|
|
Locus Information
|
|
| Standard Name |
RPO21 |
|---|
| Systematic Name |
CR_10680W_A |
|---|
| Alias |
CA6041, CaO19.7655, CAWG_02325, Contig4-3003_0030, Contig4-3108_0124, CR_10680W, CR_10680W_B, IPF572.2, orf19.7655, orf6.9003 |
|---|
| Allele |
CR_10680W_B |
|---|
| Strain |
SC5314 |
|---|
| Description |
Verified ORF; (orf19.7655) RNA polymerase II; ortholog of S. cerevisiae Rpo21, transposon mutation affects filamentous growth; flow model biofilm repressed |
|---|
| External sources |
Open in CGD 
Open in KEGG
|
|---|
|
Gene Sequence
Download FASTA
Hide Seq |
>RPO21 CR_10680W_A
ATGAGTCGTCAATTTCCATACTCGAGTGCGCCGCTCCGTTCCGTCAAGGAAGTGCAGTTT
GGTTTATTATCACCAGAAGAAGTAAGGGCCATATCAGTGGCAAAAATAGAGTATCCTGAA
ACGATGGACCAAACCACAAAGAGACCAAGAGAGGGAGGATTGAATGATCCACGTCTAGGA
TCTATCGATAGAAATTTCAGATGTCAAACATGTGGTGAAGATATGGCAGAGTGTCCTGGT
CATTTTGGTCACATTGAATTGGCTAAACCAGTGTTCCATATTGGGTTTATTGCTAAGATT
AAGAAGGCCTGTGAATCTGTGTGTATGCATTGTGGGAAATTATTGTTAGACGAAACCAAT
CCAGCTATGGCCCAGGCTATAAAAATCAGAGATCCTAAAAAGAGATTCAATGCAGTGTGG
TCCTTGTGTAAAACAAAAATGGTGTGTGAAACCGACAATAACGAGGATGAAATGACCGAC
CAACCTTCTCGTGGCGGATGTGGACACCCACAACCAACTATTCGTAGAGATGGGTTGAAA
TTATGGGGGACATGGAAGCAAAACAAGAATTACGACGACAACGACCAACCAGAACGTCGT
TTGTTGACCCCACTGGAAATCTTGAATGTTTTCAAACACATTAGCCCTGAAGATTGTTAC
AAGATGGGATTCAATGAAGATTATGCTAGACCTGAATGGATGTTAATCACAGTTTTACCT
GTGCCACCTCCACCTGTGAGACCATCCATTGCATTCAATGAGACTGCAAGAGGGGAAGAT
GACTTGACATTCAAGTTGGCAGATATCATCAAAGCTAATATAAATGTCCAAAGGTTGGAA
ACCGATGGTTCACCACAGCATGTGATAAGTGAGTTTGAAGCCTTGTTGCAATTCCATGTG
GCTACATATATGGATAACGATATTGCAGGACAACCACAGGCTCTTCAAAAAACCGGTCGT
CCAATAAAATCTATTAGAGCAAGATTGAAAGGTAAAGAAGGTCGTTTAAGAGGTAACTTG
ATGGGGAAACGTGTTGACTTTTCAGCTCGTACTGTCATTTCAGGTGATCCTAATTTGGAT
TTAGACCAAGTGGGTGTGCCTATTTCCATTGCAAAGACATTGACTTATCCTGAAATTGTT
ACACCTTATAATATCCACAAATTGACTGAGTTGGTTAGAAATGGGCCGAATGAGCACCCT
GGTGCCAAGTATGTGATAAGAGATACAGGTGATCGTATTGACTTGAGATACAATAAGAGG
GCAGGGGATATAGCCTTGCAGTATGGATGGAAGGTCGAACGTCATTTGATGGATGATGAT
CCAGTGTTATTCAATCGTCAACCTTCGTTGCACAAGATGTCGATGATGGCACATAGAGTC
AGAGTCATGCCTTACTCCACGTTCAGATTGAATTTATCGGTGACATCACCATATAATGCA
GATTTCGATGGGGACGAAATGAACTTGCATGTCCCACAATCACCAGAAACGAGATCAGAG
TTGTCGCAAATTTGTGCGGTACCTTTACAAATTGTCTCTCCACAGTCGAATAAACCAGTG
ATGGGTATTGTCCAAGACACATTGTGTGGTATTCGTAAGATGACGTTACGTGATATTTTC
ATTGAATATGATCAGGTTATGAACATGTGCTACTGGATTCCAAATTGGGACGGTGTGATC
CCGCCACCAGCTGTTGTAAAGCCAAAACAATTGTGGACCGGGAAGCAATTGTTGTCGTTG
