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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CTA9
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -701
>CTA9    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAACTGTTTGATTGTGCTTTCCTCCTTTGAGTTGTAACAAAGAATAAATTTAACTTGAC
TTTGTAGAACATATGCATTTATAGATAAGCCATAGAATTGATCTATTTTGCCCAAGTTCA
ATACATTAGTGGTGAATGCTTGGTCATCAATAAGATCTAAAGATGAGTTGGCAATAAACG
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AAATGTTGGCACTTTTAAACGAAGAAAATTCTAATTCATACAAAGGATTATCTTTAGTTC
CAAT
AATGGAGAAATAATAAGATGAAGACATTTATTTGAATTTTTAATAGAACGAAACAG
AAATAGGAGGTTTTCAAAGGTTTCTATAGTTTCTCTGCTTCTTTTGTTAAGTAAAACGGC
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TAAAAAGGAAACAAAAGGGCAAAAACAAAAAAAAAAAGAATCAGGAGTCAGGAGGCATAT
AACATCTACATATCGTATCATATTAAATTAAATTAAAATATAAGCTCATTAGGCTTGGTT
TATTTATACTTTAAGACTAAATCTGATTGGTAACCTTGAAATTTTCCTTGAATCCCTTTG
AGAAAGTTAAAAAAAAAAGAATTAGATAAAATTTACTCATTTTCAAAGAACAAAACAATA
CTTAGTTTTTAGCCATACATACAAATAAATCACAGGGACA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -130 -405 -487 -797
>CTA9	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTTGACAAACTAACACGAAAGGAGGAAACTCAACATTGTTTCTTATTTAAATTGAACTG
AAACATCTTGTATACGTAAATATCTATTCGGTATCTTAACTAGATAAAACGGGTTCAAGT
TATGTAATCACCACTTACGAACCAGTAGTTATTCTAGATTTCTACTCAACCGTTATTTGC
CCTCATTAAGAAAGCAACTAACCCCCTTAACGCTAAAAGGACCGTGTAATAGTCAACACC
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GTTATTACCTCTTTATTATTCTACTTCTGTAAATAAACTTAAAAATTATCTTGCTTTGTC
TTTATCCTCCAAAAGTTTCCAAAGATATCAAAGAGACGAAGAAAACAATTCATTTTGCCG
CTCCTTTGAACATGTTGTTGTCAATGTCTAGTCCGTTTCTTTTTTTTTTAAGTTGGGTGT
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TCTGTTGAGTGTGTAAATTCAGCGTACCATACTTACGTATTTTCATTCATTACCTTGACC
GAGGGAGCGAGCGAGCGAGTGAGCAAGATAACAGTCTATTTGTTCTCTTTCCTTTTTTTT
ATTTTTCCTTTGTTTTCCCGTTTTTGTTTTTTTTTTTCTTAGTCCTCAGTCCTCCGTATA
TTGTAGATGTATAGCATAGTATAATTTAATTTAATTTTATATTCGAGTAATCCGAACCAA
ATAAATATGAAATTCTGATTTAGACTAACCATTGGAACTTTAAAAGGAACTTAGGGAAAC
TCTTTCAATTTTTTTTTTCTTAATCTATTTTAAATGAGTAAAAGTTTCTTGTTTTGTTAT
GAATCAAAAATCGGTATGTATGTTTATTTAGTGTCCCTGT
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