Locus Information
Locus Info
Protein Info
GO Info
Orthologs
Standard Name
MSN5
Systematic Name
C4_03280W_A
Alias
C4_03280W, C4_03280W_B, CA0600, CA0601, CAWG_03476, Contig4-3083_0029, IPF12426.2, IPF18929.1, IPF24579.1, IPF29005.1, MSN5.3f, orf19.10182, orf19.10183, orf19.2665, orf19.2666, orf6.1628, orf6.1629
Allele
C4_03280W_B
Strain
SC5314
Description
Uncharacterized ORF; (orf19.2665) Predicted karyopherin involved in nuclear import and export of proteins; flow model biofilm induced; Spider biofilm induced
External sources
Open in CGD
Open in KEGG
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>MSN5 C4_03280W_A
ATGACAATGGATAGTGGAGGTGTTCAACAGATAGTATCTGCATTGCAAATCGTATACGAC
CCCAAATCTACAAATGATCAAAGAAGAGAAGCACAAACGTTTTTAGATACCATCAAATCA
AACGAGGAAAGTCCTTTTTGGGGTTACCAATTGGCATTACCAGAAAATAATGGCGACAAC
TACATTGTAAGGTACTTTGGATTGTCACTATTACAACAATCGATAACTGCAAACTTTCAC
ACTTTTGATCCAACAAAGACAGCTGCCGTAAAGCAATGGATAATTGATTTATCAACCAAA
GTCGAGCCAAGTGATCCTCATTACATTAAGGAAAAGATTGCTTTGTTATGGGTCTCAATA
GCAAAGAGAGTTTGGGGAAATCATTTGATCAAATCACGAGACTCTCATCACAACAGTGTT
GACGAAAACACAACATTATCAACAAATCTAGATAACAATAATAAACTGTCGACTTCTATC
ACAGAACAAGAATCTGCCGATGGTTGGGTATCTATGGATGCTGATTTGTTAAAATTGTGG
AATAACAACGTTACTTGTCGAGAACTTTCGTTGATCATTATTAGAACATTGTTCGAAGAC
ATCTACTTGTTGGATGATCCAATCTCCTCAAAAAGAAGCACCTTATTGAATCAATTATCG
ATTTTGATTGTGACTCCTCAAAGTGTATTAGAATCTATGTATGAAAACAACCCTAACGTT
ACAATCTGCAAAGCACTGGCTGAAGGTTGGTTTATAACCTGGTCAAGATATTTGGTTGAA
TTGTTAACTAACAACGATTATAAAGACAAGATTTGCCAAGCATTTGTGCCCAAGATATTA
TCGGCATTCAAAACTTGTTTACATTGGATCAATCCTTCAGTGTTGAGACAAGAAAATATC
ATGCAAACGTTAATTGGTATATTAACTATTCCTGATGTACCAATGAAAATTTTAGCCGTT
GATTGTTTGCATATTTTATTTACAAGAACATACACCCAACCTGAAGATTTCGATTTTTTC
ATTGGCTCTGTGTTTACCAGTGAAGGCATAACAAAATTAAGTGAGTTTTATCACTCATTA
CATTTAGATCCAGATGATGTGGACGAGGTTGTATATTCGCTTTTGAAGAAAACAGTGGAA
ATGATAGTATCTTTGAGTGAGTACTTGAATATTGCCTCAAGAAATAAAGTTTCTTGGGAA
AGTTCTGATGTTGATGGTTACTTGAAATTGGTGTTGGAGACAACAAGCCACCCTAGTTTG
ATAATTAGTGGTTTATCGTTGCAGATGTGGATCACCATATTAAGATTCGATGAACTAAGT
GCGAAACCTCAATTTGTTAAACTCATGCCAGATTTGCTAGAGATTGCTGCTAATAGAACC
ATAAATTATACCTACGATGAGAATAATATCTCGAAGAAATTTTTAGACGTGGATTTCGAT
TCAACTCCTGATGCCAATTCATTTTTGCAAAACTATAGAAAATTCAATGAAGATATTACA
CGTATCACGGTGTGCAAGGATCCTGAAAATGGATTGGCATGGCTCGAAAATAGACTTCAA
GTATTTTTCAGCTCAGAATTGGGTGGCAAGTGCATCAATGAATTTAAATTAGGCGAAAAG
TCAGAAGAGTTCAATTATGGGTCATCACAACTTAGCACAATTGACTACACTTTACGTGGG
GTCACGCGTTGGAACGAATGGTATAATCGAGAGGACAAAAATGATATTAAGGAGAGATTA
AATAAATTAGTTGAATCTTTATGTGAACGTTTATTGGCGATGAATTTTGCCAGCCCCTTA
TTGGTTAGAAAGCAGATGCAAACATTAGTTCATTTTGCACCACTTTTGAAAGATGTCAAC
CCACCACTCATGTTCAGAGCTTTAGAAAAAATTCTTACTACAGCTACTTACCCCTATCCA
CCTAATGTTTCAGATGAGGACATGGAATTGATTAGAGATTTAAGAGGTAGTTGCGGAACC
GAGCTAAATAGATATGCCTACATGATGCCTGAAGGGTTGAGTAAGATATTTACCGATTTA
GAGAATGCCATTGCCAACATATTGTCTGCGAAAAAAGTCAGTGATCATGAAAATGTTGCA
