PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name C3_01720C_A
Systematic Name C3_01720C_A
Alias C3_01720C, C3_01720C_B, CA0606, CaO19.1672, CAWG_02504, Contig4-3069_0031, COP1, IPF29375.1, IPF8079.2, orf19.1672, orf19.9241, orf6.1640
Allele C3_01720C_B
Strain SC5314
Description Verified ORF; (orf19.1672) Alpha subunit of COPI vesicle coatomer complex; role in ER to Golgi vesicle-mediated transport, retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER transport; flow model biofilm repressed
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>C3_01720C_A C3_01720C_A
ATGAAGATGTTAACTAAATTTGAATCCAAGTCTTCTAGGGCTAAAGGTGTTGCCTTTCAT
CCAAAGAGACCTTGGGCTTTAGTCTCGTTACATTCATCAACAATACAATTATGGGATTAT
CGAATGGGGACATTAATTGATCGATTTGAAGATCATGTTGGACCAGTAAGAAGTGTTGAT
TTCCATCCAACTCAACCATTATTTGTTTCTGGAGGTGATGATTATACCATTAAAGTTTGG
TCATTAAACACTAGAAAATGTATTTTCACCTTGAATGGACATTTGGATTATATTAGAGGG
GTATCATTTCATCATGATTTACCATGGATTATTAGTTGTTCTGATGATCAAACCATTAGG
ATTTGGAATTGGCAAAATCGACAAGAAATTGCTTGTTTAACTGGTCATAATCATTATGTT
ATGAGTGCTCAATTCCATCCTAGTGAAGATTTAATTGTTAGTGCTTCATTAGATCAAACA
GTTCGGGTTTGGGATATTTCTGGATTAAGGAAAAAACATAGTGCTCCAACTTCTTCAGTT
CGTGCATTTGAAGATCAATTACAAAGACAACAATTACCTCAACAAGATATTTTTGGTAAT
ATTAATGCTGTTGTTAAATATGTATTGGAAGGTCATGATAAAGGAGTTAATTATGCTTCT
TTCCATCCTACTTTACCTCTTATTGTTTCTGCTGGAGATGATCGAGTAGTTAAATTATGG
AGAATGAGTGATACTAAAGCTTGGGAAGTTGATACTTGTAGAGGTCATACTGGTAATGTT
TTAAGTGCTATTTTCCATCCTCATCAAGATTTAATTTTATCAGTTTCTGATGATAAAACT
ATTCGGGTTTGGGATTTGAATAAAAGAGTCCCCGTGAAACAATTTAGAAGAGAACATGAT
CGTTTTTGGTTGATTGCTTCCCATCCAACTATTAGTTTATTTGCTGCTTGTCACGATTCA
GGTATTATGGTGTTTAAATTAGAAAGAGAAAGACCAGCTCATACTATTTTCCAAAATAAA
TTATATTATGTTAATGGTGAAAAACAAATTCAAACTTTTGATATCAATAAACAAGAAAAT
TCTTTACCAATGTTATCATTGAAAAAAATTGGTAAGACTTGGTCATTTATGAGAACTTTA
TCTTATAATCAAAGTGATAATTCAGTATTAGTTGTCCATGGTGAAGGTGATAATGGGAAT
TATGCTTTGATTACTTTACCTAAACATGTAACTGGTGCTATTGAACCAACTGATATTCGT
CAAGGTGAAGCCAATTTTGCCGCATTTATTTCTCGTAATCGTTTTGTTACTTTTGTTAAA
TCTACTAAAACTTTACAAGTTAAAGATTTGAATAATAATATTACGAAAACGGTTCAATTA
GATCTGTCAATTGTTGATGTATTACCGGGGTCTCCTGGTCGTATTTTATTGGTTAAAGCT
CATTCAGTGATTAATTATGATGTTCAACAACGTAAAGAATTGGCAGAAATTAGTGTTAAT
AATGTCAAATATGTTTCTTGGTCGAGTAATGGACAATATTTGGCTTTACTTTCTAAACAT
ACCATCACTATTGCTGATAAGGATTTAGAATTAATCACCTCAATGCATGAAACTATTAGA
ATCAAAAGTGCTGCTTGGGATGATACTGGGGTTTTATTATATTCCACTTTAAATCATATC
AAGTACACTTTATTGAATGGTGATAATGGTATTATCAAAACTTTAGAAAATACATTGTAT
ATTACTAAAGTTCAAGGCAATTTAATTTATTGTTTGAATCGTCAAGGACAAGTTGAAACA
ATTACTATTGACCCCACTGAATATAGATTCAAACGTGCATTAGTTAATAAGAATTTTGGT
GAAGTGTTAAGACTTATTAAAAATTCTACTTTAGTTGGTCAAAATATCATTGGTTATTTA
CAGAAAAAGGGATTCCCTGAAGTTGCATTACATTTTGTTCAAGATCCAGAAACAAGATTT
GAATTGGCTTTAGAATGTAGCAATTTACAAGTGGCTTTAGAACAAGCTAAAATTTTGAAT
AATAATCAAATTTGGGAAAAATTAGGTGAAGAAGCTTTATTACAAGGTAATATTGAAATT
GTTGAATATATTTATCAACAATTACATCATTTTGATAAATTATCATTTTTATATTTATAT