GCAATTCCAAAGGGTATCCACTTGCAAAGATTTGATGGTGGTAGAGACTTGTTGAGTCCT
AAAGATACCGGTATGTTGATTGTTGATGGTGAAATTATGTTTGGTGTTGTTGACAAGAAA
ACTGTTGGGGCCACCGGAGGAGGCTTGATTCACACGGTTATGAGAGAAAAGGGACCTAAA
GTGTGTGCTGAATTGTTCAGTTCTATTCAAAAAGTGGTCAACTACTGGTTATTGCACAAT
GGGTTTTCCATTGGTATTGGTGATACTATTGCAGATGCGCAAACCATGAGAGACGTTAAT
AAGACTATTCAAGAAGCCAAGCAAAAAGTGCAAGAGATCATTATTGATGCCCAACATAAC
AAACTTGAGCCAGAGCCAGGTATGACATTGCGTGAGTCCTTTGAACATAACGTATCACGT
GTTTTGAATCAGGCCCGTGACACTGCTGGTAGATCAGCGGAAATGAGTTTGAAAGATTTG
AACAATGTGAAACAAATGGTTACTTCGGGGTCTAAAGGTTCGTTTATTAATATTTCTCAA
ATGTCTGCGTGTGTTGGTCAACAAATTGTCGAAGGTAAAAGAATTCCATTCGGGTTTGGT
GATCGTTCTTTGCCACATTTTACAAAAGATGATTATTCACCTGAATCTAAAGGTTTTGTT
GAAAATTCTTATTTAAGAGGGTTAACTCCACAAGAATTCTTTTTCCACGCCATGGCTGGT
AGAGAAGGTCTTATTGATACTGCTGTGAAAACAGCAGAAACAGGTTATATTCAACGTCGT
TTAGTCAAGGCATTGGAAGACATTATGGTTCACTACGATGGTACCACCAGAAACTCGTTG
GGAGACATTATACAATTCATCTATGGTGAAGATGGTATAGATGGTACCCAAGTTGAAAAG
CAATCAGTCGATACAATCCCAGGATCAGACGAAAGTTTTGAACGCCGTTACAAAATCGAT
GTTTTGGATACTGAAAATGTCATTTCTGAATCATTGCTTGAATCTGGAAAAGAGATTAGA
GGTGACGTGCAGTTACAAAAGATATTGGATGAGGAGTACAATCAATTGTTGAAAGATCGT
AAGTACTTGAGAGAAGTTTGTTTCCCCAATGGTGATTTCAGCTGGCCATTACCAGTGAAT
TTACGTCGTATCATCCAAAATGCTCAACAGATTTTCCACAACGGTCGGTACAGGGCATCT
GATTTACGTTTGGAAGAAATTGTTCTTGGGGTGAAAGAATTGTGTATGAAATTATTGGTT
GTTCGTGGTGACACTCCGTTAGTCAAGGAAGCACAAGAGAATGCAACGTTGTTGTTCCAG
TGTTTGTTGAGATCCAGATTGGCTGCCAGACGTGTTATTGAAGAGTTCAAGCTCAACCGT
GCATCTTTTGAATGGGTAATGGGCGAAATTGAAACGCAATTCCAAAAATCTATTGTTCAT
CCTGGTGAAATGGTGGGTGTTGTGGCAGCTCAATCTATTGGTGAGCCTGCCACCCAAATG
ACCTTGAATACTTTCCATTATGCTGGTGTCTCATCAAAGAATGTTACATTGGGTGTTCCA
CGTCTTAAGGAAATTCTTAATGTTGCCAAGAACATTAAAACACCAGCAATGACAGTGTTC
TTGGACCCAGAAGTTGCTTCTGATATTGAAAAGGCAAAGATTGTACAATCTGCCATCGAG
CATACTACATTGAAGAATGTCACTTCATCAACAGAAATTTATTACGACCCTGATCCTAGA
ACAACGGTTATTGAGGATGATTATGATACTGTGGAAGCATATTTTGCTATTCCAGACCAA
AAGGTTGAAGAATCTATTGACAAGCAGTCACCGTGGTTGTTGCGTTTGGAGTTGGACCGT
GCGAAAATGTTGGATAAACAATTGACCATGGCACAAGTTGCGGAAAAGATTTCGCAGAAT
TTTGGGGAAGATTTGTTTGTTATTTGGTCTGATGATACTGCTGATAAATTGATTATTCGT
TGTAGAGTTGTCAGAGATCCTAAATCATTGGATGAAGATGCCGATGCAGAAGAAGATCAA
ATTTTGAAGCGTATCGAAGCCCACATGTTAGAGTCTATTTCTTTGCGTGGTATTCCAGGT
ATTACTAGGGTATTTATGATGCAACATAAGGTCAGTCACCCAGACGAAACTGGTGAATTC
AAGCAGGGCAAGGAATGGGTTTTAGAAACCGATGGTGTTAATTTGGCAGATGTTATGGCC
GTGCCTGGTGTGGATTCGACACGTACTTACTCTAATGATTTTATTGAGGTGTTGTCTGTT
