|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
CR_05500C_A |
|---|
| Systematic Name |
CR_05500C_A |
|---|
| Alias |
CA2883, CaO19.13274, CaO19.5852, CAWG_01873, Contig4-2975_0001, Contig4-2975_0002, CR_05500C, CR_05500C_B, IPF12562.2, IPF21357.1, IPF3790, IPF3790.1, orf19.13274, orf19.3520, orf19.5852, orf6.1953, orf6.4954 |
|---|
| Allele |
CR_05500C_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Uncharacterized ORF; (orf19.5852) Protein of unknown function; rat catheter biofilm repressed |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>CR_05500C_A CR_05500C_A
ATGGCAGAGACTTATCAGAGCACTTTATACTCGGAGTTATTCAACGATAGTATCGATAAC
GACGATGATTTTTACAAATCCATATTTGTTACCCCAATAGCAAAAGACTTATTAACAACT
GTATTAAACACAAACACAGAGGCTATAGTGTTGACATCTGAAGTCTCTGATAAAAACTTG
TTAATTTTAAGCAGAATTTATTTTAGTGGATTGAAAGTTCTTGCTCAAGCAACTAATTAT
CATCCCCTGGATGTAACTAAATTGTCCAATGAAAAAGTCAAATCTATAGTAGGAATTTCA
AAACAAAACCGGACAGTATCATCTGAAAAACTATTTGACGATGAAAGTGGAGATATTACT
GAACTAAATGGGAACGTACTGAAGAATACAAGTAAACAAACATTGAATGAATTTGATGAT
GGTGACGATTTAACAACTCTAAGCGGAGGAAGGCAAGGTTGGCAGGATCTGCTAAGTAAC
AACCCAGGTTTTCCATTAAAAGATGAGAATGCGTTTAGTAATCTAAGTGAAAAAGATAGA
ATTGATCTAATTGGAAATGTATTAAAAATATTTCAAGTCTGGTTCCAGAATTTAATTGAT
GTGGATTTCAAACTTGAAGTATCTCAGAGATCTTCTGGTATTCAATTAAAATTAAGAGTA
TTTGAATTCTGTGGAGAGAATAGTAACGGATCTTTCTTAATTGAATTATTCACTATATTA
AAATCCTTTTTGGCTACTGCTATTAAAGAGATAGAGGACACGGATCTGGAATCGAAATTC
ATCAGCTTATCTGCAATTAAAGAAAGCATCAATTTACTAAAGAAAGTTTTCACACTGATT
TTTTTGGACCTCGATATGCATAAAAAAGGTGATAATGAGTTTAAATCGCTAGTAAAATTG
TTGCTGGTATTCTTTGAAGTTGACTTTGCTGATGAATTTTGGAAACTTATAAAACTTACA
AGTCCAGATTTGGAAGACAATAACTACAAACCACCTAAAATTGTGCTATCACTTGAAACT
ATGTCAACTTTCTATTTGTTAATGGGGGTTTTAGCTAATACTCCATCGTCATTGTTTTCT
GAGGGAAAACGCAATGCTGATATCACCACATTTTCCGTGGAAATGAAAAACCCATATAAA
AGTTATTTTTCCCAGGATTTCAAGTGGGATGTTTTCAATCAGCAAGTAAACCTGAAATTA
TTACCCTTATTTTGTGTGGAGTTCAACTACTGTTATAACTTTCGTCCCGATTTAGTGTTA
GAACAGATTCAAAATAGCTCACTTATTAACTGGATAAGTGGGAATCGTTTGAGTTCTGAT
ATATATGTTAATTGCCTAACATCTCAAACGATCACAAATTTGGAAGTAAACAAAAAGTTG
AGTGTGGCAGGCTCTAAAAGTGACTTGTATTGTCAAGAATTGAACAAAATATATAATTCA
AAAATCCAAAATTTACAGGCTAAACAATCTAACGAAGAAATGAATTTGGACTTGTCTAAA
ATTTTCCCCGTTTTCCTTCACATGTACACATTTGCTCAAAATTCATCTTTTAACAGTATT
CTTACTACCCAACAGTATCACTTTTACGATAAAATTGATGATAGAACAGATGACGAATTG
