PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CDR3
Promoter Sequence

Consensus
ATCANNCCA: -438 -437 -436 -435 -434 -433 -432 -431 -430 -429 -428 -427 -426 -425 -424 -423 -422 -421 -420 -419 -418 -417 -416 -415 -414 -413 -412 -411 -410 -409 -408 -407 -406 -405 -404 -403 -402 -401 -400 -399 -398 -397 -396 -395 -394 -393 -392 -391 -390 -389 -388 -387 -386 -385 -384 -383 -382 -381 -380 -379 -378 -377 -376 -375 -374 -373 -372 -371 -370 -369 -368 -367 -366 -365 -364 -363 -362 -361 -360 -359 -358 -357 -356 -355 -354 -353 -352 -351 -350 -349 -348 -347 -346 -345 -344 -343 -342 -341 -340 -339 -338 -337 -336 -335 -334 -333 -332 -331 -330 -329 -328 -327 -326 -325 -324 -323 -322 -321 -320 -319 -318 -317 -316 -315 -314 -313 -312 -311 -310 -309 -308 -307 -306 -305 -304 -303 -302 -301 -300 -299 -298 -297 -296 -295 -294 -293 -292 -291 -290 -289 -288 -287 -286 -285 -284 -283 -282 -281 -280 -279 -278 -277 -276 -275 -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266 -265 -264 -263 -262 -261 -260 -259 -258 -257 -256 -255 -254 -253 -252 -251 -250 -249 -248 -247 -246 -245 -244 -243 -242 -241 -240 -239 -238 -237 -236 -235 -234 -233 -232 -231 -230 -229 -228 -227 -226 -225 -224 -223 -222 -221 -220 -219 -218 -217 -216 -215 -214 -213 -212 -211 -210 -209 -208 -207 -206 -205 -204 -203 -202 -201 -200 -199 -198 -197 -196 -195 -194 -193 -192 -191 -190 -189 -188 -187 -186 -185 -184 -183 -182 -181 -180 -179 
>CDR3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CATATTCTTATTTGGTACAACCATATTTTTCGTTCAAACCAACAAATCAAGTATTCTGAA
AGGTGAAACTTTGGTGTTTAGAAGGAAAAATATTAGGAAAATGCGGAAAATGGAGGAGGA
TGAAGAAGCCTATATGGATGGTATGGCGCCATTAGATTTTAGTGGTAGTACGGAAATATC
TGATTATTCTTATGACTATATGGATCGCAAATTATTGGACACTTCGAATATTTTCCATTG
GAGAAACTTGACTTATACTGTTAAAATCAAGTCTGAAGAACGTGTTATTCTTAACAATAT
TGATGGTTGGGTCAAACCTGGTGAAGTCACTGCATTAATGGGTGCATCGGGTGCTGGTAA
AACCACCTTATTAAATGCCTTGTCGGAAAGATTGACCACTGGTGTGATTACTTCAGGAAC
CAGAATGGTGAATGGTGGTGAATTGGATAGTTCTTTCCAAAGATCTATTGGATATGTTCA
ACAACAAGATTTACATTTAGAGACATCTACTGTTCGTGAAGCTTTGAAATTTTCTGCTCG
TTTACGTCAGCCTAATTCTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCATCAGCC
ATCTGCTATCTTGTTAGAAGAATTTGATCGTTTATTGTTGTTGCAAAAGGGAGAAACTGT
TTATTTTGGTGAATTTGGGGCTAATTGTCATACATTGATTGAGTATTTTGAAAGAAATGG
TGCTAGTAAATGTCCACAACATGCCAATCCTGCTGAGTGG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATCANNCCA: -169 -170 -171 -172 -173 -174 -175 -176 -177 -178 -179 -180 -181 -182 -183 -184 -185 -186 -187 -188 -189 -190 -191 -192 -193 -194 -195 -196 -197 -198 -199 -200 -201 -202 -203 -204 -205 -206 -207 -208 -209 -210 -211 -212 -213 -214 -215 -216 -217 -218 -219 -220 -221 -222 -223 -224 -225 -226 -227 -228 -229 -230 -231 -232 -233 -234 -235 -236 -237 -238 -239 -240 -241 -242 -243 -244 -245 -246 -247 -248 -249 -250 -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -269 -270 -271 -272 -273 -274 -275 -276 -277 -278 -279 -280 -281 -282 -283 -284 -285 -286 -287 -288 -289 -290 -291 -292 -293 -294 -295 -296 -297 -298 -299 -300 -301 -302 -303 -304 -305 -306 -307 -308 -309 -310 -311 -312 -313 -314 -315 -316 -317 -318 -319 -320 -321 -322 -323 -324 -325 -326 -327 -328 -329 -330 -331 -332 -333 -334 -335 -336 -337 -338 -339 -340 -341 -342 -343 -344 -345 -346 -347 -348 -349 -350 -351 -352 -353 -354 -355 -356 -357 -358 -359 -360 -361 -362 -363 -364 -365 -366 -367 -368 -369 -370 -371 -372 -373 -374 -375 -376 -377 -378 -379 -380 -381 -382 -383 -384 -385 -386 -387 -388 -389 -390 -391 -392 -393 -394 -395 -396 -397 -398 -399 -400 -401 -402 -403 -404 -405 -406 -407 -408 -409 -410 -411 -412 -413 -414 -415 -416 -417 -418 -419 -420 -421 -422 -423 -424 -425 -426 -427 -428 -429 -431 -592 
>CDR3	Upstream Sequence Complementary Strand
GTATAAGAATAAACCATGTTGGTATAAAAAGCAAGTTTGGTTGTTTAGTTCATAAGACTT
TCCACTTTGAAACCACAAATCTTCCTTTTTATAATCCTTTTACGCCTTTTACCTCCTCCT
ACTTCTTCGGATATACCTACCATACCGCGGTAATCTAAAATCACCATCATGCCTTTATAG
ACTAATAAGAATACTGATATACCTAGCGTTTAATAACCTGTGAAGCTTATAAAAGGTAAC
CTCTTTGAACTGAATATGACAATTTTAGTTCAGACTTCTTGCACAATAAGAATTGTTATA
ACTACCAACCCAGTTTGGACCACTTCAGTGACGTAATTACCCACGTAGCCCACGACCATT
TTGGTGGAATAATTTACGGAACAGCCTTTCTAACTGGTGACCACACTAATGAAGTCCTTG
GTCTTACCACTTACCACCACTTAACCTATCAAGAAAGGTTTCTAGATAACCTATACAAGT
TGTTGTTCTAAATGTAAATCTCTGTAGATGACAAGCACTTCGAAACTTTAAAAGACGAGC
AAATGCAGTCGGATTAAGACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
span>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGTAGTCGG
TAGACGATAGAACAATCTTCTTAAACTAGCAAATAACAACAACGTTTTCCCTCTTTGACA
AATAAAACCACTTAAACCCCGATTAACAGTATGTAACTAACTCATAAAACTTTCTTTACC
ACGATCATTTACAGGTGTTGTACGGTTAGGACGACTCACC
w3c xhtml validator w3c css validator