C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

C1_12820C_B

Promoter Sequence

Consensus
CGGANNA: -383 -382 -381 -380 -379 -378 -377 -376 -375 -374 -373 -372 -371 -370 -369

>C1_12820C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CTTCTTCTTCTTTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTTGCCATACCAATTGATTCAAGATTTAC
GATTAATGGTACCTAAATGGATTGGTCAACCAATATTATTTAATAAACATCCAATAAAGG
AATCCCCCAAAATAACATTTCAATTAACCGAAGTTGATTATAATCAATTACCGTCATATT
TAAAAATTGGTGGGAAATCAAATAAAAAAATTAAAAAATTACCTGAATTAGAATCATCAA
TTAAATTAACATCTCATAATATGTTAAGAGTACTGAAAATTTTAAATTATTTGGTGGAAA
AATTTGCTAATACTACTAAAGAAATGAAAGATAAAAATTTAATTCCCAGTGATTGGTTAG
TATTACAATGTAAAGGTCAAGAATTAAATAATGATTTAACTTTACAAACTATAAAAACCA
AGATTTGGAAAAGTAGTAGTGATATTGAATTACAATTTAGACGTAAATATGATAAATAAA
ATAAATAAATCCCCAAGAAGTTATTAGTTGTTTGATATATATATATATATATATATATAT
ATATATAGAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACCAAAACTGTAATAGCATGCAGAAT
AAGTTGTTATTAAATTANNNNNNN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>NGTGTAGAATCAAGTGTAATTTT
TGCGACATTTTGCGACATGATATGAAAGTTAGACATTTTGGTTCTTCCTTTTTTTTCCAT
CACATCGAAAAGAAAAAAAAATGAGAAAAAAAAAAATCAAAATTGAACTTCTAAACCAAC
ATCATCGACATTATCATCGACACATAACTTAACTTAACTTAACTAATCAACAATCATCAA
TATTCTTAAAGAATCATCACTGATCAACTTACAACATAAACAGGATTTTTTTATTTTTTT
TTTCCACTATATTTGATAAGTTCACATCTTATTTTTTTTTTTTGTTTGCATTCATCACAT
CTGTTTAATATAAGTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTCAAAA

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CGGANNA: -361 -362 -363 -364 -365 -366 -367 -368 -369 -370 -371 -372 -373 -374 -375 -376 -378 -379

>C1_12820C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
GAAGAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAACGGTATGGTTAACTAAGTTCTAAATG
CTAATTACCATGGATTTACCTAACCAGTTGGTTATAATAAATTATTTGTAGGTTATTTCC
TTAGGGGGTTTTATTGTAAAGTTAATTGGCTTCAACTAATATTAGTTAATGGCAGTATAA
ATTTTTAACCACCCTTTAGTTTATTTTTTTAATTTTTTAATGGACTTAATCTTAGTAGTT
AATTTAATTGTAGAGTATTATACAATTCTCATGACTTTTAAAATTTAATAAACCACCTTT
TTAAACGATTATGATGATTTCTTTACTTTCTATTTTTAAATTAAGGGTCACTAACCAATC
ATAATGTTACATTTCCAGTTCTTAATTTATTACTAAATTGAAATGTTTGATATTTTTGGT
TCTAAACCTTTTCATCATCACTATAACTTAATGTTAAATCTGCATTTATACTATTTATTT
TATTTATTTAGGGGTTCTTCAATAATCAACAAACTATATATATATATATATATATATATA
TATATATCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGGTTTTGACATTATCGTACGTCTTA
TTCAACAATAATTTAATNNNN</span>Nspan>NN</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>N</span>CACATCTTAGTTCACATTAAAA
ACGCTGTAAAACGCTGTACTATACTTTCAATCTGTAAAACCAAGAAGGAAAAAAAAGGTA
GTGTAGCTTTTCTTTTTTTTTACTCTTTTTTTTTTTAGTTTTAACTTGAAGATTTGGTTG
TAGTAGCTGTAATAGTAGCTGTGTATTGAATTGAATTGAATTGATTAGTTGTTAGTAGTT
ATAAGAATTTCTTAGTAGTGACTAGTTGAATGTTGTATTTGTCCTAAAAAAATAAAAAAA
AAAGGTGATATAAACTATTCAAGTGTAGAATAAAAAAAAAAAACAAACGTAAGTAGTGTA
GACAAATTATATTCAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTT