|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
NAN1 |
|---|
| Systematic Name |
C4_03030C_A |
|---|
| Alias |
C4_03030C, C4_03030C_B, CA2772, CaO19.10203, CaO19.2688, CAWG_03496, Contig4-2865_0003, IPF20112, IPF20112.1, IPF24577.1, orf19.10203, orf19.2688, orf6.4798 |
|---|
| Allele |
C4_03030C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Verified ORF; (orf19.2688) Putative U3 snoRNP protein; Hap43p-induced gene; physically interacts with TAP-tagged Nop1p |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>NAN1 C4_03030C_A
ATGCCGAGTGCTATATCAGAATGGTCATTATCCATGGCCACAGGAGGTAAACCATTATAT
TTACCTTGTTCACAAACAACTGCATCTGTCTATTCTCAAGATGGTCGATATGTGATCATT
GCATTAACTCATCAATTGAGAGTATATTTCATTTCAACCCGACAATGTATTAAAACTATT
GATTTGGATTTACATGACTTAGCTGATTTGAAAATAGATGTTACTAATGGAAATCAAGTG
TTATTATTTAAAACTTCTGGAGAAATATTAACTGTGAATTGGAAAGATAAAGTTTCTCAA
CCAATAATATCTACCATTGATATAAATAAAACTCAATCGGGTACATCATTGCCGTTATTA
TCAGTCATATCAGTTAAACATTTATTTTTTATTATTGTAACTGGTAGAAAAGAAAAGAAA
AAGGGGACTCCACATACTCGTTATATAAATTATTTTGATAGAAATCTGGAATCACTTGTT
CCAATAATTGAAGTTGCCAATTCAATAAATTTTGCAACTTCTTTGGATAATACAAAAATT
GCATTCATTACCAGTGGTAACGAAATAGACTTGTTTGATTTATCAGGGATATTCAATGTC
GACAGTATTGAAAATTTGTCAGATAACGATATCGTCAAAGAAACTATTCCATTTGTGTAT
CGATCACCGGTGACATCAATAGCCGTGTCCAACGATTCTATGATTGCTATCGGTACATCT
GCTGGTCCAATTCAAATAGTCTATGGTGGGTTGACCACTCCAAAACCTCAACGAGTTTTG
AAATGGCATCTTGATCAAGTCAAAGGATTAATGTTCACTGCTGATAACAATTATTTACTT
TCTGGTGGTATGGAAAAAGTATTAGTATTCTGGCAATTGGAAACTGAAAAGAAACAGTTT
TTGCCAAGATTGAATGGGGTGATTGATAAGATTTCTATTGATAATTATAAGAATGATTAT
ATTTCTTTACAGTTGAATGTTGATCCTTTGGACAATAATTATGAAATCTTGGTGTTATCA
GCAGTTGATTTAGTTTCTCGTTTGTCTGTCAATACTGTAAGACCTAAATTTGCTTATAAT
ATTGCCACCACCCTTTCTAAAACGAAAAAGAAATTCATTAAAAGCTCATCTGATTTTGAT
AAATTCAAGATTAGATACGATTACACCAGTCAGTTTGAAATCCATCCAAAGACTAAAAGT
ATGTATTTTCCCAATGGAGCTTTGATTCAATCATTTGATTTATTCAAAAATGAACAGAAT
TTCATTCAGCATGGTGCTCCAGTATTGGGTGTGGGTAAAGTCAGATCAGAAACTAAATTA
TTGGATCCTTTGGTTACATTATTGAAATTCACTCATGATGGAGAATGGATGTGTACATTT
GATGAATTCACCAACACTGAAGTTGACAGTTTATTATTGAAAAATGAAAAACAATATGCA
TTGAAATTTTGGAAATATGTTGGCCATAAAGAGAATGCAACCAGTGGAATTAATAATAAC
AATAAGACTGGTCATTGGGAATTGACTACAAAGATTATTGATCCTCATGGAATGAATCCT
