|
Locus Information
|
Standard Name |
PRP39 |
Systematic Name |
C2_01830W_A |
Alias |
C2_01830W, C2_01830W_B, CA0493, CA6189, CaO19.1492, CaO19.9069, CAWG_03951, Contig4-2358_0005, IPF14401.2, IPF25748.1, orf19.1492, orf19.9069, orf6.1461, PRP39.3, PRP39.3f, PRP39.5f |
Allele |
C2_01830W_B |
Strain |
SC5314 |
Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.1492) Putative component of the U1 snRNP; involved in splicing; Hap43-induced gene; Spider biofilm induced |
External sources |
Open in CGD
Open in KEGG
|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>PRP39 C2_01830W_A
ATGGCAGTTGAAAATTATCCCAATTCCATATCATTATGGACTCAATATTTATCGTCAATA
TTAATTCATGATAAGGATAAAACTGATACAGAGTTATTTCGAAATGCTTATAAACAAGCA
TTAATTCATAATGGATATGATTTTAATTCACATCCTATTTGGGATATGGCAATTGAATTT
GAAACTAATCAACTGAAACAAAGTAAAGAATTATTAGAATTATATTTACGAATTATTAAA
ATTCCATTATATCAGTATGCTCAATATTATAACCAATTTTCTGAAATTAATAAACAATTT
GAAATTCAACAAATTATAACATCATCAGATCAATTGAATCAATATGTGAATGAATTTGGG
AAAAATCACCTTGATGATTTATCATTACTTGAAAAACATCAAATAATTGATGATTTTACT
GCAAGTATATTTAGTAATACCCAAAGTAGAGTTAATAAAAATTGGCAATTTGAATCTTTA
TTAGAAACACAAGAATTTACTTTGGAAATAGGTATTTCTAACAACAACAACAACAACAAC
AATATTGCTAAGGAGAAACCAATTTGGATTAATTATTTGCACCAAGAAATTGATACATAT
GCTAAGAAACCCAATAATGATCAATTTGAATTGGTTTGTACTTTATTCCAACGTTGTTTA
ATTCCCAATTGTTATGATTCAGAAATATGGTTGAAATATCTTGACTTTATTAATAATCTG
AGTTTATCTAAACAAGAAAAATTTGATAAACAACAAGAAATTTATATAAATATTACTGCT
AAATTGATTCCATTAGATAATAATGAAACCAGATTGAAATATGTTGAATTATTAATTGAT
TATGAAAAGAATCAAGAAGCTAATGAATATTTATTCAGTTGGATGAAATTATTTAGTGGA
GGATCTAAAAAATATTATAAAGCATCGTATTTAGAAATAACTAAAGAGTTATTTAATTTA
TGGATAAAATTATTAGATGACGAACAATTCATAACCATTGCTGAATCAATGATAAACAAA
TATTTCAATATTCATGAAAAACAACCAAGGAAAGAAAAAGATGAAGGGACTGCTAATAAT
AACAACAACAACACAACTCCAAATTCGGAATCAAAACTGAAACTTGAATTGACAGACTCA
TTAATTACACTGGTGATAAGTTTCCTTAATGATGAATCAATATGTATTCTTACAGTATTA
TATTTAAAACAATTACAACATCAACAACTGCAACTGCAACTGCAACTAGAAACCAAACAA
TCTCAAACCATTAAAATTCGAAAATTTTTCAATAAATTCAATCATGAAAAATGTTTTAAA
ACTTCAATTCAATTTTGGAATTTTTATTTTCAATTTGAATTAACTCAGAATCATTGGAAA
AATTTAAAATCATTAATTAATCATATTAAATTCAATACTCAATTACCAAAAATTATTATT
GATTCATTTATTGAATGGATGTATGAAATTTCTAATGATAATTTAATAAATTTTTTGAAA
TTAAATGATGGTAGATCAGATGAAACTATAATTATGAAAGATTTAGAAATTTCAAATTCA
TTATATTATAATAAAACTACAATTAAACGACATGCAAAGAAAAATAATTATATCATCATC
AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGCAAC
AACAGTTTTGATAAGAAACGGAATAATATTGGTGGTGAAGAAGAATTTTTACGTTTGACA
AGTAAACAAATAGGTCATCCAGGAATATTTATTGATGCTGTACCACAAATCACAAATCGA
TTAATGCTTGATGGTAATGATATTGACCTTGCACAAGAGAATTTATCAATACCTCCATTA
CCTATGTTTAAAAATGTGGAAAAAGCTTCTCAACCGATAAAATACCCTTCCACTACTACT
ACTACTATTACTCAAACTCGTTAA |
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>PRP39 C2_01830W_A
AATTGTTCAATTAAATTTGATTTCAAATTAGTGGGAAATTGATTAATAATGATTGTTGTT
AATTGATTTTGAAAATTTTCTGGCTTTAATTTATCTATAGATACATATAATTTAATATCT
TCAACAATATCATCAATTCCTCCAACAATGTTCTCCCCGCTAGTGTCATAATCTTTTGAC
AGGGGATTGTTTTGGTGGTCATCACTGGAATCTTTAGCTTTATTAATTCGAGTTTCATTT
GTTTGAGTTTGGATTTTAGTATTATTCAAATCAATTAGATTTGAAACATCGATGGATTTG
AAAATTGGGATTTGATAATTTAATTGTGGTTTGATAATTGATGTGGTTGATCCATTAGGA
TCAAGTATAGATATAAGATCTGAGTTTATTGTTTGAGAAAGACTATAAGGATTGACATAT
TCTATACTGTTATCACCAGCAGTCATAGTTAAAGAAGGTAGGGTGAGTTGTGGTTATGGT
TAGAAGGATAATAAATTTTCAAAGGTTTATTCAATGTTAGATGACAATTAAAGTTCTTTT
CAATTTTCATACAAAAAGAAATTGAAAAAAAAAAAAAAATTATGCAATCTAAAATTCATC
CCAAAGAAATATCAACCAACTTTCCAGATAATAAACTACACTTTATATTAACATTATATG
TCAGTTACAAATTTACCAAAAGATTTGGAGTCACAGACCATCACACAGATTAGTAAATTG
TCAACCGTTTCAAAATTACMAMCATGTAGTAAATTCTCATCCTAATAACCTACAAAAATG
GAATCAATTGTTTACTGAATTAAATAAATTAATCGACACCATTGCAACCACTAACAATTC
TAATGATATAAATAGTGATGACAATGATTTAAAGCAAGATATACACAATAGTTACAAAGC
ATTATTGTCTCGATTTCCTTATTTAACAGAATATTGGAAGAAATGGCAACTGGTTGAATT
GAAAATAAATGGTGAAACAGCTTCACAAGATATTTTACGA
|
Chr coordinates |
Ca22chr2A_C_albicans_SC5314:336552-338495W |
|
|
|