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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name C1_03070C_B
Promoter Sequence

Consensus
GCTCAT: -274 -273 -272 -271 -270 -269 -268 -267 -266 -265 -264 -263 -262 -261 -260 -259 -258 -257 -256 -255 -254 -253 -252 -251 
>C1_03070C_B    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
CATTATTTCTTGTACTAACTCATTTATTAGAGTCGCCTTAAAAATTGGTTTAATTGGGGA
TTCCCAGATTGGCAAGACATCACTAATGGTGAAGTATGTGGAAGGTTCATTTGACGAAGA
CTATATTCAAACATTAGGGGTTAACTTTATGGATAAAAAGATACAAATTAGAAACACAAC
TATAACGTTCTCGATATGGGATTTAGGAGGACAAAAGGAGTTTATCAATATGCTACCATT
GGTCTCAAATGATGCAGTGGCAATATTATTCATGTTTGATCTAACAAGAAAGTCTACGCT
AAATTCAATAAAGGAATGGTACAGACAGGTGAGAGGATTCAATAAGACGGCAATTCCCTT
TTTAGTGGGGACGAAGTATGATCAGTTTATTGATTTATCATTTCAAGATCAAATAGAGAT
TACACAACAAGCAAAGAAATTCGGAAGTGCGATGAAAGCTCCAGTCATATTTTGTTCAAC
TAGCCATTCTATTAACGTGCAAAAAATCTTCAAAATTATATTATCTAAAGCGTTTGACTT
AAAGTTAAACCTTGATGAAATTGTTAACGTGGGGGAACCCATATTGATATATAAGTAGTT
GGTGTAAAAAGCCACGTTCAAATTAAGTTCCATTCTTTAAACAATTCAATAGCTATTTAT
TACATAACTAGACATAATACGCTTATCATTGTTTATTATTATTATTATTATTATTATTAT
TATTATNNNNNNspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NGTATTATTATTATTATTATTATTAT
TATTATTTTTACTATGTAGTTTTATTAATGTTATTATGAAGTTTTAATCTTACAAATAAT
TCAATTCTGTGCGAAGTATAATTAACAGTGGTAGAATGCCAAAAACAGAACCAAAAAAAA
AACAACGCAGACAACTTGGTTTGATTCAGATTAACAAACAAAACCGTGCCAGTTTTTTCT
GATCGGTACAATCTCAACACAACCTTAGTTACATCCAAAT
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
GCTCAT: -245 -246 -247 -248 -249 -250 -251 -252 -253 -254 -255 -256 -257 -258 -259 -260 -261 -262 -263 -264 -265 -266 -267 -268 -270 
>C1_03070C_B	Upstream Sequence Complementary Strand
GTAATAAAGAACATGATTGAGTAAATAATCTCAGCGGAATTTTTAACCAAATTAACCCCT
AAGGGTCTAACCGTTCTGTAGTGATTACCACTTCATACACCTTCCAAGTAAACTGCTTCT
GATATAAGTTTGTAATCCCCAATTGAAATACCTATTTTTCTATGTTTAATCTTTGTGTTG
ATATTGCAAGAGCTATACCCTAAATCCTCCTGTTTTCCTCAAATAGTTATACGATGGTAA
CCAGAGTTTACTACGTCACCGTTATAATAAGTACAAACTAGATTGTTCTTTCAGATGCGA
TTTAAGTTATTTCCTTACCATGTCTGTCCACTCTCCTAAGTTATTCTGCCGTTAAGGGAA
AAATCACCCCTGCTTCATACTAGTCAAATAACTAAATAGTAAAGTTCTAGTTTATCTCTA
ATGTGTTGTTCGTTTCTTTAAGCCTTCACGCTACTTTCGAGGTCAGTATAAAACAAGTTG
ATCGGTAAGATAATTGCACGTTTTTTAGAAGTTTTAATATAATAGATTTCGCAAACTGAA
TTTCAATTTGGAACTACTTTAACAATTGCACCCCCTTGGGTATAACTATATATTCATCAA
CCACATTTTTCGGTGCAAGTTTAATTCAAGGTAAGAAATTTGTTAAGTTATCGATAAATA
ATGTATTGATCTGTATTATGCGAATAGTAACAAATAATAATAATAATAATAATAATAATA
ATAATANNNNpan>NNspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>Nspan>NCATAATAATAATAATAATAATAATA
ATAATAAAAATGATACATCAAAATAATTACAATAATACTTCAAAATTAGAATGTTTATTA
AGTTAAGACACGCTTCATATTAATTGTCACCATCTTACGGTTTTTGTCTTGGTTTTTTTT
TTGTTGCGTCTGTTGAACCAAACTAAGTCTAATTGTTTGTTTTGGCACGGTCAAAAAAGA
CTAGCCATGTTAGAGTTGTGTTGGAATCAATGTAGGTTTA
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