PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C3_01440C_B
Promoter Sequence

Consensus
CGGNNNNCGGAN: -32 -31 -30 -29 -28 -27 -26 -25 -24 -23 -22 -21 -19
>C3_01440C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GAAATTTTAGATCAATTGAATCAAACATTTATTACCAATAATAATGATGATGATGATGAT
GATGAAGAAACAAATCATCAAGGACCATTCAAATATCCACTGAATTTATTAATTGAACCA
AATAATTATATCAATGTTTATAATAAGATTTTAAGTTCCATTGATAAAACTTGTGTTTTC
AAACAAGATGTTGATCAACAAGTGATTGAATCAATAATAAATTTGATTTATAAAATTGGT
AGTGATGATGAATATTTACGATTACAATATTTACAAACATTATGTTTGTTGATTAATAAA
TTCACTAATAATGCCGACTTCATTGAATCTAAATTGAAATTTTTAGAAAAAGTTGAAGAA
CAAGACTTCCCAATAACTAAAGAAGATTTTATATCATTTGAAATTTTTATATGGATATTA
AAGGGATTAATTGTTAAACTTGATAAATTAGGGATTAATTATTTAAATCAATTACTTGAA
TTATTTGTAATTACTGAAAACTATAAATTGAAACAATTAATTGGTAAATCATTACAAATT
TTATTTATTGATTTGAAAATTTTCACTAATGAGAGAATTACTACTACTGACAACACCAAT
AGTACTAATGGTGGTATTAAATCTTCTAGTCAATTGATTTCAAAAGTTAAAAATTTACAA
GTCAAATCATTATATAAACAACATATATTTGTCATTATTTTACCATATTTAATTAATGAT
TCTAATGAAAATTTCACTAATGATGCTGATTTCAATTTAAAATTCAATTCATTATCATTG
ATTATTGAAAATTTATCAATTAATGGTAATAATAATATTTTAATTAATCAATTATCAGAA
ATTCTACCAATTACATTATATTCATTAATTAAAATTCCAATAGATGCTAATTCAAATTCA
AATTTATTGGCATCATTGATAATATTGAATATTATTTTAAAAGAAGAAGAAAAAGAAAAA
GAAAAAGANNNNNNNNNNNNan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nn>GAAAAAGAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CGGNNNNCGGAN: -9 -10 -11 -12 -13 -14 -15 -16 -17 -18 -19 -20 -21
>C3_01440C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
CTTTAAAATCTAGTTAACTTAGTTTGTAAATAATGGTTATTATTACTACTACTACTACTA
CTACTTCTTTGTTTAGTAGTTCCTGGTAAGTTTATAGGTGACTTAAATAATTAACTTGGT
TTATTAATATAGTTACAAATATTATTCTAAAATTCAAGGTAACTATTTTGAACACAAAAG
TTTGTTCTACAACTAGTTGTTCACTAACTTAGTTATTATTTAAACTAAATATTTTAACCA
TCACTACTACTTATAAATGCTAATGTTATAAATGTTTGTAATACAAACAACTAATTATTT
AAGTGATTATTACGGCTGAAGTAACTTAGATTTAACTTTAAAAATCTTTTTCAACTTCTT
GTTCTGAAGGGTTATTGATTTCTTCTAAAATATAGTAAACTTTAAAAATATACCTATAAT
TTCCCTAATTAACAATTTGAACTATTTAATCCCTAATTAATAAATTTAGTTAATGAACTT
AATAAACATTAATGACTTTTGATATTTAACTTTGTTAATTAACCATTTAGTAATGTTTAA
AATAAATAACTAAACTTTTAAAAGTGATTACTCTCTTAATGATGATGACTGTTGTGGTTA
TCATGATTACCACCATAATTTAGAAGATCAGTTAACTAAAGTTTTCAATTTTTAAATGTT
CAGTTTAGTAATATATTTGTTGTATATAAACAGTAATAAAATGGTATAAATTAATTACTA
AGATTACTTTTAAAGTGATTACTACGACTAAAGTTAAATTTTAAGTTAAGTAATAGTAAC
TAATAACTTTTAAATAGTTAATTACCATTATTATTATAAAATTAATTAGTTAATAGTCTT
TAAGATGGTTAATGTAATATAAGTAATTAATTTTAAGGTTATCTACGATTAAGTTTAAGT
TTAAATAACCGTAGTAACTATTATAACTTATAATAAAATTTTCTTCTTCTTTTTCTTTTT
CTTTTTCTNNNNNNNNNNNan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>Nan>NCTTTTTCTTT
w3c xhtml validator w3c css validator