|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
SRB8 |
|---|
| Systematic Name |
C4_05090C_A |
|---|
| Alias |
C4_05090C, C4_05090C_B, CA0102, CA1018, CAWG_03306, Contig4-1880_0002, IPF13479.2, IPF16695, IPF16695.2, IPF16695.5eoc, IPF23494.1, IPF26554.1, MED12, orf19.11252, orf19.3768, orf19.736, orf19.8355, orf6.2285, orf6.526 |
|---|
| Allele |
C4_05090C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.736) Putative RNA polymerase II mediator complex subunit; early-stage flow model biofilm induced |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>SRB8 C4_05090C_A
ATGTCTAATAAGAATCGTAATAGAAATAGTTTATTATCATCTCATAATCGATCTAGTCAT
ACAAATTCCACTAGTAAAGATGAACTACTAAAATTGAAATATCTGATGGAAACTCCCAAT
TTACCCATATATCCATTAAATGATTCATCAATAATAAATTCCAAAACAAACGATAATTTG
AAAAATTCCCCTTATCAAAAACCAAAATCACAATCACAACCACAGGCACAGGGCCAATCC
CAGTCTCAACCAGAGAACTCTTTGGTGTATCCTGATTTCATGCCTTGGAAAGATCATACT
CAATTACCACAAGATGAAACTGAAATTGAACATCAAAAATTAAGTAATGTATCTTATTTG
AACAAAGGTTATTTTGAACCTCCACAAGTGGCCAATGAATATTATTCTGCTCGTAATTTG
ATTCAAGCTACAGTATTTTTATCAACTGATAATTGTACGAATGTTATAAATGAATTATCT
ATTCATCTTTCCAATGCTTATAAATCTAGAAATGAAATAATTAATAAGATTAAATTTGAT
TCTAATAAATTCAAATTGCCTACTAGAGTTACATTAACTCTGTCAAAGAAAGAAATTTGG
TTGAATGAATTAAGTAACCCAAATGTATCAATGACAAAATTGGGTGAAAAAATTCCTCAT
GGAATTAGAAATAAAGTATTGATTGATTGTATATGTACTAAGAAAATCCCCATAAATCGA
TCAATTTGGTTTACAAAATGTGTATTATATGGAGAATTACTTGCATTAAGAAGAAAACAT
CAAAATCGATTATCAACAATCCCCAACAATAATAGTAACACTGGTGGCGGCGGCGGTGGT
GGTGGTAGTGGTAATTCATTGACAGGTATGATGGATTATAATACCGCAGAAAAATTTGAA
ATTCATTGGCTTCAAGAATGGACTCAACAAGTATCGGATTATATTTATAAATTTTCTCGA
GAAATGAATAATATTGCTAATTTAGATGGGAAAAATCAATATATGGGGAAATTATCTTAT
TTGTTAAATTATATCCAATCATTATATGTTGAATCATTACTTGATAAATCATTATTTCTT
TCATTGATAATGAAGTTTTTGAAAGATGGACTTTGTCTACAATCAAAATATATTAATGGA
TTGATATATTCTAGTATGGAGGAAAACTCGGACGACTATAATGATGATGATGACGATGAC
GATGATGAAGAAGACGCAAATAATGCTGAGAATCCTGAGAGCACTAGCAAGTCTAAGAAA
AGAAATTTAGCTTGGATGGATGAAATTGATATGAATTATGGACAACGATTGGTATCTCTC
ACATTAATCAAAATGTTTTGGAATGATATTTTGAAATTTGATTATTTATCGAAGGAGTTG
AGTGAATTGTTGTTGTTGAATTATTTCTTCATTAATAAATTGTTGTTGTTCTCGGTCAAC
AATGACAATGGTAATTCAACCGCAGTTATACCCGATGGATTACAATCCAAGATTCTTAAG
CTAATATCTGATTGTGTGAGATACTTGTTTGAATATAATTGTAATATTTTCATTATACCT
AATCATTGGACTCTCATTGAACCATCGTTAATGAGGATTTTGTTACTGGATTCCAAGGCA
AAATCGGAAAAGGAACAAGAAGAAATTCAAAAACAATTGGAATTGGTTAAATATCGTAAT
GAAAGTTTAATTTTGAATTTGAAAAGTGAACTCAATAATTCTAACAACACCAACAATAGC
