|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
TSM1 |
|---|
| Systematic Name |
C6_04500C_A |
|---|
| Alias |
C6_04500C, C6_04500C_B, CA3183, CA3184, CAWG_04931, IPF13636.2, IPF15656.2, IPF25176.1, IPF25185.1, orf19.2135, orf19.2136, orf19.9682, orf19.9683, orf6.287, orf6.5369, orf6.5370, TSM1.3f |
|---|
| Allele |
C6_04500C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.2135) Putative transcription initiation factor TFIID subunit; transcript is upregulated in clinical isolates from HIV+ patients with oral candidiasis; Nrg1-regulated |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>TSM1 C6_04500C_A
ATGCCGTCTGCATCTAACCATGGAACGCCAAGAATGGTTGGTGGACTAATAAATACTCCA
CTTGCGAGACACATTAATGCAAAAAAAGTTGTTAACCCAGTGATTCAATCCTTTAAAGTT
GCCCATCAAAGAGTTAACATCGATATTGACCTATCTAGCAATAGTATTGATGGGTTTACA
GAATTGACAGTCATACCTACATCGAATAAACTTAAAGTGATAAAGTTGGATTGTCGTGAG
ATGGAAATAAAAGATGTTTTGATTAATGGAAGTAGGTCATTGAATTATGTATATGACGAT
TTATTATACATCAACAACCCCGAGTATTTTGAGCACTGCATCGACTCTAAAGTCATAAAT
GTTATGGACTTGTACTCCGATACATTCAATGTACATCAGCACCATCTAATACGGTCTAAA
TTGGATTACATCTTTAAGAATCCCAAGCACGACGAAGAGAGTTTGGACTACAACACCCAG
GAACTTAAGATTCTTTTGCCAGACAATATGAAGTTTGAGTTGACCGATATCAATTCTATA
CAAACACCAAGCGGAACTAGTCATCCAGGGACTACTACGCCCCTGCATCTAAAATCCAAG
GGCACGGGAAACGAGTACTACTACACACCTATACAGTTAAAGGTTGTTTACAAAGTCAAG
AATCCACAGAATGGAGTCAATTTTGTTACAAACGAAGACATTGAAAAGAAGCTCTGGCAT
GCATATACAACAAACTCCAACTACAACGTTTCCACGTCATCATGGGTCCCCTGCATTGAT
GATTTGTCTAGCAGATGCACATGGTCGTTGGAAGTAAATATTCCGAGAACACTCAAAGAC
ATTGGAAATCCACGAATGATAGGATCCAAGGAAGCGTTAGATTATCAACAAATGAGAAGA
AAGCGATCAGGCGAGGCTATACAAAACTTTGCCCAGCAAAATAATGATAGTGATGATGAT
GATGATGATGACGAGGATATTGGCAACTACGACATGGTTGTTCCATCTGGTGATTTCAAC
AACGTCAAGGAAACGCCACACCCCATTGATTTGTCGAAAAAAGTTGTGTCGTGGTCTATA
TTCAATCCTGTTTGTGCCCATCATGTAGGCTGGGCCGTGGGATGTTTTGAAAGCTTTGTT
CTTTCTGATGAGTCAGCTGGGGCAAAAGAGGATGATGAGGAAGATACGGTGCTAAGAGGT
GACGATGCTGAGAATGTGAATAATCCAGTGACAATCTATTCACTTCCGGAGGACGTTGAG
TGGGCAAAAAACACTAGTATTATCACCAACAAGGCGTTGGATTTCTTTCTGAAAGAGTAT
GGGTCGTTCCCATTTAGTTCTTATGCCATAGTATTTGTGCGGTACCTGCCGTGCCAAACC