CTTAAATCGTTTCTTTTGGTGATTGCGTTTAGATCGTCTATTGGAAATAAAGATGAAATA
TTTGCAAAGATTGTCGACCCAGATTTAGCTGCATGGTCTGCACCTGAAACAGAAAAAGGA
TTGATGGATTTGCATTGGTTTATGGAGAGAATTGGTATTGTTGAAATTGCCTCATATTTC
CAAAGTCGTGGGATAACTGCAACCACAAACCTTTTAGAGGCAAAAATGGACGAAGAAGGT
AAATTGTTGAAAACCAAGCTAAAGGATCATTGGTCGTCTATTTTCCCAATAAGAGCAACA
AGAATTTTCATTCAGTATAGTATAGAAAAGTTGAACCACAATTCTCCTGAATATTTGCAT
CTATTGAAGCTTTGGAAACCAAGAATTCAGCCGATTGTGCCGCATATCTTACAGTTATTG
ACACAAATCCAAGCTTATCATGATCCTCAAAATTGGAACGATTTACCAATTGAAGTTCAA
TCGTTTGTGAAAGAGAGTTGTACCGAGAGATTTTGGCAACAAGGAGTGTCTATTCAATCG
AAAGAAACATTTATGGAGGAGAATGTTAAGGCTGCCTTGACATTGAGAGACTTTGCAGAT
TCCGTTGGCCATTTGATTAGATATACTCGAGAATATGCATTTTTGACGGTGGGTTCGATA
GCTCAGTTGGAAGACACGTTATACGAAATTCCTGGTGTTGCCCTGATGATCTGGAAAGCG
GTGGCAGGCGATACTGTGGGTGTTACGTTACATAGTTGGAAACATATGATAAACAGTTGT
TTAAGAGTGGTTATTAAATTTTGTCCTGTCAAGTATGTTGAAGTATTTATGAGTGAACTA
TTGCCAGCAGTGTTTTCAGACTTGGATAAGTTACTTGTCGATAGATGGGCTAAAATAAGT
GGCAATGGAATACAATTGCAAGGAAACGAAGATGACGAAACATTGTCTGAAGAGATGATG
GAAGAGCATATGTTAAGGCAATTGACTGCTACTATTGTGAGGTTATTGATGGATGTAGTT
GGTCAGTATAATACTAGACCGGCTACCGACACACAATTTGCATGCAAGAAATTAGTGGCA
GAGAATAAAGAAGTTTTAGCTCCATTCTTACAAATATGTTGTCATTTGTTTTTGTTTAAA
GATACAAAGTGCTCTTTCAATACTATTTTGGTGATACGTAATATTTTGCCTGATGTTGTG
TTAAAGGACGATGAAGTTGATAAGTATCTTTCTGATCACCTCATCAAATCTTTGCTCCAG
GTATTGCTTGATGATTATTTTGCTGAAACACACAGTGAAGCTGCAATTGCATTAACAACT
TTGTATTGTGCCTTGAGATCCAAAAACGACTACCCAGCCAGAATTTTGATTCAAAACTTA
CAAAATATAAATACCAGAGACATCAGTAGTTTTGAGTCTCAGTTGGTGAATTCAAAATCC
TTGCGCCACCAAAGAGGCGCTTTACTAGATTTGGTGAGAAGATCTAAAAACCAGGAGATT
GATGAAATGTCTAAGAGAAAGAAAGAGTTGGAGGCAGTATCTATAGCCAATAGGAAAAAG
AGAAATGGTGGTGTAGATGTCATGAATGATCCATACACTGAGAATGGTGCATTGGGACAA
TTGTTCGGTGAAGATTAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>MSN5 C4_03280W_A
TATTTCAAAGTATTTTCCCTCATAAACCTGAACTTCAAGGAAGACAAGTGATTACTTTGC
ACAATCAACGTGATTATATTTTTTTCAGAAGACATAGATATATTTTCAGAAATGAGGAAA
AGGTTGGATTGCAGGAATTGGGTCCGCAGTTTACATTAAAGCTAAGAAGAATGCAAAAGG
GAGTACGTGGTGATGTTGTTTGGGAACACAGACCAGATATGGAAAGAGATAAGAAGAAGT
TTTATTTATAAGCGGGTGTATAAAGGTAGTAGTAGTGCGTTTGTAAGTATGTGTGTGTGT
TTATGCATAGATGTGTAAAGAGTAATACAGCTAATTCGAAAATAAATTGTAGACCACAAT
TCAAAAAAAATTATGTACCAGGTGTCATATCCAATAGAGTTGCTTATTTGGCTCAACATG
CATAGATTAGGGTATCACAACTGTAATGATCAATACCATAACCATGTCCGGGGAATAGTT
TGGACCGCCATTGAACGCAGGCGAGACGCACGCCTTAGGCATAGACAAAGAATACCACAA
AAAAAAAAGCCTGACCTCTCTTTCGCCCTCCCTTTTCTCTCTTTGGTACACACACAAAAT
AACATCTACAAAACTCAACATAAAATTGTTTAGTTCCAGTGGTGGAATTAAAAGAGAAAA
ACGCACATCAACAACAACAACAATAACGACAACGAGAACAAGACAAAAAAAAAAAAATCA
CGCAAATTCTTATTAATCTAATCAGCTATCATTTGTTTTTCTAATCATAACACCCATTCG
GAACAGAAGATCGTTCATCGTCTTATATTAATTGTTGACATATAACTGTATTCGTGAGAG
TTAAGTGTCACATTAGAGATTGTATTTTTACTTAGAGTGTATTATAGAAACAATTATTCG
ATTTTCACCTCATTGTACAATCATTTATTCATTTGTTTTTATCTTCCCATTTCCACCTCT
TTGTTAAATATTTTGTCGTTTCATCTGGATAATAAATCAA
Chr coordinates
Ca22chr4A_C_albicans_SC5314:682502-686239W