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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name JIP5
Promoter Sequence

Consensus
CRCAAA: -77
>JIP5    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TATTGGCATTACATTTTTCATTAATTACTTCTATTTGAGAATCCAAATCCAATTTTCTTA
AAATATCAAGCATTAATAAAGTCCCATCTTTAACTCCACGTAAAGTTCTTGGTCCCTTTT
CAAAAAGAATCGATTCATTGGTATTATTGACGTGTAATTTAGGTGATGACATCCAACCAC
CTGGTCTTTTCAGTTTTTCAAATATTGTGAATTGTAAATCTGGGCGTAGTTTAGAAAGGA
AATATGTGAATGTTAATCCCAGAATTCCTGCTCCTAAAACTGCCACTCTTGCATTTTGAG
GTAGAGTTGTCAAAGTCATTAATTGATTGAAATAGGGAGGTGGATAGTGATTGTAGGAGA
AAAAAAGCTAGGAGGATGAAAAATTATGGATATATAAAACGTTATATATAAATGTAGAAA
TCCCAACAAATAATGTAAATTGCAAATCAACGTTGTCTGATTGGACTCTCGAGAGTTGAA
AAAAATAAAAATGTGCTGATGTTTTTGTTTTGTTATTGTATCGTTCCCTGTCAAAATCGT
TTAGTTTTTTTGCGATTTACCCAAAACTGTTTTGACTTACATTTAGTTTTATATGTATAT
GTCTCTTTTATCGATTTTATATTGAGCCTCAAGCTATACATTATCAAGTGTTGAATTTGT
CAGGCAAATTGTAAATCCTGGCAATACAATTGAAAATGTAATGTCAAGTTCTAAAACAGA
ATTATAGATGCTAACCCTAGAGCGATTGGCGTTTTATACTATCTTAGCAACTTTTTCCAG
TCATTACCATGATAATGTTAGTTTTACTTGATAGCAAAATTAAATACAGTCATTAACAAG
TATAATCTTACTCTAGAACACTTTTGTAATGTGTGGATTGGTAGCACCCGTTGGTGATTG
CTTTCCAGTAATTTAGCGCTCATCGCAAAGCATCGAATAAAAAATTAATCAAAAATGAAA
AAATTCAAGCTTAATAAATCATTAATTGTACTATACCGCC
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CRCAAA: -446
>JIP5	Upstream Sequence Complementary Strand
ATAACCGTAATGTAAAAAGTAATTAATGAAGATAAACTCTTAGGTTTAGGTTAAAAGAAT
TTTATAGTTCGTAATTATTTCAGGGTAGAAATTGAGGTGCATTTCAAGAACCAGGGAAAA
GTTTTTCTTAGCTAAGTAACCATAATAACTGCACATTAAATCCACTACTGTAGGTTGGTG
GACCAGAAAAGTCAAAAAGTTTATAACACTTAACATTTAGACCCGCATCAAATCTTTCCT
TTATACACTTACAATTAGGGTCTTAAGGACGAGGATTTTGACGGTGAGAACGTAAAACTC
CATCTCAACAGTTTCAGTAATTAACTAACTTTATCCCTCCACCTATCACTAACATCCTCT
TTTTTTCGATCCTCCTACTTTTTAATACCTATATATTTTGCAATATATATTTACATCTTT
AGGGTTGTTTATTACATTTAACGTTTAGTTGCAACAGACTAACCTGAGAGCTCTCAACTT
TTTTTATTTTTACACGACTACAAAAACAAAACAATAACATAGCAAGGGACAGTTTTAGCA
AATCAAAAAAACGCTAAATGGGTTTTGACAAAACTGAATGTAAATCAAAATATACATATA
CAGAGAAAATAGCTAAAATATAACTCGGAGTTCGATATGTAATAGTTCACAACTTAAACA
GTCCGTTTAACATTTAGGACCGTTATGTTAACTTTTACATTACAGTTCAAGATTTTGTCT
TAATATCTACGATTGGGATCTCGCTAACCGCAAAATATGATAGAATCGTTGAAAAAGGTC
AGTAATGGTACTATTACAATCAAAATGAACTATCGTTTTAATTTATGTCAGTAATTGTTC
ATATTAGAATGAGATCTTGTGAAAACATTACACACCTAACCATCGTGGGCAACCACTAAC
GAAAGGTCATTAAATCGCGAGTAGCGTTTCGTAGCTTATTTTTTAATTAGTTTTTACTTT
TTTAAGTTCGAATTATTTAGTAATTAACATGATATGGCGG
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