PathoYeastract
C.albicans
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_12820C_A
Promoter Sequence

Consensus
DHGGWAATMNNWYCCV: -387 -386 -385 -384 -383 -382 -381 -380 -379
>C1_12820C_A    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TCTTCTTCTTTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTTGTCATACCAATTGATTCAAGATTTACGA
TTAATGGTACCTAAATGGATTGGTCAACCAATATTATTTAATAAACATCCAATAAAGGAA
TCCCCCAAAATAACATTTCAATTAACCGAAGTTGATTATAATCAATTACCGTCATATTTA
AAAATTGGTGGGAAATCAAATAAAAAAATTAAAAAATTACCTGAATTAGAATCATCAATT
AAATTAACATCTCATAATATGTTAAGAGTACTGAAAATTTTAAATTATTTAGTGGAAAAA
TTTGCTAATACTACTAAAGAAATGAAAGATAAAAATTTAATTCCCAGTGATTGGTTAGTA
TTACAATGTAAAGGTCAAGAATTAAATAATGATTTAACTTTACAAACTATAAAAACCAAG
ATTTGGAAAAGTAGTAGTGATATTGAATTACAATTTAGACGTAAATATGATAAATAAAAT
AAATAAACCCCCAAGAAGTTATTAGTTGTTTGACATATATATATATATATATATATATAT
ATAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGACCAAAACTGTAATAGCATGCAGAATAA
GTTGTTATTAAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTAGAATCAAGTGTAATTTTTG
CGACATTTCACGACATGATATGAAAGTTAGACATTTTGGTTCTTCCTTTTTTTTTTCCAT
CACATCGAAAAGAAAAAAAAATGAGAAAAAAAAACATCAAAATTGAACTTCTAAACCAAC
ATCATCGACATTATCATCGACACATAACTTAACTTAACTTAACTAATCAACAATCATCAA
TATTCTTAAAGAATCATCACTGATCAACTTACAACATAAACAGGATTTTTTTATTTTTTT
TTTCCACTATATTTGATAAGTTCACATCTTATTTTTTTTTTTTGTTTGCATTCATCACAT
CTGTTTAATATAAGTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTCAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
DHGGWAATMNNWYCCV: -362 -364 -365 -366 -367 -368 -369
>C1_12820C_A	Upstream Sequence Complementary Strand
AGAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAACAGTATGGTTAACTAAGTTCTAAATGCT
AATTACCATGGATTTACCTAACCAGTTGGTTATAATAAATTATTTGTAGGTTATTTCCTT
AGGGGGTTTTATTGTAAAGTTAATTGGCTTCAACTAATATTAGTTAATGGCAGTATAAAT
TTTTAACCACCCTTTAGTTTATTTTTTTAATTTTTTAATGGACTTAATCTTAGTAGTTAA
TTTAATTGTAGAGTATTATACAATTCTCATGACTTTTAAAATTTAATAAATCACCTTTTT
AAACGATTATGATGATTTCTTTACTTTCTATTTTTAAATTAAGGGTCACTAACCAATCAT
AATGTTACATTTCCAGTTCTTAATTTATTACTAAATTGAAATGTTTGATATTTTTGGTTC
TAAACCTTTTCATCATCACTATAACTTAATGTTAAATCTGCATTTATACTATTTATTTTA
TTTATTTGGGGGTTCTTCAATAATCAACAAACTGTATATATATATATATATATATATATA
TATCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGGTTTTGACATTATCGTACGTCTTATT
CAACAATAATTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN</span>NCACATCTTAGTTCACATTAAAAAC
GCTGTAAAGTGCTGTACTATACTTTCAATCTGTAAAACCAAGAAGGAAAAAAAAAAGGTA
GTGTAGCTTTTCTTTTTTTTTACTCTTTTTTTTTGTAGTTTTAACTTGAAGATTTGGTTG
TAGTAGCTGTAATAGTAGCTGTGTATTGAATTGAATTGAATTGATTAGTTGTTAGTAGTT
ATAAGAATTTCTTAGTAGTGACTAGTTGAATGTTGTATTTGTCCTAAAAAAATAAAAAAA
AAAGGTGATATAAACTATTCAAGTGTAGAATAAAAAAAAAAAACAAACGTAAGTAGTGTA
GACAAATTATATTCAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTT
w3c xhtml validator w3c css validator