TTGGGTATTGAAGCTACGAGATCGTCTTTGTACAAAGAAATTTTGAATGTCATTGCGTTC
GATGGTTCATACGTCAACTACCGTCATATGGCATTGTTGGTCGATGTTATGACTTCCCGT
GGTCATTTGATGGCAATTACTCGTCATGGTATTAACAGATCCGATACAGGTGCGTTGATG
CGTTGTTCGTTCGAAGAGACCGTTGAGATTTTGTTGGATGCAGCAGCTGCTGCCGAATTG
GATGATTGTAAGGGTATATCAGAGAATGTGATGTTGGGACAAATGGCACCTTTGGGTACT
GGTTCCTTTGACTTGATGGTTGATGACAGAATGTTGCAAAAGGCACCATCGAGTATGGCT
ATGGATGATATTGCTGATGGTGGTGGTGCTACTCCATATAAGGACTACGAGAATGCTAGA
GATGAGAACATTGACATTGACGCAGGTGCTGGATTCTCACCAATTCACATTGCCCAAATG
AATGAAGGAAATATTGGAGGGTTGACGTCATATGGTGGCCAGCCTACCTCGCCTGCTGCC
ACGTCGCCATTTAGTTATGGATATAACTCGATTACATCTCCAGGGTACACTTCACCAGGA
TATGGTTATTCACCAACGAGTCCAAGTTACTCACCAACGAGTCCAAGCTACGCTCCAACA
AGTCCTGCATACTCACCAACGAGTCCAAGCTACGCTCCAACGAGTCCTGCATACTCACCA
ACGAGTCCAAGCTACGCTCCAACAAGTCCTGCATACTCACCAACAAGTCCTGCATACTCA
CCAACGAGTCCGTCCTATTCACCTACTTCACCACAATACTCACCTACTTCACCAAGTTAT
TCCCCAACATCTCCATCCTACTCTCCAACGAGTCCAAGCTATTCTCCAACGAGTCCTGCA
TACTCCCCAACCAGTCCATCTTACTCGCCAACGAGTCCGTCCTATTCACCTACTTCACCA
CAATACTCACCTACTTCACCAAGTTACTCTCCAACTTCACCACAGTACTCACCAACTAGT
CCTTCATACTCACCAACATCGCCACAGTATTCGCCAACGTCTCCGCAATACTCGCCAACG
TCTCCGCAATACTCACCAACATCGCCACAGTATTCACCAGGCTCTCCGGGATATGAGCCA
GAGCCTCCTAAGAAGGATGAAAATTAG |
|---|
Promoter Sequence
Download FASTA
|
>RPO21 CR_10680W_A
GAAATTAGAAAAATCATACGAAAAGTATACCAAGGCCAATAGCTACTTGAATGATTACTT
TCCCGAAGGTTTGTCTCCAGAAGACTTATCAACATTGCATGGCCTCAAATTATCGTGTTA
CTTGAACGCTGCGTTAGTGGCATTGAAATTGAAACACGGCAAAGATGCAATTGCTGCTGC
AAACAATGCATTAGAAGTAGAGCAAATCGACGACAAATCCAAAACCAAAGCATTATACAG
AAAAGGTATGGGCTATATCCTAGTCAAAGACGAAGAACAGGCTCAAAAGATTCTTGAAGA
AGCTCTCGAATTAGAACCTAACGATGCTGCTATCCAAAAAGGATTACAAGAAGCTAAACA
CAACATCAAGTTGCGTCGTGACAAACAAAAGAAGGCAATGGCCAAGTTCTTCTCATAAAT
CATATAGGCCTTCATAGATGATAATAAAAGCTTTTTTTTTTTTTTCAACAAAAAGTCGTG
CGACATACACAAACTGAAAATTTTCCAGCAAACTTTGCCATTGTCGAAACCAACATCAGA
AGAAGAAGAAAAAAAAACAACTTCTGAATCTATAAACAACATCTCCCCTTTTTCTTCTAT
CCCTATTGCAAATCAATCAACTTAACCTTATTTCAACTCCATATTCCCATTTGATATTTA
CATTAATCACTCAAAGGGTTTTATTGTTTAGGTTAGACTGGACTATTTATTATTAATAAA
GTAGTTATTCAAAAAGGGGACACATCCATTTTTTTTTTATTGTTTTAGTAATTACTTATT
ACATTCAAATTTGTTATAGAAGTTCATTTCATTTTGCATATTATTTGGTTTGTTGATTTA
TCTAAATTTTCGAAACAAACACAGTATCAGTTATTGTACTCATTGATTTGATTGCATTTG
TATTATTAGTTGGAAGCCATATTTATATTAAAAACCTAAAAAAAAATCTACCAAACTTTT
TTATAAAAAAAACTTTTTTTAAAAAAAATACCTATTTCCC
|
|---|
| Chr coordinates |
Ca22chrRA_C_albicans_SC5314:2260358-2265544W |
|---|
|
|
|
|