AAAGGTGATGATGAAAGATTAGATAAAATGTCAACCATTGCTCAACATCGTGATGATACT
TCTTCATTAGTACAAAACACTTTATATAATAATGATATCAAAAAAAGATGTCAAGTTTAT
ATTCAAAATGGAATGTTACCTTTAGCTTATACTTTAGCTAAATCTAATGGATTAAATGAA
TTGGCAGAACAAATTTTACAAGAAGCTAATATTAGTGAAAAAGATGTTGAATTACCCGAA
TTGGGTGATGTTGTCCCCTTACCTAAACCAATTGGTGAACCTGTTGGTAATTGGCCATTG
AAAGATTCAGAATTATCTTATTTTGAAACGGCTTTAATCACTGGAAAAATTGAAAACTTG
TCAATCAATGAAGATAATCTTACTACTGGTGCTGAAGGTTTTGAGTCTGGTGCTACCAAT
ATTGATGAGAACCTTGGATTTGACAATAATAATAATGATGATGATGATGATGATGGAGAA
GGTGGTGCTTTTGGTGGTGAAGATGATGCTGAAGCATGGGATTTGGACGACGAATTAGAT
ATTGGTGATGATGATATTGTTGATGAAAATGTTCCTGAATTTGTCACCACTGAGAATGAA
ATCGGTGATTGGTTACGTAATGCCAAGACACCAGCTACATATGTAGCAGCGGGAGGATTT
GAACAAGCAGCGTCATTATTAAATAAACAAATTGGAGTGGTTAATTTTGAACCATTAAGA
ACTCGATTCAATCAAGTTTATGGTGCTTCCAAATTATATTTACCAGGTATGGATGAATTA
CCAGCAATGAAAACTTATATTAGACATGATAATGATGAAGATAATCCACGAAAATTTAAA
CCAGTTGTTCCTGGATATGATAAATTGGAAGAATTATTATCTTTAGGTTTCAAAAAATTC
AAAGCCAATAATTTAGAAGAAGCAATTACCACATTTAGAAAAGTCATTTATACCATCACT
GTCTTAAATGTTGATGATGAAGATGACGAAACCAAATGTCATGAAATCTTGAGATTATGT
CGTGAATATATTCTTGGATTATCAATTGAATTGGAACGTCGTAAATTACCAAGTCTGGAT
GTGAAACGGAATTTAGAATTGGCCGCTTATTTCACTAGAGCTCAATTACAACCTTCTCAT
AAATTAAATGCTTTACAAGTTGCCATGACTCAATCATTTAAAAATAAAAATTATGCTTCT
GCTTCTTATTTTGCTGAAGAATTATTGAAAATTTCTAATAATAGTGGACCTAGAGCTGAA
CAAGCTATGAAATTGAAAAATAAAGCTGATACAATTGCTAATGATACCATTGAAATTAAT
TTTGATCCTTTTGCTGAATTTGATATTTGTTGTGGTAGTTTTACACCAATTTATAAAGGT
GAACCATTTATTAAAGAAGCATTAGTTGGAGCTACTTATAAACCAGAATTTAAAGGTAAA
TTATGTAATATTACTGATATTACTGCTGTTGGAGTACCTGCTTCAGGTTTACGTATCAAA
GGTTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>C3_01720C_A C3_01720C_A
TATGATATACCCAATGATGTTAAATTGGATGGTAATTCCACTAAAGAATCAGATTATCAT
GCTTTCCTTTATAATAGTACTGATGGTGATGCTAGTAACATTATGTTGACCACGAAAAAG
ACTTGGTTAGGTAGCGATGACGCTACTGGATTTGATCCACAAAATGATGATGAAGATAGT
AGTAGTAACAAAGCTCAAGAAACTACCATCACTTCAGTTAGTGGGTCATCTACTATAACT
AGTGTTAAAACTGATTCAACTAAAAAAACTGCTAATGTTCCTGCTCAAAACACTGCCGCA
GCAGCACAAGCAACTGCTAAAAGTTCTACTGGTACCAACACCTATGATCCAAGTGCTGGA
GTTGGTGGATTTGTTCAAGATTCAAAATCTACTGATTCTGGTAGTAGTGGAAGCAGTTCT
CAAGGTGTTGCCAATTCATTAAATGAAAGTGTTATCAGTGGTATATTTGCTTCCATTTGC
TTGGGTATATTATCATTTTTCATGTAAAAGTCAATTTAAACATTAATAGTTAAGTATTTT
TTTTTAAAAAAAAAACCAATAAAGAATATAATAATAGGGATATTTGTTTTGTAAGTTGTG
CTCCTTATAAAGGAAGTTCAATTTCTTCCTAGTGTTCTAACATTAATGATATTACTCTAA
CAGTTTTGGTCCATTTTTCTTCAGATTGTTACTTGTTAATATTAATTGATATTAGGATGT
TATATAGACCTTTTTTTTATTTTTGCAATTATCATAGTGTAATGAACAGAGTGTAATAAT
AGTTTAATGCATTTATGAATGAGTACACGACCTGACCTGTAATTATTTTTCAATTAACGT
GTCTTCTTTGTCAATTCTCAGTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTACTCCTTTGTTGTTGTT
GGAAAAAAAGAATACACCAAAGCGAATCAAAACCCAACAACATTCACACAACAAATACAT
CTACATCATCTTGATTGAATTTTAATTCTAACTATCTATC
Chr coordinates Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:375795-372130C