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Orthologs
Standard Name
C5_01610W_A Systematic Name
C5_01610W_A Alias
C5_01610W, C5_01610W_B, CA3236, CaO19.13676, CaO19.6297, CAWG_04548, Contig4-2128_0002, DEG1, IPF15695.1, IPF20852.1, orf19.13676, orf19.6297, orf6.5447 Allele
C5_01610W_B Strain
SC5314 Description
Uncharacterized ORF; (orf19.6297) Ortholog(s) have pseudouridine synthase activity, role in mRNA pseudouridine synthesis, tRNA pseudouridine synthesis and cytoplasm, nucleus localization External sources
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Gene Sequence
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>C5_01610W_A C5_01610W_A
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GTTGCAAATACATCAAATAGACTTGTCACCACAACGAAAATGAGTACTGACTATACAAAT
TGGTCAAAAGAAGATTTGATTTCCAAAATCAATCAACTTGAAAGTAACTCCTCTACTACT
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TGTTTGAGACCACCACCAGATTTTGACGCTAGATTCAGTTGTTTATCTCGTCATTATCGA
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TTCCCTACTAAACCACAATATGAAATGGCTCATGATATACCATTGGTGTTGTATGATTGT
GAATTCCCATCAATGGAATGGAAATCCACTGATGATGAATATAGATTACATCGAGTAATA
CAAGGTTTCACTCGAATGCAATATGATTTACAATTGAAAACCCAAATGCTGCAAATTATG
GAAGATACTTTATTCAAAAATCAAGATCCAACCACTACTACAACCAAAATTTTGAAAACT
ATGAATAATGGTGATGGAGTTGGTCGATCTTATAATAAATATATGCCAATACTGGAACGT
GAACGTACTGAAAGTTATGAAGTTTTGAATCTAAGATGGATGGAAAAAAAGGGATATCGA
AGAGGACAAGAAAAACTCAATAAAGAATAA Promoter Sequence
Download FASTA
>C5_01610W_A C5_01610W_A
ATTTAAGAGGTTCATCACTAGACTCTTGTTGATAAACTTTATTGAATATTTGATAAAAAT
GTTTCACTGATGTACAAGTAGGGAAATAAACAATGGCCTTTTTATATTGATATTTTGATA
ATATCGTTAATAATGTGGTTATTTTCAATTCTGGATTAATCATCATATATGATAATTGTA
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ACAGGAAATCTAATAATTTATCAGCTTCATCAAGGATAACTATTTCCAAAGATGATGTTT
TAATTGATTGTGAACTACCTAAAAATTCCAAGATTCTCCCTGGAGTTCCAATTAATATTT
GTGGTTGATTCGTTAAAAATTGATTTAAATCTTCTCGAACATTACCTATAGATCCAACCA
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GTCCTCGTTTAACTGGTTCTGGTAAATCTCCATCACTATCGGGTTTATATAATCTATCAG
AAATTTTTTGTAAAACAGGGATTACAAATGATAATGTCTTCCCTGATCCAGTGACTGCTT
CAACTACAACATCTTTATTACCACTCAATAATGGGATAGTCGATGCTTGAACTGGAGTCA
TAGTGGGATACCCCATTGATGATATTGCTTCTTTGATCCATGAATGCAAGTCATAACGTA
AATTCTCCCATGCAAGAGATTCAGTATTTGATTTCATAATTGGTAGGTAGGTTGGTTGGT
TGGTTGGTTGGTTGTATTAGAGAGATGAGTTTGAGATGGG
Chr coordinates
Ca22chr5A_C_albicans_SC5314:357144-358613W