AATAACGTGGAGCTTTTTGAAGTATGGGTTTGTTTATTGTCGTATGTTTTTGAATACCAA
TATAGGTCAACTTTGATGCAAGATTTAACTCAACTTGCATTATCGACACTATTAACTTTG
CCATTGAATAATTTGGTGGATTATCAAATTAATGAGTATAAATGGAAATTGTGTCATCAG
AAGGTGCCATTTGTACCTCTTGATTTGGGTGCCAAGGGACACAAACCAAGTATTTTTTAC
ATTTTAGATACTGTACAAAACTTATTAAGGTTTAATCTAACTAATAGACTCCATGTCGTT
AATCTTTCTATGGGACTAAATTTGATGTATAATATTTTGGATCACGTAAAAGCAGATTCC
AATATTGAATTGGATAAGTATTCGTGGGATAACTTATTTTTGAGTTTGTTTGGATTGATC
AAGTTTATTAAAAAGCAAAACCTGTTGATATTGAAATACATTAATCAACGTGATCTAGGT
TCTTTAACTGAAGAGTGTTTCTTGGTTTTGAATTTGTTGCTTGATACTAGGTTTTCTTCT
GTGAAACAAGTCATTGTCCAAGAGAAATCGAGTTTCATGGGCCTATTTGATTCTGATGAA
ACTAGATCTATAAACTACGCGTTAATTTACAATATTTTATTGAATTTCGAAGTTATTCAA
ACATTGATAAACGAGTTTGGGTTATCTGAAAGCGAACACTTGACAAATTTGTTTCATTGT
ATGGAACATTTTGACAAACTTTTTTATTTAACTGAAGATTCGAAAAAGGAAAGACTTTAT
AAAAAGACTGAGGTGCTTGATTTTGATTTTGATTCCCCTGTGTTTGTTGCTGCAATCAAC
TCATTCACTGACGCAAAGAATAGTAATCAGACTGAGAACTCAACAGAGGGTACGCAATCA
CCAATCACATATCAGTATAATCAAACATTGAAATACTCCTTGAAACAGAAACAGAGAGCT
GTGTTGGATGACCAAGCTATGTTTAGTCTTATCCACCGGACTTTCTTTTCAGAATGA |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>CR_05500C_A CR_05500C_A
ATTCATTGAGTGTGATATTTTCCCCATTTAGTTGAATAATGTTGGTTTTCCAGGTTAAAT
CGTTACCAATTGTTGAATGATTCACTCGAGAATATATTATAACGCTTCCAATCCATAAAA
ATATCGCCACTAAGCTGAATATGCCACATGTTCTACCGCTGATGCCTTCGTTTTTATATC
GCATCAAAACAGATTGAAACAACGGACTGTCATTGAAATCTTCAATTTTTTGACCACTCA
GACCAGAATAGTTTTCCAAGTCTTCAAAAATGTCAGATAATTGAGAGTCTGTAGAATTGC
GAAAATCAGACTCCAGTCTTGTCGGTGAATCGGTGGGTGATTGTGTTGGTGGTACTTGAT
TTACCAATTCATACTCTTCATGCTGTGGCACACGCTTGTGAGTGAACATTATTAAAATAT
TTCTGATAGTGCTATATCAGTTGCATCAAGTTCTCCACTGCAGGACTTGTATTAATTCAA
ATTCACTAACTTCAGTCAAAAATAGAAAGAATCTGAAATCTGTAAACCTGTTACACGTAT
TTATTTGATTTTAATTTTCATTCTTTTTTTTGGTAAATAAAACACGAACTATCTTTTTTA
ACCTATTTAGAATCGTTAAGACAGATCTATGAAACTAATGATATTAAAAGGTGGGAATTT
CTGAAACAAAATAAAGAACCAAGCTCTTCGGGTAAACTCTTTCTTTTATCTCTTGTATTT
ACTAGGATTGTATGCCGCTTTAATGTAACTTCGAATAACATTGATGAATCAGTTTGGATT
TTGTGCCCCCCCCCCCCCAACAGCAAAACTACAAAATTACAACTGGCGCATATGTGCATG
GTCGTGGGAAAACGCGGCGAAAATTCATATGAATTTAAGTCGATCCTTTTTTTTTTCCCA
ATTTAGGCATTTTATTCATTAAGATAAACAGTTCATTGATACCTATAGCCCAACTATCAA
GTTATTGGATCGACTCAATTCCTAACATAGAGAAACAAGT
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chrRA_C_albicans_SC5314:1171228-1168592C |
|---|
|
|
|
|
