C.albicans - PathoYeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

RTA3

Promoter Sequence

Consensus
CRCAAA: -326

>RTA3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TGAAATGACTTCATAATGCTCATTAAACAATGAATCTGAAATAAATACACTTATCCTACA
AGATCCAAAAATGTGTGGCCAAAGATTTTATTATTATTGTTTTACATCTTCTCTTTGTGT
GTGGTAGCGGGATTAATCTTACACTTTGTGTGGAAAATGGGTGCAAGAGAAAAGAAAAGG
TTAACACGGATAATGTTTTTGCGGAAATCTTTTTTGAATGCGGAGATAAGCTCAGTCGAA
TTAATCAATCCTTCAATTAAAAAAGATAAGCTTGGTGAAGGCTATGGTATAGTTCTGTAT
ATCCCTGATAACTAATTTTAAAATTCATTTCATTCAGAAATAAGTTATTCCTAATCTGCT
AAAAAAAAGAAACATGGTTACTCTTAGAATAGTTATAGATCCACACGGAACTCGGAAATT
ATGCACTGAATGTAATTTTGTAATCAGCATTTAGAGAGTGATTTGTTAAAATATCTTACA
ACCCATGTGTGTTATCACTAAATTATATTTAGATATTTTTAGAAGAAAGCTTGAATTTCG
AAAATAAAATTGGATTTCCTGGTGGTGGGGAAAAGATTATGATTATTATTGGCGTGTCCC
TGCACTAATTATAACCAAACGGAAGGATAAAATTGAAATGTGGTTGCAGCAGCAACAGTA
GTTCCGATTCTAAACACAAAATTGAAATATCTATTGTTTTCAATATTTTTTTTTAGAATC
TCATCATCATTGTACATCAGTTTAGATAGCAAAGATAAAGAAAAAAAAATTTTAACACCC
GGTTAACCAAAATCTCATTGGTCCGGATATTCCAGTTAGTAAATAGCTGGAAATATAAAA
AAATACTACCCGTTATCCTATTCCTGCTAGTTTTATTTGCCTCAAATGGTTTATATAACT
ATGTAATGAGCTCAAATTTATAATTTTTTTGTCATCTTGTTCTATTTTTTTTTTTTTTCA
TTCTGTCTTTCCTTAATAATATTGAAAAAAAGACAGGCTC

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
CRCAAA: -797 -850 -881

>RTA3	Upstream Sequence Complementary Strand
ACTTTACTGAAGTATTACGAGTAATTTGTTACTTAGACTTTATTTATGTGAATAGGATGT
TCTAGGTTTTTACACACCGGTTTCTAAAATAATAATAACAAAATGTAGAAGAGAAACACA
CACCATCGCCCTAATTAGAATGTGAAACACACCTTTTACCCACGTTCTCTTTTCTTTTCC
AATTGTGCCTATTACAAAAACGCCTTTAGAAAAAACTTACGCCTCTATTCGAGTCAGCTT
AATTAGTTAGGAAGTTAATTTTTTCTATTCGAACCACTTCCGATACCATATCAAGACATA
TAGGGACTATTGATTAAAATTTTAAGTAAAGTAAGTCTTTATTCAATAAGGATTAGACGA
TTTTTTTTCTTTGTACCAATGAGAATCTTATCAATATCTAGGTGTGCCTTGAGCCTTTAA
TACGTGACTTACATTAAAACATTAGTCGTAAATCTCTCACTAAACAATTTTATAGAATGT
TGGGTACACACAATAGTGATTTAATATAAATCTATAAAAATCTTCTTTCGAACTTAAAGC
TTTTATTTTAACCTAAAGGACCACCACCCCTTTTCTAATACTAATAATAACCGCACAGGG
ACGTGATTAATATTGGTTTGCCTTCCTATTTTAACTTTACACCAACGTCGTCGTTGTCAT
CAAGGCTAAGATTTGTGTTTTAACTTTATAGATAACAAAAGTTATAAAAAAAAATCTTAG
AGTAGTAGTAACATGTAGTCAAATCTATCGTTTCTATTTCTTTTTTTTTAAAATTGTGGG
CCAATTGGTTTTAGAGTAACCAGGCCTATAAGGTCAATCATTTATCGACCTTTATATTTT
TTTATGATGGGCAATAGGATAAGGACGATCAAAATAAACGGAGTTTACCAAATATATTGA
TACATTACTCGAGTTTAAATATTAAAAAAACAGTAGAACAAGATAAAAAAAAAAAAAAGT
AAGACAGAAAGGAATTATTATAACTTTTTTTCTGTCCGAG