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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name ARC35
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -681 -410
>ARC35    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATTATTGGGGTGCCCTGAGTGATTTATGGTCATTTGCCTGTTTAATATTTGAATTATT
AACTGGTGATTATCTATTTGATCCTAGAGATGGTAAATCATATAAAAAAGATGATGATCA
TATTGCCCAAATTATTGAATTGATTGGACCATTTCCTAATCAAATGTTAAAAGAAAGTTA
TTATGCTCGAGAATTTTTCAATTCAAGGTATGAATTAAGAAGAATCATGAAATTAAAACC
TTGGGGGTTACAAGATGTATTAATTGAAAAATATAAATTCCCTTTGAATGATGCTATTGA
AATTAGTGAATTTTTATTGCCAATGTTGAAATTAAAACCAGAAGAAAGAGCTGATGCTGG
AGGAATGTTGAATCATCCTTGGTTAAGAGATGCTTTAGGTTTAGAAAATGTGGTTTTGGA
ACGACCAGTTGGTGGTTCAGGTGAAGATATTCCTGGTTGGTCAAGAGAAATTTCTACTAC
TACCCAACAATCAATGTCTTCTAACAATCATAATCATAATAATACTCATAATAATAACTA
TAATCATCAATCAGATCAGGAATTACAACTGCAACAATCACGCAAATATTCCAATGCAAG
TAGTTTTGGTCATAAAAGCCAACCTTTCTATCATTAGAGTCAAAAAAAAAATTACAGTTT
ACGATTAACAAATTTGTTAGTCACATTCGTTTCTTCAATTTTCTTTCTTTTCTTTTGCAT
TAAATAATTTACAAAACTTATTTGTATATGTATTTGTATAAAACATATAATTTATAATTG
ATTAAATAATGGGATAACACTGTAATAGTAGAAAGGGAAATTAGGGTTGGTATAGGTTGA
AATAGGGTCGTGTGCGAGAGGTAGAAGTAGAGGAAAATCCAACTGGGCGCGGACGTTACT
CCTTTTTGATTATTCCAACGAATTTTGAAAACTCATAATTTCTCCATTCACCATTAACTT
CTAGCAACTCATATCAATTGATCTTTTATCCCCTACTACC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -853 -990
>ARC35	Upstream Sequence Complementary Strand
AATAATAACCCCACGGGACTCACTAAATACCAGTAAACGGACAAATTATAAACTTAATAA
TTGACCACTAATAGATAAACTAGGATCTCTACCATTTAGTATATTTTTTCTACTACTAGT
ATAACGGGTTTAATAACTTAACTAACCTGGTAAAGGATTAGTTTACAATTTTCTTTCAAT
AATACGAGCTCTTAAAAAGTTAAGTTCCATACTTAATTCTTCTTAGTACTTTAATTTTGG
AACCCCCAATGTTCTACATAATTAACTTTTTATATTTAAGGGAAACTTACTACGATAACT
TTAATCACTTAAAAATAACGGTTACAACTTTAATTTTGGTCTTCTTTCTCGACTACGACC
TCCTTACAACTTAGTAGGAACCAATTCTCTACGAAATCCAAATCTTTTACACCAAAACCT
TGCTGGTCAACCACCAAGTCCACTTCTATAAGGACCAACCAGTTCTCTTTAAAGATGATG
ATGGGTTGTTAGTTACAGAAGATTGTTAGTATTAGTATTATTATGAGTATTATTATTGAT
ATTAGTAGTTAGTCTAGTCCTTAATGTTGACGTTGTTAGTGCGTTTATAAGGTTACGTTC
ATCAAAACCAGTATTTTCGGTTGGAAAGATAGTAATCTCAGTTTTTTTTTTAATGTCAAA
TGCTAATTGTTTAAACAATCAGTGTAAGCAAAGAAGTTAAAAGAAAGAAAAGAAAACGTA
ATTTATTAAATGTTTTGAATAAACATATACATAAACATATTTTGTATATTAAATATTAAC
TAATTTATTACCCTATTGTGACATTATCATCTTTCCCTTTAATCCCAACCATATCCAACT
TTATCCCAGCACACGCTCTCCATCTTCATCTCCTTTTAGGTTGACCCGCGCCTGCAATGA
GGAAAAACTAATAAGGTTGCTTAAAACTTTTGAGTATTAAAGAGGTAAGTGGTAATTGAA
GATCGTTGAGTATAGTTAACTAGAAAATAGGGGATGATGG
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