AGTAACTTTGCTGGACTCTCGGTAATGTCATCAAAGTTGTTGTACCCACCAGATATGATT
GAACCAATGTTTACTGTAACTGATATACTATTGAAAAGTATAGCCACACAATGGGCTGGC
ATCAATATATCGCCACAAACATTCAATGATATGTGGTGCACCATCGGTATTGCTGGGTTT
ATGGCAATCTCGTTTATCAAAAAATTGATGGGTGCTAATGAATTTCGGTATAGGCTACGC
AAACAAATGGATAAGGTGGTAGCTGAGGATGTGGGGCGACATGCTATTGCATCCCAGCCA
TTTAAGTACCCTGTTTCGGAAGACGATTTATCGTTTGTGTGGTTGAAATCGCCCATTGTT
TTATTTATTCTTGATAATAGAATGACAAAGACCGACAAGTCATTTGGGTTGTCGAGGGTT
TTGCCAAAGTTATTTCTTCAGGCAATGTCAGGAAGTTTACCCAACGGCACATTGAACACA
GAACATTTCCGTTACGTCTGTGAAAAAGTGAATCGAAACAAGTTGGAAAATTTCTTCAAG
CAATGGGTGTTTGGTGCTGGGGCGCCTGTTTTCCGAATCAGCCAAAGATTTAACAAGAAA
AAGGGGATGATTGAAATGAATATCCGTCAGGTCCAGCACCATGAAAGGACACCCAAGAAA
TTGGATAGTTCTAGTTTTATTGGTGATGCAGTTGCCTACTTGGACAACGAACCGCTACCA
CCGCAACAACATGTGTTTACTGGCCCTATGACTATAAGAGTGCATGAGTCTGATGGGTCA
CCTTACGAGCATATTGTCGAGTTGAAAGAAGCAAACACCAAATTGGATATTCAATACAAT
TCAAAGTTTAGAAAGATTAAAAAGAAGGATGATGGAGTTGATCCTGGTATAGCGTTTAAT
CAATTTGGTGATGTGTTACTATCCCATGCCGAGATGCAAGAGTGGAATTTACGTGATTGG
GATAAAAGAGATGAGGAATCTTTGAGTAGTGAGCCATTTGAATGGATCAGGGGCGATGTG
GATTTCGAGTGGATCGCTCGAATCGACATTAAGCAGCCGGATTTTATGTTTGGATCGCAG
TTGGTCTATGATCGAGACATTGAAGCACAATTAGAGGCTGTGCGGTATTTTGGTGAGTTA
GAGAAAACAAACACGACGTACTGTACAGCTTTAACGAGAACATTAATGGATGACCGTTAT
TTTTATGGAGTTAGGATTGCTGCTGCACAGGCTTTAGCTGATTGTTCAAATGAAGCAAAC
AATTTTATTGGTTTAGAGTACTTGCTCAAGGCATTTGGCAAGTTGTATTGTTTTGACGAC
AGCTTTATTCCAAAATCAAATGATTTTAGTGATTTTAGGAGCTTTATGTTGCAAAGTGCA
TTCCCTCGAATTTTGTGTGGCGTCAAAGATAATGACGGTAAAGTTCCCAAAAGGATACAG
AATTTGTTGCTTAATCTAGTGAAATTCAATGACAACTCGATGAACGCGTTTGTCGATAGT
CTCTATGTGAGCGAGTTGGTCGTTTCGCTAGTTACCAGTACTGTCAGTGGATGGAGGAAT
GACATTGAAGAGTACAATGATACTGAATTTGCTGGGAAAGTACTGTCCGAACTTTTTAGA
CTCCAAAAGTTGGATCGTTGGATACCGTCTTACCAAAACATTATTGAAGTAACATGCATA
CAGCAGAATATCCGAATGGCTTTGGTTGGTGCTCGAAAATTGTCGTTTGAAGAGTTGTTG
TACATGACATTGGATAAATACCCCATGGAGGCGAGGGTGGAAGCGTTTAGGGGTATATTG
GAGTTGGGTGGATTAAAAAACAAAAGCATCTTACAGTACTTTCTTAAGGTTTGTTTGTTG
AACTTTGAACGTCCACTATACAGAAGCAAGTTGATTGAGGCATTGGTGAAGTCGGTGTCG
TCAGTTGCAACTTACGGCGGTGTGTCTACTCTTGACGATCCAGAATTTCACACAAAAGTG
GACACTAATGTTAAAAGCTCCTCCAACCGTATTATTATTGATGATGGATCGCAAGATAAT
