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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C5_05040W_B
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -979 -782 -521
>C5_05040W_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TGTTTACTTAATGTTCCAGTCCCAATACCCATGGTGACTTTCCCTTGAGTTCTCAAACGC
CACAAGTCATCTATGTTGCTTGGTAATTGTTCATTACTCAATTTTATAATTTGTGGCAAC
CAACCAGACAAAACATAAGCATCATTTGCCATATTTGAGCCTGAGAAATTGTAACCATTC
CCCATTATCGTCAAATATGCTTTCTCTATTAGTGCTGGCCAATAAAGTTCTGTATCGCTA
TATGATTTTATGATCAAATTACGCAGATTCGGCATTATTGGGAATTTGCTATCAACAATT
ACGTTTCTTAGTGCCCCATTAAATCGTAGTGAAACTTTATACTTTTGGGATGATTTTTGT
GGTGTGATTGTGTCAATTATTGGAATATTGGCATCGATTATGGCAAGGAAAGATGAGACA
AACGAACAGTTGGGCAAAATATCCTGATACAAGTTTTTCAAGTGAGTGATATCATTGTTC
CAAT
TCAGAATTTCAATATATTCGAATTTGGCTAATTTATTCGGTAGTTTTTCGAATATT
TTATTATCATTATCTTGGATTGGGGATGTGGTATCGACAAACAATTCATTGTGGGAAGTG
AAATTCTCGTTAAACTGTATAACAGGTGGAAAGAAAGTTTCCTGTGTTAATTTTGAAGAA
ATCCATTCAAGTTTATCGGAAATTGTTCTTGGTTTATCTAATGACTCGTAATGGTTTAAT
GTGTATTGTGAAAGAACTTTGATCTCGGGTAATGGAGTTGTTTTGGCTATTGAGTTTAAT
ATCTTTATCGATTCGAGGCATTCCTTTTTGGCTTGTTTAGTGTTATCGATAGACAAGTAC
AAATGACTTTTCTCAAGATGGTGTAGAAACTGCTCTAGACATGGTGTGGGCATGTTAACT
TAATGTGGAGCCACTAAGTTTATTGAAACGACCACGCTAAGGTTTTTTTTTTTTTCTCAA
CTAATTTACATTTTCCCGTTGGATTCTATTTGCATTGCCA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -437 -609 -617 -719
>C5_05040W_B	Upstream Sequence Complementary Strand
ACAAATGAATTACAAGGTCAGGGTTATGGGTACCACTGAAAGGGAACTCAAGAGTTTGCG
GTGTTCAGTAGATACAACGAACCATTAACAAGTAATGAGTTAAAATATTAAACACCGTTG
GTTGGTCTGTTTTGTATTCGTAGTAAACGGTATAAACTCGGACTCTTTAACATTGGTAAG
GGGTAATAGCAGTTTATACGAAAGAGATAATCACGACCGGTTATTTCAAGACATAGCGAT
ATACTAAAATACTAGTTTAATGCGTCTAAGCCGTAATAACCCTTAAACGATAGTTGTTAA
TGCAAAGAATCACGGGGTAATTTAGCATCACTTTGAAATATGAAAACCCTACTAAAAACA
CCACACTAACACAGTTAATAACCTTATAACCGTAGCTAATACCGTTCCTTTCTACTCTGT
TTGCTTGTCAACCCGTTTTATAGGACTATGTTCAAAAAGTTCACTCACTATAGTAACAAG
GTTAAGTCTTAAAGTTATATAAGCTTAAACCGATTAAATAAGCCATCAAAAAGCTTATAA
AATAATAGTAATAGAACCTAACCCCTACACCATAGCTGTTTGTTAAGTAACACCCTTCAC
TTTAAGAGCAATTTGACATATTGTCCACCTTTCTTTCAAAGGACACAATTAAAACTTCTT
TAGGTAAGTTCAAATAGCCTTTAACAAGAACCAAATAGATTACTGAGCATTACCAAATTA
CACATAACACTTTCTTGAAACTAGAGCCCATTACCTCAACAAAACCGATAACTCAAATTA
TAGAAATAGCTAAGCTCCGTAAGGAAAAACCGAACAAATCACAATAGCTATCTGTTCATG
TTTACTGAAAAGAGTTCTACCACATCTTTGACGAGATCTGTACCACACCCGTACAATTGA
ATTACACCTCGGTGATTCAAATAACTTTGCTGGTGCGATTCCAAAAAAAAAAAAAGAGTT
GATTAAATGTAAAAGGGCAACCTAAGATAAACGTAACGGT
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