PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Go Back > View Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Locus Information

Standard Name CR_09490W_A
Systematic Name CR_09490W_A
Alias CA5577, CaO19.7344, CAWG_02216, Contig4-2379_0001, CR_09490W, CR_09490W_B, HDA3, IPF12537, IPF12537.1, orf19.7344, orf6.8425
Allele CR_09490W_B
Strain SC5314
Description Uncharacterized ORF; (orf19.7344) Ortholog(s) have DNA binding, chromatin binding, histone deacetylase activity and role in chromosome segregation, gene silencing by RNA, histone deacetylation, negative regulation of transcription by RNA polymerase II
External sources Open in CGD external link
Open in KEGG external link
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq
>CR_09490W_A CR_09490W_A
ATGGATTTAAGGAAAATTTTGGATACAACTCCAGAACCACCAATTATTGAACCTGATATT
GCTAATATTAATTATTCAGGAGACTATCAATTACCTACACCAATGTATGATTTTCAAAAA
GAATTAACTGATCAAATTGTATCGTTACATTATCCTGATATTTTAAAATATTGTGAATTA
AATGATCGACGAGAAATTATTATTAAATCATTAGATATTTGTCTTGAAAATTGTCAATTA
GTTTCTAATCATCCTTATTTATTGATTGATCATTATATGCCGAAAAATTTGACCTTTAAA
CAATTACCAGAAAAATTGGCTGAAACTAGTGGGAAATTTAATGTTTTCAAAGATTTAATT
AATGTTTTAATTGATGATAAAAATAATTATCTGATAAATGTTGGTGTTGTGATTAATAAT
AAACGAAATTTATTTGATTTAATTGATGCTTTATTATTAGGATGTTCTCGATCAAATAAT
AATGTGACAGTTATACGATATTCCGGTAATAATGTTTTACGAGAATCTAAAAAGAAAGCT
CAAAATAAAACCACTACTAGTAATAGTTCAACTACTACATCTACAACTACTGCAACTACT
GCAATAGCAACCACTACTACTACTACTGCTACTAAGAAGCATAAGAAAAAGCATGCTACA
AAGGAAAAAGGGTATGGGAAACACAAAATACAAAATCATTCTGTAACGATTCATTTAATT
CCGCATGATGGACAAATAAGTAAAGGTAAACCAGATTTAAAAGAGGTTAAATTTGATTTA
CTTATAGTTTTCGATGGATCAGTTGATACTGAAAGTGATTTTTTCAAATTATTAAGAATT
CAAAATCGTAATGTCAATATCAATAATAATGTTAATGATAATGTTAATGATAATTTTATG
ACACTGAATATAAAACTGGATCGAGGTCGACTCTTGACTAGAGGCAGACATCTGACTAGA
GGAAGACCTTCAACTAAAGAAAACCTTTTAGTTGATAAAAATTCTTCTGAAGAATCAATT
ATAAATTTACCTCCATGTGCAATTATTAGATTAATACCAACAAGAACTGTGGAACATGCT
AAACTTTATTATAAACCAGATGAAGATAAACCTGATTATTTAACTAAAGTGATTTCATCA
ATTGTATGTTTACGTGATTCTATTGGACAATTACCACCCGATATTTATCCAATTTATCAT
CAAAAATTGACTTATTTTTCTCATACATTTTTTGATAAATTATTTCAATCAACAACAATG
GCCCAAACAAAAATAAATGGAAAGAATAAGTATAATGATCATTACAATGATGAACATGAA
CATGAACATGATCATATTCATGACCATGACCATGACCATGAATATCCTGGATGGCCATTA
CCTGATTTACCCAAGATTATCAAGTTTTCTCCTTATGATGTTGAACGATCATTATTAACT
GAAACTCGATTCCATTATACACCTTACGATTTCAATCCTAATCATTTAAATAATGAAAAT
TCATCAAAAGATTACAAAAATCAATTGAAATCAACATATTATGAACTGAAACGATTACAA
CTGGAATATATTACTAATCCATTGAAAAATTCTTATGATGTATTAACCGGGATTTATAGA
ACCACCAATAATGATGCGAAAATTTTAACTCATAAATTAATATTACAATTAAATGAAGCA
TTTATGAAACGAGATCGATTAAATAAAGAACTTGAAACTTATAATAAATTTCATAATAAT
GATTGGCAAATTAATAAAATTGGACGACGTGATCATATTTTGAAGTCAACTAAAAAAAGT
ATTGAAGATGATATAAATCAATGTCAAATTAGAATTAATAATGTTAATAAATCAATTGAT
GAAAAAACTCAAGAATTAGAATCAATTAAATTAGAAATTAAACAATTACAATTACAATTA
GAAAATTTCAAATCTAAGAATCCAAATAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACTAGTAAG
ACCAAAGCTACAACTTCTGAAAATGAAAATAATTCCAAAAGAAAGAGAAGTGATGATGAT
GATGATAATGATGATGATAGTTTGGCACCTGATACCACTACCACCACTATTAATACGAAA
AATCAACAATTTATTGATGAACAATTTAAAATATGGGAATTACAAGAACAAATTAATGAT
TATATTCATAAAATTGAATTAAAAAATAATGAAAAACAATTTGCTTTTAAAGAATATGAA
AATTGTTTAAAATCAATTGATGATTCTAATAAACAAATTGAAAATTTAATTGATCAATAT
AATAATAATAAACGGAAATTTGATGAATTAATTGAAAAAAATCCTTTAAATAACAACAAC
AATAATAATAACCAATTTGAAATTGAAAAACAAAAATTAATTACTAAGATTAAAGATCAA
GAAATAATTAATGAATCATTAAAATTTAAATTAAACAATGCTTTTACATTTTTAAATGAT
ACTAAATATTTGAAAAAGAGGAAAAATCGAGGAATAACTCCTAAATAA
Promoter Sequence
Download FASTA
>CR_09490W_A CR_09490W_A
TACAGGAGAAATTCATCCTGATGGTGGATTATTTATGAGTGGTGGCCTTGATGGTATTGT
TCATATTTGGGATTTACGATCAGGTAGATCAATTGTAACATTACAAAAACATATGGCGGG
AGTATATTGTTTAGATTGGTCACCTAATGGATATCAATTTGTCACTGGTAGTGGTGATTG
TAGTTTAAAAATTTGGGATTTAAGGAAACTCGAAAATAATAATTCCAATAATGAATTATA
TTCAATTCCGGCTCATACTAAATTAATTACTGATGTTAAATTTTATCATCAAAGTAGAGA
TATAATGCAGAAACAACAACAACAACAAGATCAACAACAAGATCAAGATCATTTATTGGG
ATCAGAGTTTAATGATGGGAAATTCTTAGTGAGTTGTTCTTATGATGGTGATGTTAACAT
CTGGTCAAGTGATAATTGGATTAAAATCAAAAGTTTAAGAGGTCATACTGATAAAGTAAT
GAGTTGTGATATTAATAGTACTGGTAAATGGATAGTAAGTAGTGGCTGGGATAGATCAAT
AAAATTATGGAAATAATAAATGGTAGGCGGGGGGAGGGGGGTAGTAATTGATACAAACTT
ATGTAGTTATTGATTAAATTATTGTTAAAATTGTATTAACAGAATGAATATAGGCTTCCT
TGAGTGGCTCCAATCAATTATAAATAATATCTAACTTCTATTAATCGGGGCGGGTGGTGG
TTTGAAGAAAACCTTTTGTAGATTATACCGGAAGATCGGATTAAATAGAATTCTTCTTTC
CACAGAAAGGAAACAACGGAAACGCAAAACAAAAAAAAAAAATTCAAACCAACCAAATCT
TCAATTTAATTTAATTCAATTTAATTCAACTGGTTTTTTTTATCTTTACTTTGAAGAATC
ATTTATAACAAAAACCTTTTTAATTAGTTCTTAATATTTGTAACTTTTCCAACTTAAAAT
AATTATTGCATATTGCACTAAAACTAAAACTACTATAAAT
Chr coordinates Ca22chrRA_C_albicans_SC5314:2023612-2026119W
w3c xhtml validator w3c css validator