C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

PEP1

Promoter Sequence

Consensus
CACCACCACAACC: -458 -457 -456 -455 -454

>PEP1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATCTTATAGAAATTATTCAACTTTGATAAGGCTTACTATATTTGAAAGAATTGTTGGTG
TTCCTTATTAAATTTGCCATATCTGTCGACCCTGTTGGAATTACTACGCCATAGATAAAT
TGATAAATTGATACATATTTATTCACTTGAACAAACTGATTAGATCAAATCATATTGAAT
ATTAGGTTCCCCTTGTCAATTGGTATTCTTTTTTTCACTCCCGATAACACTAATTAGACA
AACTCAAACACTTCAAAATGAGGAATAATAATTGGAATTGGCTAATATTCTTGGTGCCAT
TTATTTTATCCTTAACAACTGCTTATACTCCAGATATATCAGTTGTTAAAAACAAATCAC
CAGCAAGAGAAATTAAATATTTTGATGATTCTTCCAATTTATTAGTTTTAAGAGATGAAC
ATCTTTTAATCTCGAAAAATGATGGTAAATCATTTGAAGAAATTCCTGATATTAAAGATC
CAATTATTTATTTTGAAATGGATCCAACTAACAAGAATCGTGCCTTTGCCATGACACTTT
CTCNNNNNNNNNNNNpan>Npan>Npan>NNACAGAAGATCAGGGTAATAAATGGCGGACATTTGAAATTGA
TATTTTCAATGGTGAAATGGCATCAATTCCTAAAATTACTTTTAATTTTGAAAATCCAAA
TTATTTGATGATTTCAAATTATGAATGTCCTGAAGGTCAAAGATTAAATCGTAATTGTAA
ACATAGATATTTTTTCACGAAAGATGGGTTTAAATCAAAACCAAATAAATTACCTGTCGA
TGCTCATGTTTGTCGATTTGCTAAATCAACTAAAACCTCCAAAATTGGTAAAAGTGAAAC
GATTTTTTGTACTGTTAATCAATTGAATTCTTATGGTCATATTGTTGAATCTCATTTATA
TAATTCAAATGATTTTTTCCAAAATAAAAATGAAATTAAAATTAAACCTTTGGATTCTTC
AAGTGGTGAAATCATTGATGTTAAAATAGAAGAAGATTTT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CACCACCACAACC: -441 -442 -443 -444

>PEP1	Upstream Sequence Complementary Strand
TTAGAATATCTTTAATAAGTTGAAACTATTCCGAATGATATAAACTTTCTTAACAACCAC
AAGGAATAATTTAAACGGTATAGACAGCTGGGACAACCTTAATGATGCGGTATCTATTTA
ACTATTTAACTATGTATAAATAAGTGAACTTGTTTGACTAATCTAGTTTAGTATAACTTA
TAATCCAAGGGGAACAGTTAACCATAAGAAAAAAAGTGAGGGCTATTGTGATTAATCTGT
TTGAGTTTGTGAAGTTTTACTCCTTATTATTAACCTTAACCGATTATAAGAACCACGGTA
AATAAAATAGGAATTGTTGACGAATATGAGGTCTATATAGTCAACAATTTTTGTTTAGTG
GTCGTTCTCTTTAATTTATAAAACTACTAAGAAGGTTAAATAATCAAAATTCTCTACTTG
TAGAAAATTAGAGCTTTTTACTACCATTTAGTAAACTTCTTTAAGGACTATAATTTCTAG
GTTAATAAATAAAACTTTACCTAGGTTGATTGTTCTTAGCACGGAAACGGTACTGTGAAA
GAGNNNNNNNNNNNNNpan>Npan>NNTGTCTTCTAGTCCCATTATTTACCGCCTGTAAACTTTAACT
ATAAAAGTTACCACTTTACCGTAGTTAAGGATTTTAATGAAAATTAAAACTTTTAGGTTT
AATAAACTACTAAAGTTTAATACTTACAGGACTTCCAGTTTCTAATTTAGCATTAACATT
TGTATCTATAAAAAAGTGCTTTCTACCCAAATTTAGTTTTGGTTTATTTAATGGACAGCT
ACGAGTACAAACAGCTAAACGATTTAGTTGATTTTGGAGGTTTTAACCATTTTCACTTTG
CTAAAAAACATGACAATTAGTTAACTTAAGAATACCAGTATAACAACTTAGAGTAAATAT
ATTAAGTTTACTAAAAAAGGTTTTATTTTTACTTTAATTTTAATTTGGAAACCTAAGAAG
TTCACCACTTTAGTAACTACAATTTTATCTTCTTCTAAAA