ATTTTAGCCATGATCCCAGCTCCAACTTCTTATTTCAATGGGTTGGCATTCTTAACTGCT
GATGATAAAGGTGGTTTGAGAATTTGGAGACCAAGTGTACCCAAAGAACAATATAAAACC
ACTTCAGCAAGGTCTCAGCAAACTGCATGGACACTTAGAAAATCCAGGGCTCCAAGTGCA
TTGTCATCAGATGCCGTTGCTTTAAGTTGGTCTGATGACAATTCATTGATTTTCCTTGCC
CATGAATGTTCCATTCTTACCATTGATTCTAAGAGCTTTGAAGAAATTCCTGATTTCAAA
ATTCCTTCATTATCAGGATCAAGAGTAAGATCATTAAACATGGTCAATAATAATCTTATA
GTGTTATCTAAAACCAGAATATCATCATTTGATTTAATCACGGGGGAATTGACTAGTTTG
GTAGCCAAAGTGAACACCACCATTGGTGCTAAGAATTTAATTGCTATTGATCCAATTAAA
AGATTAATATGTTTGGCATTAAATTATTATTCTGAAGAAAACAATACCCTTTCCATAAAA
TCCAAAATCTTAATTTTTAAACCAAATCAATTAAAACCTATTTGTGTTCAATTGCATGAG
CAAGGTGTTTCATCGATTCGTTATTTCAACTCATCATTTGTATTTGTTGATTTGGATTGT
CGAGTCGGTACAATTTACAGTAATGAGGAAATAACTGAAACAATTGAACTTGGTTTAACA
CAAGAAATCAACAATATGCTAATAGCTGCGCAAGCTACTGCTGATGTTATAAACGATAGA
AATGTAAAGACTACAGTTGGACATCAAAATGGAAACAAGGAAGGAGAAATGGATATAGAC
AACAGTATGGCATATGCTGCAAAAGTGGTTGATCTTCACACTTTCCAACCAATATTTCAA
AATATTGAAGGTGTACAAGTTGAATCATTATTTGAACGTATAGTTAACGTACTTAAATAG |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>NAN1 C4_03030C_A
CACTGCTCCAGCTATTATGACAGGTAACACCGATACCAGACACTACTGGAACTTGACTAG
AAACATTTTCAGATTCACTCCAGCTTTTATTGGTGATTTCATTGGTGAAACCCATATTCA
CAGTGTTGATGAGAAATTACCATTTGACAGTCATTTGCAATTACAAGCTTGGTTCTATGA
ATACATTCAAGCTATTGACAGTGCCAAGGCAAACAATAAATAAGGTTCGTAAATTTGTAA
CTAAATAAGAACGTAATTGATGTATATTCAAATGCAATAACAACAATAACAAAAACCAAA
GTAAAAAAAAAAGTATGAAACTAATAATCTAAAAATACATGAAATTGGAGACTTTTTGCT
GTCTCTTACTTGTTGAAATTATTTATCAACTTACCACTGTATGTATGTATGTGAGTTCTC
TGTCAACTCTAGGCCCTAGGATATGCGAAACTGCTCGACCCCTCTCCCTTAATTAATATC
TTTCTTCTCTAATGGATTGTATCTCAAAAACTTTTCAATTAAATCAACATGTGTCAACAC
CATTCTTCTACAGCAATATCTTTTCAATTTCAATTTGTCCAAAGCATCACCTTCACTGAG
GGTTTCATCTTGTAAATAATCCAAATAAGTTTGCCACTTATCACCTACCACTTTACCACA
TGAGAAACAACGTATTGGAATAATCATTATTTAAGAAAAGTTTTGGGGGGTTTTGTTATT
TTGAATATAGATGAAGAATATTATGTGATGGAAAATGATATCTTTTCTATTTGATTGATG
TGTAATGAATCTTTTAGTGATGGTTTGAGAAAAGAAAAAAAAAAATGAAAATATGTGAGG
ATTTTATTTGTGCCAAATCACACTACTCTCTCTCTCTCATCTCTTATAAACCATCTCATC
ATCCAAACAAAAAAATTTTATAGAGACTTTTCCAAAAAAAGAAAAAGGAGCATTGACATC
TTTCTGTACTTCTGGTGAAGCTATACTTTTTACTCTAATC
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr4A_C_albicans_SC5314:633098-630579C |
|---|
|
|
|
|
