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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name PRP42
Promoter Sequence

Consensus
CCAAT: -313 -286
>PRP42    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAAGTAAATTCTAGAAGGGGAGAACAGGTGAGAAAAAAAAAATTTTTCCTTTAACTTTGA
TGTGTTGCAACTATGTGCGGTGAGACAACTAACAATAGTAAGTCCATGTTGGATATTGAT
GTAGGGAGGATTGGATTCAAAAGTTGTAAAGACGAAAGTGTGTAGCGATAAGATTAGATT
ATAGTTGTCACTACAATAAAAACTCAAAAGCAATCATAATTTTTTTATATACTCACGAGA
TATGTTTAATGAAGTTGAGTATTTAAAATGTTGTTGTAGATTTTTAGGTCTATTTTGCTG
CCAAATTAATCATAATTTATTGTAATTGTAATTGTTGTTTGGAATCAACTCTGTTAACAA
TTAATGAGACAAGCAAACACAGAATAAAAAGATAACAAGTAAAAATAACAACCATGCTAG
AGCTGATGGGGAAATTGCTTATAAGTTGTAACTTGCAATTTATTGTTAAGAGGAGCAGAC
ACAAACACCATCTCAGTTTGTAGCTTCGTATGTTTTGATGTTGGCTCCGTTCGTATACTT
GGTTATTAAGTGAGTCTAGTTTACGTGTCCACATCTACATTTGATTTGTATCATTATATC
AGGTAGAAAATGGGACTTGAATATCAATATCAGAGACTGATTTGGGTGCTGAATGGGAAC
AAATAACTATTGAAGGTGTTACATTGACCAATGTACATATAATAATTAAAAGATCCAATT
GGCAATTGATCAGCAATGCCTATTCCTAAAAATATCAAGTATAACTAAAATAATCAATTG
TTATAACTGCTTCTTGTTGGACAGAAAATACCACTTTGGTTTGACAATTGGTACATCTAA
TTTTGCCAGCAAAATCATCAACAGTGAAATTTATAGGATTGGTTTTTTTCTCTGTTCTCA
CAAACTCTACGAAATTTTTCCACCTCTTTAAACCCATCTTAACTGTTCTCATTCACAAGT
CCACTGAAAGCGCCATACACCCAGACACACAGCTATTGTC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCAAT: -118 -169 -278 -866
>PRP42	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTCATTTAAGATCTTCCCCTCTTGTCCACTCTTTTTTTTTTAAAAAGGAAATTGAAACT
ACACAACGTTGATACACGCCACTCTGTTGATTGTTATCATTCAGGTACAACCTATAACTA
CATCCCTCCTAACCTAAGTTTTCAACATTTCTGCTTTCACACATCGCTATTCTAATCTAA
TATCAACAGTGATGTTATTTTTGAGTTTTCGTTAGTATTAAAAAAATATATGAGTGCTCT
ATACAAATTACTTCAACTCATAAATTTTACAACAACATCTAAAAATCCAGATAAAACGAC
GGTTTAATTAGTATTAAATAACATTAACATTAACAACAAACCTTAGTTGAGACAATTGTT
AATTACTCTGTTCGTTTGTGTCTTATTTTTCTATTGTTCATTTTTATTGTTGGTACGATC
TCGACTACCCCTTTAACGAATATTCAACATTGAACGTTAAATAACAATTCTCCTCGTCTG
TGTTTGTGGTAGAGTCAAACATCGAAGCATACAAAACTACAACCGAGGCAAGCATATGAA
CCAATAATTCACTCAGATCAAATGCACAGGTGTAGATGTAAACTAAACATAGTAATATAG
TCCATCTTTTACCCTGAACTTATAGTTATAGTCTCTGACTAAACCCACGACTTACCCTTG
TTTATTGATAACTTCCACAATGTAACTGGTTACATGTATATTATTAATTTTCTAGGTTAA
CC
GTTAACTAGTCGTTACGGATAAGGATTTTTATAGTTCATATTGATTTTATTAGTTAAC
AATATTGACGAAGAACAACCTGTCTTTTATGGTGAAACCAAACTGTTAACCATGTAGATT
AAAACGGTCGTTTTAGTAGTTGTCACTTTAAATATCCTAACCAAAAAAAGAGACAAGAGT
GTTTGAGATGCTTTAAAAAGGTGGAGAAATTTGGGTAGAATTGACAAGAGTAAGTGTTCA
GGTGACTTTCGCGGTATGTGGGTCTGTGTGTCGATAACAG
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