|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
ITR1 |
|---|
| Systematic Name |
C2_04940C_A |
|---|
| Alias |
C2_04940C, C2_04940C_B, CA0863, CaO19.3526, CAWG_04247, Contig4-2828_0018, HGT15, IPF23713.1, IPF4456.1, ITR2, orf19.11009, orf19.3526, orf6.2039, orf6.310 |
|---|
| Allele |
C2_04940C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Verified ORF; (orf19.3526) MFS inositol transporter; uptake of exogenous inositol; 12 transmembrane motifs; expressed in rich medium; fluconazole, caspofungin repressed; possibly essential (UAU1 method); flow model, rat catheter and Spider biofilm induced |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>ITR1 C2_04940C_A
ATGGGAAGTTCAACCAATAATACACAATCAAAAGCTACCCCCAGTGTGTTAGAAAATGAA
GTCAATAGCTCAAAATCATCAGTTGTTTCATCAACGTCTTCTGCTAAAGGGTTGCTACGT
GAAACCACTAATCATGGTACTATGGAAACATCCTCGGTTCAGATATCTGAATCAGAATCT
CGTCCATCGAAAATGGTACTTGTATTAACACTTGCATCATCAATTTCTGGATTTATGTTT
GGGTACGATACTGGTTATATATCTTCAGCATTAGTTCAAATTGGTACAGATTTATCTAAC
AAAATTCTAACATCAGGTGAAAAAGAATTTATAACTTCTGCCACATCGTTAGGAGCTCTT
CTTGGTGCTGTTGTTGGTGGTGTATTAGCAAATTTGATTGGTAGACGTAGAGTTTTATTG
GGCTCAAATATCATTTTCGTTGTGGGGACAATAATACAATTGGCTGCTCGTACTGTGTGG
ACTATGATAGCCGGGCGATTTGTTTTAGGTTGGGGTGTTGGTATTGCATCATTGATTGCT
CCTTTAATGATTTCAGAATTAGCTCCTGCTAAATATCGTGGTAGATTAATTGTTACCAAT
GTCATATTTATTACTGGGGGTCAATTAATAGCTTATTTCATAAATTGGGGTCTTACAAGA
GTAAGTCATGGTTGGAGAGTATCTGTTGGTTTATGTATGGTACCACCAGTTTTACAATTT
GTTTTATTTTGGTTTTTACCAGATACACCAAGATTTTACGTGATGAATGGGAACTTTGAA
AAGGCAAGACAAGTTTTGAGAAAAGTACACGTTGATCCTTCAGATGAATTTGTAAATGCT
ACTATTGATGAAATGATTGCCTCTGATTCAACTGTCCCAGGTAATGGACCTTTACAAAAG
GCATGGAAATCGATCAAGATTATTCACACTACTCCAGGAAATTTTAGAGCTTTGATACTT
GCATGTGGTTTACAAGGTATACAACAATTCACTGGGTTTAATTCATTAATGTATTTCAGT
GCAACCATTTTTGAAACTATTGGTTTCCATAACGCTACAGCTGTTTCTATTATTATTGCT
GCCACAAATTTCGTGTTTACAGGGATAGCCATTTGTATTATTGATAAAGTTGGTAGAAGA
AGAATTTTATTGGTAGGAATGCCATGCATGTGTATCTCATTAATTGTCTGTGCTGTTGCC
TTCCATTATTTGAATGTTGATTTCAGTACTGGTACAGTTGTATCTAGAGGTATTAATGGT
TGGGGGATTGTTGTGATTATAGGAATGATATTGTATGTTGCTTCTTATGCCATAGGTATT
GGTAATGCTGCATGGGTGGGTGTTGAATTGTTTTCAGATGTCAATGTACGTTCCATTGGG
GCAATGTATGCTGCATGTACAAATTGGGCTGGTTCATTGGTAATTGCTTCGACATTCTTG
ACAATGTTGGAAAATATAACCCCAACTGGGACATTTTCATTCTTTGCTGGATTATGTTTT
ATTGCATTTTTCTTTGTTTATTTCTTGTTACCAGATACTGCTGGTTTGGAATTGGAAGAA
ACCACCGATTTCTTATCCAACGGGTTCAATGTGAAACAAGCTGCACAATTGTCAAAGGAA
AGAAAGAAGCATTCCAAGTTTGCTAAATCGAAACCAACCGTATAG |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>ITR1 C2_04940C_A
AGAATTTGTTTTTTTTATATTTTGTTTTCTTTTTTTCTAAAGTTAATTATATAAATGAAA
ACCTTGATAAACAGAAAAAAAAAATTCTTAAAAAAAAGTAATATACGAATATTAAAGTAT
TTAAAACTATAAATTGTAAGCAATAATTGATTCTTTTAGAGTGGTGTTGGTGGTTTTTAC
ACTAACATTTGTACAGAATTTTATTTTAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGT
TCAGATTTATCTGATCTCTCCTCTTCTCTTCTTATTTGTAGAAATGAAAAAGTTATCATC
GGCAACACGACCTTTTTGTTTTTTACTCTTCTGGCGAATTTACAGGTGAATTTTTTTTAT
TTCTCGCCGAAAGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCGTCGAATTTCTATACAATTCGA
TCCTTTGTCTCCTCCGGGGTGTCTTTGATTGATTTTATAATTCAAGAAAGTAATGCCCGG
TTTTGATATTTTGCCATTTTTGAACAGACTATTGTTGAATAATGTATATGTAGAATTTTC
TAGAATTTAATATAATATAGCAAGTAACACCATTTATAAAGAAACCCCCACTTGAGTCTA
AAAAGTAGTATGTACCCCTCCCACCAAATGACCCTCTTACACCCATTCTCTCTCAACAAA
TTGTCGATTATTTAAATATGCAATTTTTCTCCTTTTTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCAT
CTTCGCCGAAAAAAATTATTCTTAAATTTTTTTTTACTTTTATTGATCACTTTTGTTGTG
TTTTCTTTTCTTTTATTTTATTTTAACTGACATTATTATCTTTTCTTTTCTTGCTTATTT
ATTTTTATCAACGGTTTTCTAGATACCTAACTTTAAATATATTCAGTCATTATTGCTACT
ATCGTCATAGTTTCAGTTTTTTAAGTTTCATTATTATTAATTTTGTTTTTTTTTTGTTTT
TTAAAAGTGTATTGATTTGAGGGAATTTTTTAAAAAAAAG
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr2A_C_albicans_SC5314:1031667-1030003C |
|---|
|
|
|
|
