAGAAACGTCCTTTAAATTTTTTTAACCAACGTTGAATCAA
GATCATCTTGAAATATTTACGATTATTAACTGCAAATATTTTTAAAATTACTTATTAGTT
CTATTACAGATAATGATTTGATATAGCCGATTTCTGCATTAGTCAAATGTAGGGATTACT
TAGTCAAAGGGTCGTTATAATTGTGTAGAAATGACATAATTATTGAAGATGTATGTATGT
ATAATATCTTCATTCCCAACAATAAAATAAAATGAATTACGAAAAAAAAAGGCATTGATT
GCCATTGTTTGGAAGTAAGATCATATTTACTAAATCTAGTTTAATCAATAACCAATCAAT
TGCTCAAGAATACATAAACACTAATTTTAGCCCCACATAATAATTTGGCATGAGGTATTT
TTTTTTTTTCTTATTGTTGTTGTATAAACTTTCGGCGGATGCCGCATGAAGATATCTCGT
AGAATTGGCCACACATAGTTTAAACATAAATCCGCCCGATAGATGACACGACCACGACCT
CCTCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTTCTGATCCCCATCCCCCAAAAAAAAAAATTTTTT
CTTGGTGATTTTTGCGCGGATAATTTTTTTCTTTTTCGTTATTTCTTCCATCAATTAAAC
TTTTAATAATATTTAATCTAATCTAGATCTCTCTCTATATTTTTTTTTTTTTTTTTTCAC
TTTTTTTTCACTTTTTCTTATACTACAACAGATTAGTTTGATTATCATCACTCGTTCCCT
TTATCTTCCTCCCCTTTATCAAGCTCAATCTAAGTATTTA
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr2A_C_albicans_SC5314:203062-201446C |
|---|
|
|
|
|