TCCAATTTGGGAACTTCCAAAAGGTCCGTTAGATCAGGATCATTCTCCAATTATACTACA
ACCCCCATCAAACCAATATCAAATACAACCATAGAACAAGATTATTCATTCATCAATAGA
AACTCTGATGATGTATTGAACATTGTTGAAAAATTGGATAACTTAAAGCTTAATAAAGAA
TTTGCAAGTTTTTTGAAACCAACGAAAAAATGCAATGCCAATTGGAAACTTAATTTGAAA
GTTTTGTTGTTTTGGTGTGTCTCACCATGGAGAAATAGCACCAATTCAAATGAAGATATT
TTATTCATTTGCAATTTCTTGAAGAATACCGTGGTTAAATCTTTGCCTAAATCCTTACGA
ACTGAATTCGATAATGAATTGCTAGAAATTATTTACCACATTGCTGAAGATAACAATAGT
GAAGAAGGGGATAATTTACAATTTACAAGCTCTAGATTATACGTTTTGATAAATGAGTTA
TATCAATTGAAATTAATTACCATTGCATCTTATTTAAGAAAATTGATTGCATCAGGGATT
TTTTATTTGGAACCAGGTAGTACTGTTGATCAAAGTCTTAACAATTTACCAAGAATCATG
GAAGTTCATTTGAAAATTCTTGAAAATTTGCCAGTATTAAATAACCGACAATGTGACAGT
ATATTGAAACGTTGGACTCCTATGGGATTTGATTTTAAGGGGAAATTTTCTCAAGGACAA
TCAATTTTACAAGATTCCATCATTACCAAAATTTGCAATAATCAATTAACTGATGATATA
GATTCTCAATGCATTGGATATATCGATTCTTTGAGTGTTGGATTACGATTTTTATTGATA
AATTGGTTAACCAATGAATTAAAACTGAAAATAAAATCAACTAATAAATTAATTCATTTC
ACTCCAACAGTGATTACCAAACTTTATCAATTTTATGCGAAAAATTCAGGACTCACGGTT
TTCTTTAAAGTTGTCATTCAAACAATTTTGAAAAATGATGGTGGTATGATTATATTTTAT
CTTGATTCATTGTATTTGATATCTAAATTGGTGATTAGACATTATAAATTAATCAAATCA
ATTGCTGGTGCTTCTGAATTGTCCGCTGCTTATGATTTGTTTAAATTAATAATTCAAGTT
TATAAAGATTTGAACACCCGTGAATATGATTGTTTCAAGTTTAGTTCAATTTGGAATTTT
ATTAATGCTGTCATTGAAAAATCTTCACCAACATCATCGGCAACTACAACAGCAACAACT
TCAGTTTCGATATCTTCCTTGTATTTAACAATGGGGAAACCCAAGAATTCCAAACTCAAA
TCAGTGCAAGGATTACATGTGAAACAAACCATGGACTCACCAATGTGTATTAATACAGTC
GATGAATCACATACTCATGACACTAGATCTGGTGCGAAAAGGTATACTTCTACTGATTTC
AGAAATGATCTTTATTTTTTGGTTACTTTACAACCAAGAGCATTGACCAGTGAAGAAAAA
CAAGAAGTATTTGATTTGATTGAAATTGAATTGAAAGATTTGGATTCTGCTTTAGAGTTT
TGGTATAATAACTTTGAACTACTTGGTGAAGAAAAAGAAATCAATTTAATGAAGATAATT
AAAAGTTTGGCTGTCACCACTTATAACGATCATTTAAGTCAATTTAATGAAAAATTGAAA
CAATTTGTTATTTCAAAAGTTGGTGAATCGATAGATCACTCCAAATTGAGTAATTTCTTG
AAGAAACTTGCTATTTTCGATTTACTTCGAATTAATGATCTTGTCAAGTTGATTCAATCA
ATACAACGAGATGAAATTAATCATATTGATGATACCATCTCCTTTATTTATGAATTGATT
TGGGGTGAACTCGACAAAGCTCACTTTAGTTGTTCTCAATTAGTTTTGTTACAAATTTCC
CGACGCATGTATCAGGAAAAATCAAGCTATCAATGTATTATTTTATTACAACAAAGGTTA
TTGAAAAACAAAGAATCACAATTACAAACCAATCCATTTTTCATCAAATATAAAGCAGAC
TTGTTGTCATTTTTCCATAAAGCAATAATTACCAATACCAAAGCCATTCAAAGTCAATTC
TTCGATAAGTTGTCACATTCAGACAGTTTACAATTATTGAATGTGTTACTTCAACGTCAA
GAGAATGAATACATTAACACAATTCAAGACTTTAGTTTGTTTATTAAACATATCAACGAA
TTTAACTTGCCTATTTGTCAAGTATTGTTGAATGTATTATTTAATAACTTAGTGGTTGAT
AATGATGTGGGGATTAAAGTACAATTGGAAGCATTTGTCAATACTTTATTACAAGAAATC
AAGTTTGAATTTTCTAATGAAAACTCCTTCTTTGGAGAATTGTTCAATTTTATGCCGTGG
AATCAAAAGAATTATATTTTAGACATCCTAGAAACAAAGTTTTTGTTAGAAACAAATTTG
GACAACAATCAAATTAAATTGATTATAAATGATAGAAACTTGTTACCACCATTGAATGAT
TTCTTCAAGAAATTTTCATCATCATCATCGTCTTCTACTTCGTCATCTTCTTCTTCCTTG
GTACAAACTATTGAGACTGATAGTTCGTTTTTCCTTAATTTATTTAATTTCATTGGGAAC
TTGGTCAATGTGGCCAATTCACAAGAATTAATTTTGGAACAAGCCAATAGCATCAATGAT
ACAATTTCAATTTTTTTGAGGATATTAATTATTCATAAACTGTATTTATGTTCAATGATA
TCTAGAAATACCAATGAAGAAAATGTGATTTTATTTGTTACTAAATTAATTGATTTACTT
AATTCTGATTATTTGACTAATCATAATGATAAATTGAGAATATTACTTTATGATTTGCTT
TTGTTAATGAAGTCGTCAGTTAGTGAAGAAGTGAATTCAACTAGAGAATTAAATGAAAAT
CTGCAAGGTAACCGAAATGGAACTGGAACTGGTGGTGGAGGGTCAAATGCAATCTCACCA
AATCAAGACTCAATACTAGACGATCAGAACACCAATAGCACTGGTATTGGTAAGGGCCAG
AAGTCACAAATCGGCGTTACCAACAATAATGATATGTTGGATGTTGCCCCTACAGTTTCT
CTGATTCAAGTATTGTTTGATTTACCAGAACCAAATGCTAGTAATCCTTTTAAAGAATTT
ATAGATGATAAATTGGTTAAATGTTCAATTATGCTCGAGGAAGAAGAATTAAAGTATGGT
GGTGATTATCATATTTTCAACAATACGGGACTTTATTTGAAATCAACGAAAAATGAATCT
GTGAGTTTACCTCCCTTTGTCACTGGATTAAATAAAACTGCTGGTGATTATGATAGTTCG
TCGGCAAGAATGATTAAACAACCTTTCAAAATGAAAAGTTTTGAGATATTAGAAGATGTA
AACAATAATAAGAATTCAGTGAATGATGGATGTATTAATTTGAGATTATTTGATGCTTAT
ACTACAAAAGAAAACCCTCGTTAA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>SRB8 C4_05090C_A
CAGTTGCGTCTCCAAATAGACCTGCTTCTACAACCATTGCTACTACTACTAGTCATACAA
GTAGACCAGTTAAAAAAACAGCACCTGCTCCTCCAGTGAAAAAGACCGCTCCACCTCCAC
CTCCACCTACATTAGTTAAACCTAAATTCCCTACATACAAGGCTATGTTTGATTATGATG
GATCAGTCGCTGGTTCCATTCCTCTTGTTAAAGATACAGTTTATTATGTTACTCAAGTTA
ATGGTAAATGGGGTTTGGTTAAAACCATGGACGAAACTAAAGAAGGATGGTCACCTATTG
ATTATCTCAAAGAATGTTCACCAAATGAAACCCAAAAATCCGCACCACCTCCACCACCTC
CTCCTCCAGCAGCAACAGCATCTGCAGGGGCTAACGGAGCTTCTAATCCAATTAGTACAA
CCACCAGCACAAACACTACTACCAGTTCTCATACAACAAACGCAACTCTGAATGGATCAT
TAGGTAATGGATTAGCTGATGCATTAAAAGCTAAAAAGCAAGAAGAAACTACATTAGCGG
GGTCATTAGCAGATGCTTTGAAAAAAAGACAAGGTGCTACTAGAGATAGTGATGATGAAG
AAGAAGAAGACGATGATGATTGGTAGGTAAGAACTTGTTATAATTTGTTTATGTTTATAT
TTTCTTGTTTCATTTATTATAAATGTATAAAATTTTATATATTATTTGACTGTAGTATAC
TCTCCGTTGTTATTGAATCAGTAAGGTGTTATGACGATGCAGTGGAGTTAATAAATTCCG
CAATACGCCTAACACGGAATTTTTTTTCAATGCGTGCGGGAACAAAAAATGAAAGAGAAT
GTGTGCCACTATTAGTAGTAAGTGCTTTAATTATAATATTACATTTTTACAACCACTTTT
ACCACCACCCAAGTACACATTTTTTTTTACAACAAATAGTTTACCATCTAACAAGTTTTA
ACATCCGCCATTTTTATAATAATCATTGATTCCTTGTATC
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr4A_C_albicans_SC5314:1091751-1086508C |
|---|
|
|
|
|
