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Locus Information
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| Standard Name |
VPS13 |
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| Systematic Name |
C4_06060W_A |
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| Alias |
C4_06060W, C4_06060W_B, CA2353, CaO19.11894, CaO19.4416, Contig4-2875_0007, Contig4-2875_0009, IPF19756.1, IPF22856.1, orf19.11894, orf19.4416, orf6.4223 |
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| Allele |
C4_06060W_B |
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| Strain |
SC5314 |
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| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.4416) Putative vacuolar protein sorting-associated protein; gene used for multilocus sequence typing |
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| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
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Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>VPS13 C4_06060W_A
ATGTTTGAGTCACTCGTAGCAAACTTGGTAAATCGTTTCTTGGGATCTTATTTGGAAAAT
TTCGACACAAACCAGTTAAACATTGGAATATGGAGTGGAGATGTTAAATTGAGAAATTTG
CGTCTAAGGAAAGAGAGTCTTGATAAATTCAAATTACCAGTAGATGTTAAATTTGGTCAA
TTGGGGCAATTGACTTTACAAATTCCATGGTCAAACTTAAAAGGGAAACCAGTTAGAGTT
ATTATCGAAGATGTCTATTTATTGGTATCACCTAAAATTATTCAAGATTATGATTTAGAA
GAGGAGGAATTGAGACTGCAAGCGGTAAAAAAGGAAAAATTGGCTCAGTTAGAAACATTT
TTGGATGCAAAATCACAAGAGTTGGGTACCGATTTAGAGAATGAAACCTTTGTTGAATCC
TTAGTAACCAAAATAGTGGATAACCTCCAAGTCACTATAAAGAACATACATTTAAAGTAT
GAGGATGATTCTGTTTTAACCGAGACTCCATATTCGATAGGATTTACTTTGGATGAATTG
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ACAAGGAAATTATTGACTTTGAAGAACCTTTCTTGTTACATGGATACTCAGGGGACTGAG
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ATAGAATATTTATTAAAACCCGTCACCGGTAATGGTAAGTTGACAGTTAATAAGACTGGA
ACAACCGCATCTATCCCGCATATTGATACAGACTTATTTTTTGAGGAATTTGGAGTTGAA
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AAAACTGAAAAATTTAGAAAATTTCGTCCTAAAATTGCACCCAGTGAATCTCCAAAGGAA
TGGTTTCAATATGCAGCCAAGGCTGTGTTAGATGAAATACACGAAAGAAATTATAAGTGG
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TTAAAATTAGAAAACAAAATGTCGCCTGAGCAACAAAAATCACTTGATGATTTGGAATGG
GACTTACCTTATGAAGATATAAAACTATATCGTTCATTCACTAGAAATGAATTGAAGAAA
GAAAAGAAGAATATTTCTACCTTGTACGACACTGAGAGTAAATCTGCCAATGATGCCCAA
TCTACTGGTGGCGGTGGCTGGCTTTCAAGCTGGTGGGGTGGGTCCAAACAGCTGAATGAG
