C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

PRP39

Promoter Sequence

Consensus
CCATT: -649 -182

>PRP39    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AATTGTTCAATTAAATTTGATTTCAAATTAGTGGGAAATTGATTAATAATGATTGTTGTT
AATTGATTTTGAAAATTTTCTGGCTTTAATTTATCTATAGATACATATAATTTAATATCT
TCAACAATATCATCAATTCCTCCAACAATGTTCTCCCCGCTAGTGTCATAATCTTTTGAC
AGGGGATTGTTTTGGTGGTCATCACTGGAATCTTTAGCTTTATTAATTCGAGTTTCATTT
GTTTGAGTTTGGATTTTAGTATTATTCAAATCAATTAGATTTGAAACATCGATGGATTTG
AAAATTGGGATTTGATAATTTAATTGTGGTTTGATAATTGATGTGGTTGATCCATTAGGA
TCAAGTATAGATATAAGATCTGAGTTTATTGTTTGAGAAAGACTATAAGGATTGACATAT
TCTATACTGTTATCACCAGCAGTCATAGTTAAAGAAGGTAGGGTGAGTTGTGGTTATGGT
TAGAAGGATAATAAATTTTCAAAGGTTTATTCAATGTTAGATGACAATTAAAGTTCTTTT
CAATTTTCATACAAAAAGAAATTGAAAAAAAAAAAAAAATTATGCAATCTAAAATTCATC
CCAAAGAAATATCAACCAACTTTCCAGATAATAAACTACACTTTATATTAACATTATATG
TCAGTTACAAATTTACCAAAAGATTTGGAGTCACAGACCATCACACAGATTAGTAAATTG
TCAACCGTTTCAAAATTACMAMCATGTAGTAAATTCTCATCCTAATAACCTACAAAAATG
GAATCAATTGTTTACTGAATTAAATAAATTAATCGACACCATTGCAACCACTAACAATTC
TAATGATATAAATAGTGATGACAATGATTTAAAGCAAGATATACACAATAGTTACAAAGC
ATTATTGTCTCGATTTCCTTATTTAACAGAATATTGGAAGAAATGGCAACTGGTTGAATT
GAAAATAAATGGTGAAACAGCTTCACAAGATATTTTACGA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CCATT: -28 -54 -219

>PRP39	Upstream Sequence Complementary Strand
TTAACAAGTTAATTTAAACTAAAGTTTAATCACCCTTTAACTAATTATTACTAACAACAA
TTAACTAAAACTTTTAAAAGACCGAAATTAAATAGATATCTATGTATATTAAATTATAGA
AGTTGTTATAGTAGTTAAGGAGGTTGTTACAAGAGGGGCGATCACAGTATTAGAAAACTG
TCCCCTAACAAAACCACCAGTAGTGACCTTAGAAATCGAAATAATTAAGCTCAAAGTAAA
CAAACTCAAACCTAAAATCATAATAAGTTTAGTTAATCTAAACTTTGTAGCTACCTAAAC
TTTTAACCCTAAACTATTAAATTAACACCAAACTATTAACTACACCAACTAGGTAATCCT
AGTTCATATCTATATTCTAGACTCAAATAACAAACTCTTTCTGATATTCCTAACTGTATA
AGATATGACAATAGTGGTCGTCAGTATCAATTTCTTCCATCCCACTCAACACCAATACCA
ATCTTCCTATTATTTAAAAGTTTCCAAATAAGTTACAATCTACTGTTAATTTCAAGAAAA
GTTAAAAGTATGTTTTTCTTTAACTTTTTTTTTTTTTTTAATACGTTAGATTTTAAGTAG
GGTTTCTTTATAGTTGGTTGAAAGGTCTATTATTTGATGTGAAATATAATTGTAATATAC
AGTCAATGTTTAAATGGTTTTCTAAACCTCAGTGTCTGGTAGTGTGTCTAATCATTTAAC
AGTTGGCAAAGTTTTAATGKTKGTACATCATTTAAGAGTAGGATTATTGGATGTTTTTAC
CTTAGTTAACAAATGACTTAATTTATTTAATTAGCTGTGGTAACGTTGGTGATTGTTAAG
ATTACTATATTTATCACTACTGTTACTAAATTTCGTTCTATATGTGTTATCAATGTTTCG
TAATAACAGAGCTAAAGGAATAAATTGTCTTATAACCTTCTTTACCGTTGACCAACTTAA
CTTTTATTTACCACTTTGTCGAAGTGTTCTATAAAATGCT