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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name ITR1
Promoter Sequence

No match found!
>ITR1    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AGAATTTGTTTTTTTTATATTTTGTTTTCTTTTTTTCTAAAGTTAATTATATAAATGAAA
ACCTTGATAAACAGAAAAAAAAAATTCTTAAAAAAAAGTAATATACGAATATTAAAGTAT
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TTCTCGCCGAAAGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCGTCGAATTTCTATACAATTCGA
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AAAAGTAGTATGTACCCCTCCCACCAAATGACCCTCTTACACCCATTCTCTCTCAACAAA
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TTTTCTTTTCTTTTATTTTATTTTAACTGACATTATTATCTTTTCTTTTCTTGCTTATTT
ATTTTTATCAACGGTTTTCTAGATACCTAACTTTAAATATATTCAGTCATTATTGCTACT
ATCGTCATAGTTTCAGTTTTTTAAGTTTCATTATTATTAATTTTGTTTTTTTTTTGTTTT
TTAAAAGTGTATTGATTTGAGGGAATTTTTTAAAAAAAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CGGANNA: -564
>ITR1	Upstream Sequence Complementary Strand
TCTTAAACAAAAAAAATATAAAACAAAAGAAAAAAAGATTTCAATTAATATATTTACTTT
TGGAACTATTTGTCTTTTTTTTTTAAGAATTTTTTTTCATTATATGCTTATAATTTCATA
AATTTTGATATTTAACATTCGTTATTAACTAAGAAAATCTCACCACAACCACCAAAAATG
TGATTGTAAACATGTCTTAAAATAAAATCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCA
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AAGAGCGGCTTTCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGCAGCTTAAAGATATGTTAAGCT
AGGAAACAGAGGAGGCCCCACAGAAACTAACTAAAATATTAAGTTCTTTCATTACGGGCC
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ATCTTAAATTATATTATATCGTTCATTGTGGTAAATATTTCTTTGGGGGTGAACTCAGAT
TTTTCATCATACATGGGGAGGGTGGTTTACTGGGAGAATGTGGGTAAGAGAGAGTTGTTT
AACAGCTAATAAATTTATACGTTAAAAAGAGGAAAAAAAGGGAAAGGGAAAGGGAAAGTA
GAAGCGGCTTTTTTTAATAAGAATTTAAAAAAAAATGAAAATAACTAGTGAAAACAACAC
AAAAGAAAAGAAAATAAAATAAAATTGACTGTAATAATAGAAAAGAAAAGAACGAATAAA
TAAAAATAGTTGCCAAAAGATCTATGGATTGAAATTTATATAAGTCAGTAATAACGATGA
TAGCAGTATCAAAGTCAAAAAATTCAAAGTAATAATAATTAAAACAAAAAAAAAACAAAA
AATTTTCACATAACTAAACTCCCTTAAAAAATTTTTTTTC
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