AGCAAAGAAAAACTGAATAACGAATCCCAATCTAGTGAAAAAATTGATCTTTCTTTGAGT
GATGAACAACGGAAAGCACTTTATGATGCTATTGATTATGATGAGAATGCCGATGCAGTA
ACAGTGGATATTCCCGGAGAATGGGTGAAGATGCAAGTCACAATGCATTTAAACAAGGGG
GGGTTTACTATCAAGCGCAACAAGACAACTACTTTAGGCGAAATTGTTTTTGAAGGCTGT
AAAACACAGTTTTATGAGCGCCCAGATTCATTTCTCGCTAGTTTCCAGATGGAGGAGTTT
AGAATTGAAGACAACACCGATACATCTCTATACAAACATATAGTTAGTGTCAAGCAAGAT
GAAGAAAACCACCAAGGTGATAGCTTTGAAAAGCCCTTTTTGCAGTTATCGTTTGAAAAC
AATCCATTGGATCAAGAAGCAGACTCAATTCTTGTTGGAAAATTGAAATCGATGACTATT
TATTACAACCCCAAGTTCATAGAAGAAATTATCAAATTTTTCACGCCACCTAAAATTCAT
TTAGATACCGTGGGAGCAATTATGAATGCAGCGGAGTCAACTGTCGAAGGATTGACTACT
CAGACTAGAATGGGGTTAGAATATGCATTGGAAGAGCACAAAACAATAAATGTCAAGTTG
GATTTACAAACACCTTTGATAATTCTACCACTTGATCCTGCTAGTGTGAAGTCCCCAGTA
GCTATTCTTGATGCAGGGCATATAAGTGTAATCAGCGATTTAGTTGATAAATCAAAAATT
AAAGAATACAAGGAGAAACAGCAATACTCTGCTGAGGATTGGGAGAGTTTGAAAAACTTG
ATGTATGATCAATTCCATGTGAATCTTGAAGACGCAAGATTTTTAGTGGGACACAATATC
AAAACCACAATGGAGCAGTTGTATTCCACCGATAGATCAACATATGTTTTAGATACATTC
AATTTGGGTTTACTTTTAGGTATTTCTATTATTCCAGATGCCCAAAACTTGGCTAGAATA
AGAATACGTGGAGATGTCCCCAAGGTTGCCTTAGCCATTAATGATTTCCAGTATAAGACT
TTAATGCAGATTATAGATGTGGCAATTCCCAACACAGATTTTGAAAGTTCGGATTCTTCC
AGTATTTTTAATGCATTTGGTAACAACAGGGGTATTGAGGATGTTGATATTGAAGATTCT
ACCCAACCGATCAGTAAGCCTAATGCTCCAACAAATAAAGATCAGCATCAATTTGAGTTT
GATTTGAATGTTAAGTTGGTGCAGATTTCGCTCTCTAGATGCATAGATGCGGTAACATTG
CAAACGGAGCCATTGGCGGAAATTGTTGGTGAGTCCATGGCATTGAATTTCTACAAAACC
CTTGCCGACATGTATTTAACATTAAGTGTTTTTGACATCAGCTTATTGGATCACATTGAA
AAATCAGGAGTGCCAGAGTTTCAAAAGTTAGTATCGTCAAATAGTGAAGGTGAAAAGAAG
AACTTGCTTGAAATGAAATACTCACGAAAGCAAAGGTTGGTTATGTTTAAAAATAAAGAG
ATCGAGGTATTCGACCAAGATGTCGATATGCAAATTGCTGTTGTCAAATTCGTGGTTACA
AGAAAATCTTACTTGAGCTTGTTGAATTTTGTGTTAAATACTTTTACTGATCCAAACGCA
CCAGCAACACCAGCTGACGAGTTAATAAATGCCAGTTCAAGCGAAGATACTTCACCACAG
AAAATTAATGTCAATGTTGCATTAGAAAGTATAATTATCGTTCTTAATGAAGATGGCATC
AAATTGGCGACATTACAGTTGAGCTCGGCTGAAGTGAAAGTGTTCTTGTTACCGGATACA
ATGGATATACAAGGTAAACTTGGAGCATTTGCATTGCATGATGAAGTAAACCAAGGCTCT
CCCAGAGATTCGTTGATTAGAAATCTTATTCACATTGATGGTGACAATTTGGCTCAGTTT
TCTTATAAGGCTTACGATAATGTCACTCAAAATAAACCATCAGTTGTGGAATTTGAAACA
GGTGCTATCACAATAAATTTTATCGAGGCATCATTCAATAGAATATTGGCGTATTTAAGT
CAGTTCCTTAAAATGAAGGCAATCTATGATAGTGCACGTCAAGCTGCCATCAATCAGTCT
GCCCAATTACCTGCTCAATTATTGTTTAATGTTTTAATCCATGCACCTACAATCGTTTTT
CCATTTGTAAATCATAATACTAACAAGTTAGTGGCCAATTTGGGAGAGATTTATGCCCAT
AATCAATACAAAGATTCAAGTAATACGATACAAGTTGGTATTCGTAATGTTAATGTTATG
TCACATTTGGAGTTTGAAAATGATATAAAACAAGATCTGCATATGGTAGATGATTTGGAT
ATTTCCTTTGATATAGCATATTCAGAGAAATACGTTAAAGACGTACCAACGTTTGTGGTA
CGTGGCAAGATGCCCGAGTTAGATTTGCATCTAACTGAAATTCAATTAAAAATGTTGACA
CAGCTCTCTGATTCTGTGAACAGAGCCTTTACGTTTGATGACTCAGATTCTAATTTACAG
GATGTTGAAGAAGATGCTGTTTATGCGAACGAAGTTCTCAGACACAACACTCAAATGATA
CATGCTGAATCACCCCAACAGCCAGCAGCAATAGTTTCTCCTGATACCGAGGATACCGAT
ATCCCTGGAAATCATAAAATGGTTGACTTAAAGTTTGACGTTCCTCGAGTAGCTTTGACT
ATTTACAATGGAACTTCGAGTACTGCTACGTTGAAAGATTACTCATTGTCTTCTTTTACA
ATGAACAAATTTATTTGCGAATTTGATATGTTGCACGATGGGCACTTTAATGCCAATGTT
AAAATCAAGTCATTTGTTGTCAAAGATACCAGAGTTAATACAGATAGCAAATTCCCTGTG
ATCATTCCTAGCGTTGATGGTGTTGATAACCAATTCACGTTGTTAGTTACGACCGAAGGT
CCTGCAGAAAGTAGGAATATAACTGCTATGTTAACAATCGAGAAACCCCAAACAATATTA
GCACTCGACTACTTGTTCGAAGTACAACTGTTTATAAACAAGGCAATTGAACAAGAAGCA
TCGCCACCTTTTGCTGAGAGGCCAAGACAACAGTCTAGAACGTCTATTACAACAAGTTCT
GCAAAAATTCTAAACACTGAAACTACTAAACCGGAAAACCTGAGTTCAAGCAAGGTAGGG
TTTTCACTCAATATAATCGAGCCATCTGTTCTTTTACTTGCAGATGATACCCGAGAAAAT
ACTGAAGCAGTTGTGTTCAAAGTTGGACAAATTTTAGTTACTCAACAGAATGTAATCTCG
TTAGCTGCAAATAACATTGGAATGTATTTGATGGATATGAACGAGCAGGATACTTCTCGG
TATAGAATTATTGATGATTTTTCCATATCTTTTGCACATGATTCCCGTGGCTCTACCGCC
ACCAAGTTCTTGACAAACATTCAAGCATCCATAGATCCATTAATTGTAAGAGTTTCGTTG
AGAGATATTCGACTTGCATTGGGTATATTCAATAGAGCCAATGAGCTATACATGAAGCAC
CAAGGTGTTGTAGAGGATACATCGAATTCAGAAGAGTTTCAGTTTTCAAAGAATTTCAAA
AAGAGGCTTTCACAATACGCTCCGAGTGTACTTTCAACATATTCCGATGATTCTGATTAT
GAGGCTCCTCGAATTCCAGAAGGTGTTGCTATTGTGAAAGGTGAAGAGATGAATGCCAAT
TTTGGTGGTTTGAGATTTGTTTTGATTGGTGATGTATCAGAATTGCCTGTCCTTGATATG
AAAATCAAACCTTTTGAAGCACGAGCAATTAACTGGTCCACGGATCTTAATGCTGAGGTA
CATATTGAGCATTATATAAATATATTCAATTATGCACGATCATCTTGGGAGCCATTGGTT
GAAAGTTGGCCAATAGCAGTTTACATGTCAAAATCCCGACACCCAAAGCCTCAATTATTA
GTAGAGGTGATTTCTAGACAGGTAGCTCAAGTGACGCTTACATCCAAAGCAGTAGCATTG
CTATCTCAAGTATCCGATTTGATTACTTCCAGAGAAAAATTAAAACCAAGAGGTGAAGAT
TACCCATACGTGATAGTGAATGAGACTGGTTTAGATTTGGAAGTTTGGAATGATGCAAAT
GAATTCGAAACCAAAACTGGAATCAAATCATGGGATTCTAAACCTTGGAGCTTTGAGGAC
TGGAGATCCATCCGTGAAAACTTGGATGCGGATGATGCTAGTACATTGGGAATCAGATTT
GTTGATAGTGAGTACCAGAATATTGTCAGAGTATCAGCGTCTAGTGTTGGAGAGGAGTTG
TATATTATGCAACCTCCCGTCTGTGGAGTTCATAATAGATTATCGGTTGATATTATGCTA
AGAGAGGATAATGTCAAAGTTATTAGATTGAGATCAACAGTTATGATAGAGAATGACGCT
GATATACCTATCATTATTGACATCAGCGATACAAGAGGGGATAAAGAATTGTGCATTGGG
TCTAAGGAAACGAAGTCTTTACCTATTGATTTGGTTTATGGAGGGAAATTGAAGATTAAA
