C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

CR_04740C_B

Promoter Sequence

Consensus
CCATT: -911 -462 -461 -460 -459 -458 -457 -183

>CR_04740C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CAGCATTATATTGTCTTTGAATTTGTATCTGTTGTTGATTTTGTCTCAACTCTTGATTCT
CTTTTGAAGATTGTTGTAAGATTATTTTCCCATTTTCAGGAAAATTCGATAATATATCAA
TCACTGATTTCATTTCTTTTTTTGTCTCCTATTTCTATTTGATCTCTTTATTTCTTAATA
ACTTATTGACTTATTTTTTGTTGGCTTGTTGTTTATTTTCTTTTTCAACTTGTCTTCTTG
AACCTTTAATTAATTCTAAATGACCAACTCTACTAGCAATTAATTTCTCAGTACTTTTCA
TTAATTGACCCAGATGAATTTTTGTAAGTTTTAATGATTCTTTAGCAATGGTTTTTTTAG
GTTTAATGATTTTTGGGGCAGCTTTTTTAGGATTTTGTTGCTTTTTAGTTATTCTATTTG
ATTGTTTAGATTTTAATTTCAAATTACCTTGAGCCATGATTGTAAGAGATGAGGTATAGG
ATGGTGGTAGGTTTAAATTCACAGCTAAAGATTAGTAAAGAGTATGAGTGTATGTATANN
NNNNpan>Npan>Npan>Npan>TGGCTTGCTTATGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTGGATTTTAGATTTAATTTGAT
GAGATGATGTAGAGCACGTGACCAATAAAAAATTTTAGTTTGTAAGACGGAGAGAGAGAT
GAGATTGAAAAATGAGAAAGAAGTCAAAAAAAAAAAAAAGAACAAGGAGTAGTAGTAGAG
AAGTTAGATTAATGTTACAATATTATTATTATTAACTATTAACTATTAACTATTAGCTAT
TGTAATGCGGGAAGAAGTTATCGCAATATATAAACAACCATTATTTTTCCTCTTCTTTAT
TAACCTYCCAAAAAAAAACTTTCACCTAAATTAGCTTCCTCCTTTCTTCTTCTTTCCCTC
TTTCTTTCTTGTAGATCTTCTCTAACAACAACAACAACAACAATAACGACAATTTTCTTG
TCTTTTAATTTTACTTTTACTTTTACTTTTTTTTTTGTCA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCATT: -450 -453 -454 -455 -456 -457 -458 -649

>CR_04740C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
GTCGTAATATAACAGAAACTTAAACATAGACAACAACTAAAACAGAGTTGAGAACTAAGA
GAAAACTTCTAACAACATTCTAATAAAAGGGTAAAAGTCCTTTTAAGCTATTATATAGTT
AGTGACTAAAGTAAAGAAAAAAACAGAGGATAAAGATAAACTAGAGAAATAAAGAATTAT
TGAATAACTGAATAAAAAACAACCGAACAACAAATAAAAGAAAAAGTTGAACAGAAGAAC
TTGGAAATTAATTAAGATTTACTGGTTGAGATGATCGTTAATTAAAGAGTCATGAAAAGT
AATTAACTGGGTCTACTTAAAAACATTCAAAATTACTAAGAAATCGTTACCAAAAAAATC
CAAATTACTAAAAACCCCGTCGAAAAAATCCTAAAACAACGAAAAATCAATAAGATAAAC
TAACAAATCTAAAATTAAAGTTTAATGGAACTCGGTACTAACATTCTCTACTCCATATCC
TACCACCATCCAAATTTAAGTGTCGATTTCTAATCATTTCTCATACTCACATACATATNN
NN>NNpan>Npan>Npan>Nn>ACCGAACGAATACATCATCATCATCATCATCACCTAAAATCTAAATTAAACTA
CTCTACTACATCTCGTGCACTGGTTATTTTTTAAAATCAAACATTCTGCCTCTCTCTCTA
CTCTAACTTTTTACTCTTTCTTCAGTTTTTTTTTTTTTTCTTGTTCCTCATCATCATCTC
TTCAATCTAATTACAATGTTATAATAATAATAATTGATAATTGATAATTGATAATCGATA
ACATTACGCCCTTCTTCAATAGCGTTATATATTTGTTGGTAATAAAAAGGAGAAGAAATA
ATTGGARGGTTTTTTTTTGAAAGTGGATTTAATCGAAGGAGGAAAGAAGAAGAAAGGGAG
AAAGAAAGAACATCTAGAAGAGATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGCTGTTAAAAGAAC
AGAAAATTAAAATGAAAATGAAAATGAAAAAAAAAACAGT