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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name RFC3
Promoter Sequence

Consensus
CRCAAA: -159
>RFC3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AACAATTTATGGTTAACAATTTAAATGCTAGTACAAAATATATTGCTTATATTGTTATGG
ATTTTGAAGGGGTAGAATATGGTGGTGCTGTACTTCGACCGTTTGAATTTGAAACTATGG
ATGGAACTGCTTGTGAATTGATTTATGATTTGGAATTTTGTGATCAAGTGGCTTATAGTG
TTCCTGCCATTGGTAATTCCCTGTTATTAGCTTCAAGTATTGCTGGTGCTGATAATAAAA
CATTAACAAAAAAATTATATGATGATTATGCTAAATCATTATATACAAATTTTCTGAAAG
GTTTACAACAAATTGCTTGTGATACGGTCCCTGAAGCCATCTATTCAAATTTGAAAAGTT
GTCAAGATTGTGCTCAAAGTTATAAAAATTGGTTATGTGCCGTTACTATACCTCGATGTT
CTACAAAAAATTTCACGGGTTATATCCATCGAAATGAAACAAATCAAAGAAATGAATTTT
TAGCTGATGTTATTCAACCAAATCAAGATTATTATGAAGTATTACCTTGTGTTAATGTTT
GTCAAGCAATTGTAAGAGATTGTCCAGCAAATTTTGGATTTTTATGTCCCACGAAAAATG
ATTCAATTAAATTGAGTTATTATTGGGATGTTCATGTATCTGATCAATGGCCAAGTTGTA
ATTATCTTGGACCATTAAAAAGTAGTAAAAGTGGTGCCATAAAATTGATAATCAATTGGA
CAATCGTTGTGGTATCCTTTACTTTAATGGTTGTCATATAGTTCATTTAAATAGAATATA
ATAGATAGAAAAGAAGAAGAAGAATCGATTGATTGATTGTTTATGTTCTTGGGGACACGC
CCACAAAATATTTTGTAGTTGGCCAAAAAATAAAAAAAAAAAATTAATTCAATTCATTTG
ACGCGTTGAGTGAAAAGGAAGATTTCTATCACTTCAATCATCATTCATCATAACACCAAG
AAGTTAAAGTTAAACATCACACACACACACACACACACCA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CRCAAA: -838
>RFC3	Upstream Sequence Complementary Strand
TTGTTAAATACCAATTGTTAAATTTACGATCATGTTTTATATAACGAATATAACAATACC
TAAAACTTCCCCATCTTATACCACCACGACATGAAGCTGGCAAACTTAAACTTTGATACC
TACCTTGACGAACACTTAACTAAATACTAAACCTTAAAACACTAGTTCACCGAATATCAC
AAGGACGGTAACCATTAAGGGACAATAATCGAAGTTCATAACGACCACGACTATTATTTT
GTAATTGTTTTTTTAATATACTACTAATACGATTTAGTAATATATGTTTAAAAGACTTTC
CAAATGTTGTTTAACGAACACTATGCCAGGGACTTCGGTAGATAAGTTTAAACTTTTCAA
CAGTTCTAACACGAGTTTCAATATTTTTAACCAATACACGGCAATGATATGGAGCTACAA
GATGTTTTTTAAAGTGCCCAATATAGGTAGCTTTACTTTGTTTAGTTTCTTTACTTAAAA
ATCGACTACAATAAGTTGGTTTAGTTCTAATAATACTTCATAATGGAACACAATTACAAA
CAGTTCGTTAACATTCTCTAACAGGTCGTTTAAAACCTAAAAATACAGGGTGCTTTTTAC
TAAGTTAATTTAACTCAATAATAACCCTACAAGTACATAGACTAGTTACCGGTTCAACAT
TAATAGAACCTGGTAATTTTTCATCATTTTCACCACGGTATTTTAACTATTAGTTAACCT
GTTAGCAACACCATAGGAAATGAAATTACCAACAGTATATCAAGTAAATTTATCTTATAT
TATCTATCTTTTCTTCTTCTTCTTAGCTAACTAACTAACAAATACAAGAACCCCTGTGCG
GGTGTTTTATAAAACATCAACCGGTTTTTTATTTTTTTTTTTTAATTAAGTTAAGTAAAC
TGCGCAACTCACTTTTCCTTCTAAAGATAGTGAAGTTAGTAGTAAGTAGTATTGTGGTTC
TTCAATTTCAATTTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGT
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