CCAGAGACCAATATTTCATACGGTTGGTCTGAAGAGCAACTATACTGGAAGGATGCTATG
AAAGGTTGTATTGCACTAAGTTGTCGTGCAACAAGTAAAGACGATAAGTCTGTTTATTAT
TTTCAAGCAGAGGCAGTATATGACAAAGAGGAACCTTTGGCCAATGTGTACCCACATATG
AAATTAGTGGTGTCTGCACCATTAGAAATTGAGAACTTGCTTCCATTTGATTTCAAGTAT
AGATTATATGATAAACATGCAAGGAAAGATTGGACAGGCAGAGTAGAGAAAGGTGTCAAG
AGTTATGTTCATGTTGTTAATTTGGAGAGCTTACTACTTCTTAGTGTTGAACCCGTGAAC
ACCAGCTTTAAGAAATCGGAATTTGCTGTAATAAATCATCCCAAGAAAAGTGAATTTGAA
AGAGAAAATACAATTACATTACAAGATGTTAACAACAGGATACTCAAGTTGAGGATATAT
TACCCTAGAAAAAAGTCAGATAGTACAAGTTTAAAAGTTGTGATTTATTCCCCATATATT
ATTTTGAATCGATCGAATTTGAATTTAGCTATCAGCGAGCGAGGTAACACTATTGAACTG
CTTGGTAGGTCTGATGAAGAACGCAAGATTACACCTGTTATGTTTTCATTTGAGAAGCAT
GGTGACACCAAGAATCGAGCAATCATAAGAGCCGAAGATTCGATTTGGTCTCAGCCTATG
AGTTTTGATGCTCTTGGGCAATCGAATGAAGTCAAATTACAGATTACGGGGAAACAAATG
GAAATTGATCTTGGTGTCACAGTTTCAGAAGGAGAAGGCAAATACAATTTAACTAAGGTT
ATAAGCATTACTCCGAGATATATCTTTGTCAATAAGCTAGAAGAAGAGTTGCAGATTGTG
GAAGTTGGCACCACAAAACATTTGTCTATAAAGTCTGGTGGATCGTTGCCCCTTTATGGT
TTGCGCATGCTAGAGAAAAAGAATTTGATGATGAAGTTCCCACAAGCATCAGGATCAATG
TCTTGGTCACAGCCATTCTGTATTAATGATGTTGGACAAATGTTTGTGAAAGTACTTAAA
AAGGATGTGGGACAAGTATTGGTGAAAGCCACGATAATGCTAGAAGATGCAACCGTGTTT
ATTCATATAGAAAATGGTAATGATCAATGGCCATTTTCTATTCGAAACTTTACTAATGAA
GAGTTCTATATTTACCAGAACGATCCAAATATTAATGCCAATGGTGAAGTTGTAAAAAGT
GAAACACCATATAAACCAATCTATTACAAGGTTCCACCAAAAAGTGTAATGCCGTATGCA
TATGATTATCCGAATGCTATTATCAAGGAAATAATCATTAGATCACATGGACGAGAGCGT
GCGGTAAGTTTGGCAGAAATTGGTAACTTGAAGCCCTTTAGACTTCCTGCTACAAATGAC
AAGGAACAGAGAATTGTTGACCTCAATGTTGTTGCTGATGGACCTACACAATCCTTGGTT
ATTTCAAATTATGACCCATCCAGTAGTCTATACCAGATAAAAGGTGGTTCGACTTCGTCG
AGCTCAGTGGCAAATAGTCACACTGGTCAATTTGAAGCGGTAGAAAATGATGAAAATTAC
CACACCAAAATCGTTACAAAGTTTGACGGATTTGGGGTGTCTTTGATCAATACAAGAGAT
CAAGAATTGTGTTATATAACTTTGAAAGGATTAGAGTTTAGATATAATGAGTCTAATTTG
TATCAAAATATTAGTGCAAAATTGAAATGGATTCAGATTGATAATCAACTTTATGGAGGC
ATATTCCCAATTATTTTATACCCAAGTGTTATTCCGAAAACCGGGAAAGAGTTGAATAGC
CATCCAGCATTCTCGGGATCTATCTGCCGTGTGAAAGATGATACACATGGTGTATTGTTC
ATTAAGTATGCTACCCTTTTGTTGCAAGAAATGACATTAGAGATTGATGAAGATTTCCTT
TTTGCATTATTGGATTTTTCCAAGTTTCCAGGGGCATCATGGAACAAGCAACATGTAGAC
AGGCTATGTGATGACAACTTGAATATACCCGAGCCAGCTAAGCTTAGCGACACCAGCGAT
ATATATTTTGAAGCATTACATTTACAACCACTTCAAGCAAACTTATCATTTGTGCGAACC
GAAAGGGTCAATGCAGAGGATAAGGGTTCATCCCAAAACACATTGATGTTTTTCGTTAAT
ATTTTGACAATGGCAATCGGAAATATAAATGATGCACCAATAAAGTTAAATGCTTTGTTT
ATTGAAAATATAAGGGTACCGATCCCAATTTTGGCTGATTCAATTCAAACACATTATAGC
CAAGCCTTTTTCTATCAGCTTCATAATATCATTGGATCAGCTGACTTTTTGGGGAATCCA
GTGGGTTTGTTTAATTTGCTTTCTTCGGGTGTCATTGATATATTTTATGAACCTTACCAA
GGATTTGTTTTGAATGACCGTCCGCAAGAGTTAGGGATTGGTATTGCTAAGGGTGGATTG
AGTTTTGTTAAGAAGTCTGTTTTTGGATTTTCCGATTCTATTTCGAAGGTAACTGGATCT
ATTGCTAAAGGGTTGTCGGTAGCCACTATGGATAAACTGTTCCAAGAACGCCGTCGTTTG
AATACAAGGAGAAACAGACCAAAACACGCATTGTATGGGTTCGCTACTGGTGCTAATTCT
TTTTTCGATTCGTTGTCTTCAGGTGTTACGGGAGTGGCCACAGCTCCTATTGAAGGGGCA
AATAGTGATGGCGCTGCAGGATTTTTCAAGGGGCTAGGCAAAGGAATTATTGGATTGCCC
ACAAAAACCGCCATTGGGTTTTTTGATTTGGCATCAAATGTCAGTGAGGGAATTCGTAAT
ACCACGACTGTTTTCGATAGTGAGGGGTTAGATAAGGTTCGATTGCCACGATATGTAAAC
CCTAATGGGGTTGTCAAGCCATATTCACAAAGAGAAGCACAAGGTCAATTTTGGCTTAAT
AATGTGGATGGTGGTGTCTACTATAATCAAAAGTATTTGGCACATTTGCTTTTACCAGGC
GAAGAGATTGCGGTTTTGATTTCCTTCAAATTGATAATTTTGTTTGATATAAATTCATTA
TTGTCGAAATGGGTAATTAAGTTTGAGCAAATCAAGTCGATTTCAGTTGAACCTACAGGA
TTGACAATTCAGTTGAAAGCTAAAAAGGGTCCATTCATACCTATTCCAGATAGAACTAGC
AGAAATTTCTTATATCAGAAAATTGGTATTGCTGTTCAAGAATTTAACAAGCATTGTCAA
GTAACTCTCTAG |
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Promoter Sequence
Download FASTA
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>VPS13 C4_06060W_A
ATACCCCCAAATCAATCACAAACGGAATACTACAAATTGGTAGTATCTAGGTTAAAAAAA
GTGCAAGATAGCATTGATGATTATTGTGAGAAATATAACAAGCTATTGCCGATCATTAAT
CTCGCTCAAATAAAGTTGGGGCACGATGTTGAAGGGCCACCTCCAAGTAAAATAAAATCC
GAAACTTCAACTAATAATAATACGCCAAATATGGGGAATAAGACGACACCTGTAATGGGG
AATAAGACGACACCTGTAATGGGGAATAGCAGTACACCCAGTATTGTGACAGCTAATACC
AATACAGCAGCATACCTGACGTCAAGCAATACTGCGGCGAAACCTACAAAGAAAGCAACC
AAGAGGGCCTCGGTGAGCAATAAAGATATGGGAAGTAGTGCCAATCAACCAATTGTCATT
TAAAGAGAAAGAGCATAAAGCCTTGGACATAGTTCCTACTGTACTTGTAGATGTTTGAAA
GCTTGCTGGTCAATGCACCACATCCTGAGCCGATCATGTTTATCAAAAGTGGGTAAACCA
AGCTTGCACTTAAGAATAGTATAACTAACATTTATTTCGAAGCATATATAGATGTATGTA
TTATATATAACACAGTTTTGTATTGTATTTCGTTGGACAGAATACAAAGGAATTGGTATT
GTAAATTATACACGACCTTTATATAATCTCACTTCACAAGTTGATCTGCGAGAGACCGAG
ATTTTGATGTTGCTTGTGTAAGCAAAAAATGGGTTGGTTGCTATTTTCTAATTTTACTTG
TACTACAAATTGACAAACGACATCAATTAGAAAGACGTCTCCTATTTGTTGGCAATTTAT
TCCTGAAATTCTTTTTCCTTTTTAATTTTACCTTTTTTTTCAATCATTATTTTCTCCTTA
ATTTATAAAACTAACCAATCCATTTTTATCAAAAACGATAGATCACACTTATCCATTAAA
GAACTTTCAGAGATTAGTTGATTTACTACAGCGCTAGAAT
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| Chr coordinates |
Ca22chr4A_C_albicans_SC5314:1341803-1351054W |
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