TTAGCGATGAAATCAAAGAGAGATGATATGGCTCGTGCAAGTATAAAGGGTGCCATTGAG
ATTTTGCGAAGAGACTTTTCTGAGGGCCAAGGTTTGCGTGAAACGTTGTGGGAGTTGCTT
CACACATCATTGATTGGTTTGCATGAACGTAGAAGTATCTTTTGTTTGTGCCAGGTGTTG
TTCAAAGGGGTGGATTCATATGTTGTGAAGTTGCCGGTTCCAAGTATGCCAGTTGAAGAG
TATGTTCGGAAAAAGATTGTTGCCAAAGTTTCGAACTATCCAGGACAAGTGACAATCAAA
CGAGAAGGAAGATTCAAGATACAGTTGGCTACTCGAAAGTCTGTAATAGCCAAGGTGAAG
CTGGAAACAGAACACAAGCCATTGAAGATATCACTAAAGCCTGTTATTGAGGCTAAACAG
AAGGCTGCATCAGCTGTGCATGTTGATCCGGTTATTCCTACAAAGGTCACTTTTAAGTTG
CCTGGCCATAGACTAGCTGGTTTTGCGAAAAAAGTGGAACTAGATGGAACGTTGGTGACT
ATTAAACTTGGACGTGATATGAAATCAAAAGTGGATGCGTTGGCCCATCGATATGTGAGA
ATAAATACAAAGAGGAGAAAAATTGAGGTATCAAAGGTTCCATTTATTGAAAAAGAAGAG
GGGTCTAACACTTCTGGTATAACTGAGGTAAGTCGGAATACTGGAGAGAAAGAAGACGCA
AAAAGTCCATCTCCTATTCTTGTCAAAAAGGAGAAAAAGAGACCTAAAGTTTACATTCAT
TTTGGTGGAAATGTGAAAAAACCTGACCAAGGTAGTAGTAGTAGCAGCTCTAAAGAGGGT
TCAACAGAAGTAGAATGA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>TSM1 C6_04500C_A
CGATAAGCAAGACATTCTTGAAACGTGTCAGCTCAACAATATTGCCTACGTGACCGACCC
AACTAACAAAGATGTGAGCTTGACGAGGAGAAATTATTTGCGGCATTTGATAAACGACAT
TATACCTGCAAAAAACAATCAAAGCCATTCGCCGTATTTGCTAATAGATAAAAGCCAATT
AATTGATCTGCACACTAAGTGCTTGGAGTTTGCAACGATGTTTGAAAATAGGGCTATGGC
ATTGTCTGAGAGTTTACAAAGTAGTGGGCTAATTAAAGAGTTTCCTGCGTTAGGATCGCT
ACAGGTTAAATTTCCTCGCCAATGTTTGGATCAAACAAATGGGATTGTTACAAGCCGATT
TCTTTATAGGATTCTACACTCCTATTCTACGTTAAAACACTACCACTGGGCATATGCCAA
ACTAGAAAGACAATTGATACCCAGAATAACCAAGTTTCTTGAGCAGGGCCAATCCGGCAC
ATTCAAATTGACAATGATGAATTTGGTGTTTGAGGTTACAAATAACATCCAGTCTGAGTA
TGTTCCCATTCACATATACAGGTGTCCAATAACAACAAAAGACTGGCCGTCCATGCAAGA
AACACTAACTGTTAGCCCCGAGTGGAGCGAGTGGAAATTGTTTGACAGTAGATTTTGGTT
AAGAGCAAGATCAAACCGCTATAGTGGCCAGCTTTCAGTTATTCCGTATATCCATAAAAA
GCATAAGCAACTCTTACACGACAACCTCGACGCCAACAAGTCTTTTGACACACTTCCAGC
AATAAAAGCCAACTCTGGCAAAATCATAGCCTTTCCAACTTTGGGAGCTATGTGTTCTGA
CTATGGTATAGTCTACGAATGGAGGCCTAAAAAAAATAGATTCTCCTACTGTAAATAGAT
ATTTGTTTGCATGCACGACTTGTACATATTTTTAAAATCGACAAAAAAAAAAAATAACCC
ACAACAATCTTCACTCTTAGATACAACACACATCTACAAC
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:1003501-999224C |
|---|
|
|
|
|
